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HOXB4、PRDM16及HOXA9在急性髓系白血病中的表达及临床意义
目的:检测HOXB4、PRDM16及HOXA9在急性髓系白血病(AML)患者骨髓中的表达水平,探讨其临床意义.方法:采用实时荧光定量PCR方法,检测40例初治或复发AML患者、9例完全缓解患者和19例对照者(非恶性血液病患者及健康供者)骨髓细胞HOXB4、PRDM16及HOXA9 mRNA表达水平,分析其与疾病特征、临床疗效之间关系.结果:初治或复发AML患者骨髓细胞中HOXB4、PRDM16和HOXA9表达水平均明显高于非恶性血液病患者(P＜0.05);初治或复发AML患者HOXB4基因表达水平与骨髓白血病细胞比例成正相关(r=0.39),HOXB4、PRDM16和HOXA9基因的表达水平两两之间具有相关性;AML不同病程阶段(初诊、复发、缓解)HOXB4、PRDM16基因表达水平差异具有统计学意义;按预后危险度分层将初治及复发AML患者分为高、中、低危3组,3组之间HOXB4、PRDM16、HOXA9表达水平的差异无统计学意义;经2个疗程正规化疗,缓解组(CR/PR)患者治疗前的3个基因表达水平均低于未缓解组治疗前水平(P＜0.05);上述3个基因低表达组缓解率均高于高表达组(P＜0.05).结论:HOXB4、PRDM16、HOXA9基因表达水平与AML患者肿瘤负荷、疗效和预后存在一定的关系.在初治和复发的AML患者骨髓细胞高表达,缓解后其表达水平下降,表达高者化疗效果差,缓解率低.
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PRDM16基因4个SNPs位点与血脂异常的关系及其交互作用研究
目的 研究PRDM16基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNPs)及其交互作用与血脂异常的关系.方法 采用snapshot或连接酶检测技术检测528例受试者PRDM16基因rs2651899、rs2236518、rs870171、rs2282198四个位点的基因型.分析基因型、等位基因在病例组和对照组之间的差异;采用SHE-sis在线软件进行连锁不平衡分析,利用MDR软件分析SNPs位点与性别、年龄、BMI之间的交互作用.结果 各SNP位点满足哈温平衡.PRDM16基因rs2651899位点等位基因A在HDL-C异常组和对照组的分布差异有统计学意义[OR(95% CI)=1.32(1.02~1.71),P=0.033].rs870171的A/C基因型频率在LDL-C异常组和对照组之间的分布差异有统计学意义[OR(95% CI)=1.97(1.01~3.86),P=0.037].rs2236518位点与性别之间可能存在交互作用,是HDL-C降低的危险因素[模型Ⅱ:OR(95% CI)=1.958(1.366~2.809),P<0.01].rs2651899、rs2236518、rs870171、rs2282198四位点之间可能存在交互作用,是HDL-C降低的危险因素[模型Ⅳ:OR(95% CI)=3.991(2.707~5.884),P<0.01].rs870171、rs2282198与年龄之间可能存在交互作用,是LDL-C升高的危险因素[模型Ⅶ:OR(95% CI)=11.544(4.109~32.430),P<0.01].结论 PRDM16基因rs2651899位点的等位基因A可能是低HDL-C的危险因素,在共显性遗传模式下,PRDM16基因rs870171位点的A/C基因型可能是高LDL-C的危险因素.此外SNPs位点与性别、年龄之间可能存在交互作用.
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PRDM16基因rs2651899、rs2236518、rs2282198位点多态性与超重肥胖的关系
目的:研究PRDM16基因多态性及其单倍体型与超重肥胖发生风险的关系.方法:采用snapshot或连接酶检测技术检测275例超重肥胖者与253例正常体重者PRDM16基因rs2651899、rss2236518、rs2282198位点的基因型.利用SHEsis在线软件构建单倍体型,分析其与超重肥胖的关系.结果:PRDM16基因rs2651899位点等位基因A在超重肥胖组和正常体重组的分布差异有统计学意义[OR(95％ CI)=1.306(1.021 ～1.670),P=0.033].单倍体型AAT、GAC、GCT在超重肥胖组和正常体重组的分布差异有统计学意义[AAT:OR(95％ CI)=1.554(1.118～2.162),P=0.008;GAC:OR(95％ CI)=0.623(0.394～ 0.984),P=0.041;GCT:OR(95％ CI)=0.682(0.481～0.967),P=0.031].结论:PRDM16基因rs2651899位点的等位基因A以及单倍体型AAT可能是超重肥胖发生的危险因素,单倍体型GAC、GCT可能是超重肥胖发生的保护因素.
