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2014-2017年广州市禽类市场外环境H7N9禽流感病毒监测与遗传进化分析

曹蓝;李魁彪;刘艳慧;陈艺韵;陆剑云;鲁恩洁;刘文辉;夏丹;李铁钢;王鸣;狄飚;杨智聪

摘要: 目的 对广州市禽类市场外环境H7N9禽流感病毒流行情况和基因进化特点进行监测分析,为人感染H7N9禽流感防控提供研究数据.方法 采集2014-2017年广州市禽类市场外环境标本,采用实时荧光定量RT-PCR方法检测H7N9禽流感病毒并绘制血凝素(HA)基因遗传进化树,分析H7N9禽流感病毒流行特点和基因进化特点.结果 2014-2017年累计检测外环境标本28 252份,检出H7N9阳性标本888份,阳性率为3.14%.检出率2015年低,2014年高,分别为1.60%和3.89%.2-5月出现H7N9禽流感病毒流行高峰,4月检出率高为13.00%.测序分析结果显示,HA基因核苷酸同源性为88.6%~100%,氨基酸同源性为92.0% ~ 100%.裂解位点分析发现,2017年外环境开始出现高致病性H7N9病毒.进化分析发现,HA基因呈现多进化分支特点.结论 2014-2017年广州市禽类市场外环境H7N9禽流感病毒持续存在且病毒变异较快,呈现基因多样性.2017年外环境已发现高致病性H7N9病毒,近年病毒HA基因归属于华南分支,呈现本土化,同时监测到来源于野鸟的另一独立分支的病毒存在,提示加强本地区野鸟H7N9禽流感病毒监测的必要性.

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