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长链非编码RNA在胃癌中的作用研究进展
长链非编码RNAs(lncRNAs)是长度大于200 nt的非编码RNAs,与胃癌的发生发展密切相关.lncRNAs异常表达可影响胃癌细胞的生物学过程,如HOTAIR、GHET1、DANCR、HULC和MEG3等可在表观遗传学、转录和转录后水平以多种机制调节胃癌的发生、发展、侵袭和转移.因此,lncRNAs有望成为胃癌诊断和治疗的新型生物标志物,对制定诊疗计划和预后判断具有潜在指导意义.
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低氧条件下人成骨细胞长链非编码RNA5'aHIF-1α的表达
目的 观察低氧条件下人成骨细胞HIF-1α反义转录物5′aHIF-1α的表达变化,探讨低氧对人成骨细胞分化影响的调控机制.方法 采用人成骨肉瘤细胞系(MG63),随机分为4组,分别在不同氧体积分数(10%、6%、3% 和1% O2)条件下培养72 h.用Trizol法提取总RNA,用实时荧光定量PCR法检测5′aHIF-1α表达;用Western blot法检测HIF-1α蛋白表达.结果 10% O2组MG63细胞5′aHIF-1α表达水平是对照组(6% O2)的2.06±0.07倍,3%和1% O2组MG63细胞5′aHIF-1α表达水平分别是对照组的0.63±0.08和0.43±0.03倍.10% O2组5′a HIF-1α蛋白表达水平明显降低,3%和1% O2组HIF-1α蛋白表达水平随氧体积分数降低而逐渐升高.结论 低氧条件下,长链非编码RNA-5′aHIF-1α可能在转录或转录后水平抑制MG63细胞HIF-1α的表达,但随着氧体积分数的降低,其抑制作用逐渐减弱.
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长链非编码RNA多态性与肿瘤相关性
中长链非编码RNA是长度大于200个的RNA一类转录本,自身缺乏编码蛋白质的能力,能在表观遗传学、转录水平和转录后水平调控基因表达但不具备编码蛋白质功能的基因转录产物位于细胞核或细胞质内RNA.证据表明发生变异的基因中包括LncRNA,导致LncRNA基因存在着广泛的基因多态性,而大多数LncRNA基因的多态性变化和肿瘤的产生、转移和预后相关.
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胃癌淋巴结转移相关长链非编码RNA的鉴定及验证
目的 对胃癌淋巴结转移相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)进行筛选和验证.方法 应用Agilent Array平台对3例胃癌阳性淋巴结和1例正常淋巴结行lncRNA芯片,聚类分析lncRNA和mRNA表达水平检测,筛选胃癌转移淋巴结中异常表达的lncRNA.随机选取15个高表达和15个低表达的lncRNAs,应用RT-PCR验证这些lncRNAs的表达水平.结果 与正常淋巴结相比,将胃癌转移淋巴结中表达变化6倍以上者确定为差异表达者,其中353个lncRNAs表达上调和464个lncRNAs下调,547个mRNAs上调和562个mRNAs下调.RT-PCR实验结果显示:与正常淋巴结相比,lncRNA OR3A4、LOC84740、FCGR1C和C21orf96在胃癌阳性淋巴结中表达上调,lncRNA MSTO2P、LOC344595、TUG1,TYW3和KRT8P10在胃癌阳性淋巴结中表达下调.结论 lncRNAs在胃癌淋巴结转移中存在异常表达.
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miR-132-3p靶向的重力敏感长链非编码RNAs的筛选及调控探讨
目的 筛选miR-132-3p靶向的具有重力敏感性的长链非编码RNAs(lncRNAs),并初步探讨其在诱导分化过程中与miR-132-3p表达的相关性以及miR-132-3p对其的调控作用.方法 通过生物信息学预测方法,找出与miR-132-3p有结合位点的6条lncRNAs;利用2D回转器模拟失重条件培养小鼠前成骨细胞系MC3T3-E1细胞24 h、48 h、72h;利用成骨诱导液培养MC3T3-E1细胞7d;向MC3T3-E1细胞中转染miR-132-3p Mimic和Inhibitor;采用qRT-PCR方法检测lncRNAs的表达变化.结果 与对照组相比,模拟失重处理48 h后有3条lncRNAs表达下调,且在模拟失重处理72 h内呈现稳定下调趋势(P均＜0.05);与对照组相比,诱导分化后miR-132-3p表达下调,而3条重力敏感的lncRNAs均表达上调(P均＜0.05);转染miR-132-3p Mimic和Inhibitor后,在3条重力敏感的lncRNAs中,NONMMUT010777出现相应的表达下调或上调(P均＜0.01),而NONMMUT016978和NONMMUT027831未出现明显表达变化.结论 筛选出了miR-132-3p靶向的重力敏感lncRNA NONMMUT010777、NONMMUT016978和NONMMUT-027831,证实其在诱导MC3T3-E1细胞分化过程中与miR-132-3p的表达呈负相关,且miR-132-3p可调控lncRNA NONMMUT010777的表达.