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PRDM16基因变异与新疆维吾尔族人原发性高血压的关联研究
目的 探讨PRDM16基因功能区变异与新疆维吾尔族人原发性高血压的相关性.方法 采用以流行病学调查为基础的病例-对照研究,在前期新疆和田地区流行病学调查建立的数据库中随机选取1299位维吾尔族人(包括480例高血压患者和819名对照)作为研究对象.首先在小样本(n=48)维吾尔族高血压患者中测序筛查PRDM16基因功能区的变异位点,并从中选取代表性变异位点应用TaqMan-PCR技术在大样本人群中进行基因型鉴定及病例-对照关联研究.结果 在PRDM16基因功能区共筛查出23个变异位点.选取的PRDM16基因的4个代表性变异位点(rs2236518、rs2282198、rs2493292及rs870171)的基因型及等位基因频率分布在高血压组与正常血压组中的差异均无统计学意义(P＞0.05).Logistic回归分析发现4个位点不是高血压病的危险因素(P＞0.05).rs2236518、rs2282198、rs2493292及rs870171不同基因型间收缩压、舒张压水平差异无统计学意义(P＞0.05).单倍型基因频率分布在高血压组与对照组中的差异无统计学意义(P＞0.05).结论 PRDM16基因变异可能与新疆维吾尔族原发性高血压不相关.
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PRDM16基因及母亲孕期环境暴露因素与非综合征型唇腭裂相关性研究
目的 探究PRDM16基因rs7525173、rs2236518、rs2493264及母亲孕早期吸烟饮酒与非综合征型唇腭裂(NSCL/P)发生的相关性.方法 收集157个患者-父母核心家系,采用连接酶检测反应(LDR)和直接测序两种方法进行基因分型,使用传递不平衡检验(TDT)、连锁不平衡检验(LD)等对数据进行统计分析.收集1710例唇腭裂患者及956例健康新生儿,填写《唇腭裂患者流行病学调查问卷》,对孕期父母吸烟饮酒暴露因素进行分析.结果 rs2236518位点C等位基因在腭裂组中存在过传递(P<0.05),其余位点在各组中均无明显统计学意义.母亲吸烟、母亲被动吸烟及母亲饮酒3个因素存在统计学差异(P<0.05).结论 PRDM16基因rs2236518多态性与NSCL/P存在相关性,母亲吸烟、母亲被动吸烟及母亲饮酒与唇腭裂的发生存在密切联系.
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二代测序技术筛查肥厚型心肌病伴房颤家系致病基因研究
目的 对1个肥厚型心肌病伴房颤先证者及其家系成员进行致病基因筛查研究.方法 收集先证者及其家系成员外周血,提取基因组DNA,应用二代测序法对先证者进行心血管疾病候选基因突变检测.发现可疑致病位点后,进一步通过Sanger测序法在家系内其他成员以及100个健康个体者中进行验证.用PolyPhen-2等生物信息学软件对新突变位点进行致病突变分析.家系资料收集包括临床表现、体格检查、心电图、超声心动图.结果 先证者及家系内多个成员均携带PRDM16基因c.3124G>A(p.G1042R)杂合突变,但先证者父母及100例健康个体中并未发现该突变,因此,该突变可能为新生突变(生殖细胞嵌合).生物信息学分析结果显示PRDM16基因c.3124G>A(p.G1042R)杂合突变位于保守位点,可能影响蛋白功能,为致病性突变.结论 本研究发现1个肥厚型心肌病伴房颤的家系中存在PRDM16基因c.3124G>A(p.G1042R)杂合突变,该突变所在区域在不同种系间高度保守,可能是该肥厚型心肌病家系的致病基因突变位点.