关键词： 模拟失重 MC3T3-El细胞 成骨分化 长链非编码RNAs -
长链非编码RNAH19在甲状腺癌中的表达及预后预测的研究
目的 探讨长链非编码RNA H19(lncRNA H19)在甲状腺癌中的表达情况及其与临床病理特征和预后的相关性,寻找影响甲状腺癌治疗及预后的新靶点.方法 选取2009年1月～2012年1月从西安交大第二附属医院搜集的131例甲状腺癌组织和癌旁组织为病例组,另外同期选取122例甲状腺良性肿瘤组织作为对照组.采用实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)方法检测lncRNA H19的表达情况.之后进行5年跟踪随访.通过受试者工作特征(ROC)曲线分析评估lncRNA H19对甲状腺癌的诊断价值.应用Kaplan-Meier方法计算5年累积生存率,预后相关单因素分析采用Log-rank检验,多因素分析采用Cox回归模型.结果 与甲状腺良性肿瘤组织及癌旁组织比较,甲状腺癌组织中lncRNA H19表达升高(P＜0.05).lncRNA H19诊断甲状腺癌ROC曲线下面积(AUC)为0.801,诊断阈值3.58,敏感度和特异度分别为72.5％和75.4％,约登指数0.479.肿瘤直径≥1 cm、TNMⅢ+Ⅳ期及有淋巴结转移的甲状腺癌组织中lnc RNA H19表达水平明显高于肿瘤直径＜1 cm、TNM Ⅰ+Ⅱ期及无淋巴结转移的甲状腺癌组织,差异均有统计学意义(P＜0.05).lncRNA H19高表达者5年生存率下降(28.44％).lncRNAH19表达水平、肿瘤直径、TNM分期和淋巴结转移是影响甲状腺癌预后的独立风险因素.结论 IncRNA H19在甲状腺癌组织中高表达,lncRNA H19表达水平上调与甲状腺癌预后差相关,提示其可能是甲状腺癌发生发展的分子调节机制之一,并可为甲状腺癌早期无创诊断及治疗靶点的寻找提供重要理论依据.
关键词： 甲状腺癌 长链非编码RNAs 长链非编码RNA H19 预后 -
LncRNAs与miRNAs在非梗阻性无精症中的研究进展
非梗阻性无精症(non-obstructive azoospermia,NOA)约占男性不育的10％～15％.然而,非染色体性NOA病因复杂,发病机制尚不清楚.精子生成过程受到转录因子、基因或信号通路的调控.其中长链非编码RNAs(lncRNAs)为长度大于200个核苷酸的调控性非编码RNA,通过转录、转录后修饰和表观遗传水平等多种机制调节基本的生化和细胞过程.微小RNAs(miRNAs)通过碱基互补配对的形式与mRNA结合,促使mRNA降解或阻碍其翻译,进而抑制目的蛋白的表达,在多种生物过程中发挥作用,包括发育、分化、细胞增殖和细胞凋亡.LncRNAs与miRNAs的异常表达可导致精子正常发育过程的紊乱.深入研究NOA相关的lncRNAs与miRNAs及其作用机制,有助于探讨NOA的病因和发病机制.
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长链非编码RNA NEAT1在肿瘤中的研究进展
长链非编码RNAs(lncRNAs)是一类长度超过200个核苷酸,不能编码蛋白质的RNA分子,研究表明其能在多个水平调控基因表达,从而广泛参与细胞内复杂的生物学过程.lncRNAs与多种恶性肿瘤关系密切,在不同肿瘤的发生发展中发挥致癌或抑癌作用.随着分子生物学技术的不断发展,越来越多的lncRNAs被人们所认知.NEAT1是近些年被发现的一个长链非编码RNA,除了在亚核体paraspeckles的结构形成及维持过程中有着重要作用外,研究人员还发现其可通过不同的信号通路在多个肿瘤中扮演重要角色.
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长链非编码RNA低表达或表达缺失与恶性肿瘤发生的研究进展
长链非编码RNA(lncRNA)是指长度超过200个核苷酸的非编码RNA,其通过与DNA、RNA和蛋白质等分子相互作用,从表观遗传学、转录水平以及转录后水平等3个层面发挥重要调控作用.近年研究表明,lncRNAs在许多肿瘤的发生、发展过程中发挥着促癌或抑癌作用,部分lncRNAs因其特殊的生物学特性有希望成为新型肿瘤标记物和肿瘤治疗的新靶点.本文总结了近年来在肿瘤中低表达或呈表达缺失的lncRNAs,探讨其与肿瘤发生的相关机制,评价其在肿瘤诊断和治疗方面的临床应用前景.
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垂体腺瘤发病的分子机制研究进展
垂体腺瘤是发生在腺垂体的良性肿瘤,是颅内常见的肿瘤之一,通过放射学检查和尸检,垂体腺瘤的发病率高达22.5％左右[1].除泌乳素型外,手术治疗是垂体腺瘤患者的首选治疗方法.由于垂体腺瘤的发生机制尚不完全清楚,垂体腺瘤的诊断、治疗和预后尚不尽如人意.随着分子生物学、细胞生物学、遗传学、基因组学和测序技术的飞速发展,垂体腺瘤发生、发展机制研究也取得了较大进展,进一步阐明垂体腺瘤发病机制,有利于提高垂体腺瘤的诊治水平.一般认为垂体腺瘤是单克隆来源的肿瘤,垂体腺瘤的发生和发展是由原癌基因的激活、抑癌基因的失活、细胞周期失调、微小RNAs (miRNAs)和长链非编码RNAs(lncRNAs)表达异常共同作用的复杂过程.现就垂体腺瘤发病的分子机制作一综述.
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循环微RNA和长链非编码RNA在肺癌早期临床诊断及治疗中的研究进展
研究显示,肺癌疗效的提高主要得益于临床早期诊断技术的提高以及对手术、放疗、化疗和生物治疗等疗效的早期预测.因此,寻找肿瘤特异性分子标志物,并依据分子分型制定个体化治疗策略,将有利于进一步提高肺癌综合治疗的疗效.大量研究表明,新型肿瘤标志物微RNA(micro RNAs,miRNAs)和长链非编码RNA (long non-coding RNAs,lncRNAs)作为调控分子,在肿瘤的恶性增殖、分化、凋亡及迁移等病理和生理过程中发挥关键作用,同时为肺癌的分子诊断和分子分型的研究提供了一个新的视角.新研究发现,循环miRNAs和lncRNAs具有稳定性好和易检测的优点,其异常表达既可作为肺癌早期诊断的分子标志物,也可用于预测疗效,指导肺癌的个体化治疗.本文就循环miRNAs和lncRNAs在肺癌早期诊断及个体化综合治疗中的作用及临床应用的新研究进展进行综述.
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长链非编码RNA调控神经干细胞分化的研究进展
长链非编码RNAs (lncRNA)是一类转录本长度在200至数千个核苷酸且不表现任何蛋白质编码潜能的非编码RNAs (ncRNA),它是ncRNAs家族中大的一类.多项研究表明lncRNAs可以通过一系列机制在表观遗传水平、转录水平及转录后水平对基因表达进行调控.而越来越多的研究发现lncRNAs在中枢神经系统的发育中起着重要的作用.某些类型的lncRNAs可以调控神经干细胞(NSCs)定向分化为神经元,而另外一些类型的lncRNAs可以调控NSCs向胶质细胞分化.文章就lncRNAs调控NSCs分化的研究新进展进行综述,以期为研究神经系统发育提供新的思路.
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新型胃癌相关循环肿瘤标志物的临床应用
虽然近年来胃癌诊断方法和外科治疗技术不断提高,但晚期胃癌患者的预后仍然不理想.因此,探寻更加特异、灵敏的早期生物学标志物,尽早明确诊断和选择治疗方式,对于提高胃癌患者的生存率具有重要意义.随着体液检测及无创检测技术的不断创新,循环肿瘤标志物越来越受到人们的关注.这些新型肿瘤标志物的出现,为疾病的诊断和治疗提供了新靶点,并为患者的生存和预后带来希望.该文主要综述胃癌相关的循环肿瘤标志物及其临床诊断的应用价值,包括循环游离DNA,FERL4等长链非编码RNAs (lncRNAs),miR-200c、miR106a、let-7a等微小RNAs (miRNAs),癌症相关自身抗体,以及通过血清蛋白质组学确定的标志物等.
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长链非编码RNAs在自身免疫病中的研究进展
长链非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs)是一类片段超过200个核苷酸且不具备编码蛋白质能力的RNA转录本.lncRNAs作为一种表观遗传学修饰,通过影响染色质重塑、基因转录、蛋白质转运和运输等发挥其生物学活性.大量基础及临床研究表明,在动物或人体内许多表达水平异常的lncRNAs可能参与自身免疫病的发生、发展.结合近年来的相关报道,该文主要针对不同类型自身免疫病中异常改变的lncRNAs一综述,并着重讨论lncRNAs的作用机制及其在自身免疫病发生、发展中的调控作用.
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长链非编码RNAs在乳腺癌中的表达及其功能?
无蛋白编码功能的非编码RNAs（ ncRNAs）具有多种生物学功能。长链非编码RNAs（ LncRNAs）是近年来发现的ncRNAs的一员，其转录长度200 nt～100 kb。许多长链非编码RNAs异常表达具有促进或抑制肿瘤发生、发展的生物学功能，包括乳腺癌。由于其在调控基因表达中的基础性作用，和其参与潜在的肿瘤发生的生物学机制，它们是一类有前途的癌症生物标志物。本文突出LncRNAs在乳腺癌中的新兴作用，并探讨其在乳腺癌的诊断、治疗和预后等相关潜在的临床应用价值。
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母源性印记基因MEG3在肿瘤信号通路中的研究进展
由于各种组学方法和大数据分析在肿瘤临床样本中的广泛应用,近年来长链非编码RNAs(Longnon-coding RNAs,lncRNAs)在肿瘤发生发展中的重要调控作用越来越被广泛认可.母源性印记基因MEG3,在大多数肿瘤中呈低表达,具有抑制肿瘤生长的功能.随着近期研究的不断深入,MEG3在肿瘤细胞中错综复杂分子机制也逐一被不同研究团队所揭示.文章结合近期文献,对肿瘤中MEG3涉及的Wnt/β-catenin、53、DNA甲基化、pRb等信号通路在参与肿瘤细胞中的增殖、凋亡、迁移、侵袭和耐药等分子机制进行大致系统性阐述,以期为后续信号通路及调控机制的研究提供参考,并为临床应用和其它lncRNAs的研究提供理论基础.
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长链非编码RNA多态性与肿瘤相关性的研究
长链非编码RNAs(long non-coding RNAs,LncRNAs)是一类转录本长度超过200个核苷酸残基(nt)的RNA分子,位于细胞核或细胞质内,大多由RNA聚合酶Ⅱ转录,但不能编码蛋白质.越来越多的证据表明LncRNA基因也发生遗传变异,导致LncRNA基因存在着广泛的基因多态性,而大多数LncRNA基因多态性与肿瘤的发生、转移和预后相关.文中结合国内外新报道,对LncRNAs多态性与前列腺癌、肝癌、膀胱癌、急性淋巴细胞性白血病及甲状腺肿瘤的相关性研究进展作一综述,旨在为肿瘤的诊断和治疗提供新的思路.
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长链非编码RNAs在肿瘤中研究进展
人类基因组中存在大量的非编码RNAs(non-coding RNAs,ncRNAs),其中转录本大于200nt的ncRNAs称之为长链非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs).越来越多的研究显示,lncRNAs可在染色体重塑、转录和转录后水平调控基因的表达,参与细胞多个生物学过程.它的表达或者调控异常可引起众多疾病的产生,特别是与肿瘤的发生、发展、转移密切相关.一些lncRNAs在特定的肿瘤中表达水平升高或者降低,因此lncRNAs不仅可以作为肿瘤诊断、预后的标志物,还可作为新的特异性治疗靶点,文中就lncRNAs在肿瘤中的研究进展作一综述.
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IncRNAs在非小细胞肺癌顺铂耐药机制中的研究进展
肺癌是中国乃至全球常见的恶性肿瘤,其中非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)约占所有肺癌的80％,因NSCLC对化疗药物继发耐药率高,所以其5年生存率仍低于20％.长链非编码RNAs(long non-coding RNAs,IncRNAs)是一类转录后长度大于200nt的非编码RNAs,越来越多的研究显示IncRNAs和NSCLC顺铂耐药关系密切,本文就目前研究与NSCLC顺铂耐药相关的IncRNAs作一综述.
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长链非编码RNA PANDAR在肿瘤中的研究进展
长链非编码RNA(long non-coding RNA,IncRNAs)近年来成为研究的热点.IncRNA CDKN1A反义链启动子DNA损伤激动 RNA(promoter of CDKN1A antisense DNA damage activated RNA, PANDAR)在多种肿瘤中表达上调,其主要通过结合核转录因子Y(NF-Y)抑制细胞凋亡激活因子的转录等途径参与肿瘤的发生、发展.进一步研究发现,PANDAR还可作为肿瘤预后标志物,在肿瘤的早期诊断、疗效判断及预后评估等方面具有重要的应用前景.
