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聪明是有代价的
人类基因组全测序是一项很昂贵的服务,享受过的人不多.DNA双螺旋结构的发现者、诺贝尔奖获得者詹姆斯·沃森(James Watson)博士是早为自己的基因组测序的名人,但他执意要求工作人员向他汇报结果的时候隐瞒5个字母.无独有偶,早公布自己基因组全序列的科学界名人之一,哈佛大学心理学教授史蒂文·平克(Steven Pinker)也故意向公众隐瞒了这5个字母,这是怎么回事呢?
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戊型肝炎疫苗的研究进展
自1991年戊型肝炎病毒(HEV)基因组全序列被克隆和测序后,对HEV的致病性、分子生物学及疫苗进行了深入研究.但近年来发现,HEV的流行范围远较初预料的要广泛,从而给HEV疫苗研究提出了新问题.
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为中西医结合战胜SARS进一言
19世纪末到20世纪初人类才认识"滤过形病毒"(指比细菌更小的病原体,可以通过细菌通不过的过滤器),细菌的大小以微米计算,1微米是1000纳米,病毒以纳米计算,所以是非常小的.病毒只拥有遗传信息、蛋白质壳与膜这样简单的结构而已,因此病毒靠自己是无法增殖的,只有寄生在活的生物细胞中才能增殖.病毒将细胞的"自行复制、分裂的系统"强行借用,但是病毒也绝非能自由自在地寄生在任何细胞里,只有在病毒表面构造的一部分与细胞构造的一部分有着"钥匙与钥匙孔关系",病毒才能入侵细胞.有些病毒仅能感染植物,也有些仅能感染人类,而且感染在特定的组织细胞,冠状病毒专门袭击呼吸道就是这个道理.病毒各有自己的基因组序列.新加坡、中国大陆和香港,以及美国、加拿大的科学家均于近期(2003年4~5月)公布了对SARS病毒基因组全序列的研究结果,并识别出了制造蛋白质指令的区域,这些蛋白质使得SARS病毒能够入侵宿主细胞进行复制.美国已经在研制能与SARS病毒单链的片段相结合的合成药物以阻断病毒复制.德国亦在建立在SARS病毒蛋白酶模型上试制使病毒蛋白质失去功能的药物.在针对SARS病毒的有效疫苗以及直接抗病毒的特效药物问世之前,就不得不有赖于加强患者的抵抗力来渡过SARS病毒急性感染期.
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侵染陕西洋葱的胡葱黄条病毒基因组全序列分析
葱属植物病毒病害在世界范围内广泛发生,严重危害生产,如果要有效控制病害,首先需要明确病毒的种类及它们的分子生物学特征.
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山东省玉米矮花叶病毒的生物学特性及基因组全序列测定
对山东省玉米矮花叶病毒原分离物(SD)进行了寄主范围、血清学等普通生物学鉴定,测定了该病毒的基因组核苷酸全序列.该病毒基因组RNA由9 596个核苷酸组成(不包括3′-polyA的长度),整个基因组按一个ORF编码一个3 063个氨基酸的多聚蛋白.序列比较表明,该病毒分离物(SD)与玉米矮花叶病河南分离物(HN,EMBL登录号:AF494510)核苷酸全序列同源性高,为98.2%,与已报道的甘蔗花叶病毒(SCMV)7个分离物同源性也高达79.5%~98.2%,但与玉米矮花叶病毒保加利亚分离物(MDMV-Bg,AJ001691)和高梁花叶病毒萧山甘蔗分离物(SrMV-XoS,AJ310197)的同源性仅为67.8%和69.3%,与约翰逊草花叶病毒(Z26920,JGMV)差异大.系统进化树分析也表明,该病毒与SCMV分离物位于同一进化簇,而与MDMV进化关系很远.
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莴苣花叶病毒浙江余杭分离物基因组全序列及其结构分析
测定了莴苣花叶病毒(LMV)浙江余杭分离物基因组全序列.此病毒分离物基因组由10*!080个核苷酸组成,具典型的马铃薯Y病毒科成员基因组结构,与已报道的欧洲、美国和巴西LMV核苷酸同源性为96.7%~98.8%,氨基酸同源性97.8%~99.0%.根据外壳蛋白氨基酸序列和5′端非编码区核苷酸序列分析比较及分子进化树分析,可将全球LMV分为西欧-加利福尼亚、希腊和也门3个类群.LMV有可能起源于加利福尼亚州向西欧,进而向希腊和也门扩展,浙江余杭LMV有可能来源于加利福尼亚州和西欧.
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双向电泳技术在蛋白质组研究中的应用
随着人类基因组计划完成日期的不断提前, 基因组全序列的测定也已经接近尾声.在基因组时代, 许多DNA序列信息让我们对其相关基因组的结构和功能有了一定的了解.然而DNA序列信息不是万能的,它不能预测[1]: 1)基因表达产物是否或何时被翻译; 2)基因产物的相应含量;3)翻译后修饰的程度;4)基因剔除或过表达的影响; 5)多基因现象的表型.
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国内外基因计算机识别的研究方法及进展
众所周知,核酸测序技术已有实质性的发展,迄今为止,全世界完成整个基因组序列测定的物种已超过25种,人类基因组的全序列测定也已基本完成,但是知道了基因组全序列并不等于知道了该种生物全部生活的奥秘.全序列中一个个具有生物功能的片断才称为基因(gene),它是生物遗传信息的载体.非基因部分不编码蛋白质,与生物性状无直接关系,所以对于蛋白质组研究来说,基因区才是真正有价值的部分.但是基因区在序列中所占比例只有3%~5%,因此如何从基因组全序列中找出基因区就成为生物信息学家关注的问题,各种各样的基因组全序列的分析测定程序就应运而生.
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G6PD缺乏症杂合子检测方法的研究进展
G6PD缺乏症是常见的遗传性酶缺乏疾病,全世界约4亿人受累,多分布在非洲、中东地区和东南亚.我国则主要分布在两广(广东、广西)地区.1967年WHO制定了根据酶活性和酶动力学鉴定G6PD酶变异型的统一方案.现已鉴定出400余种G6PD生化变异型[1].1986年国外实验室可克隆出了G6PD的cDNA并获得了cDNA顺序.1991年美籍华人Ellson发表了G6PD基因组全序列.应用克隆G6PD基因技术或PCR联合直接测序,现已鉴定出140种G6PD基因突变型[2].
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药物基因组学与安全用药
由于人类基因组计划的实施,特别是目前较为精确的人类基因组全序列的初步绘制,以及大量单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphisms,SNPs)的检测与发现,以基因水平研究药物反应个体差异的药物基因组学在生物技术和医药工业界掀起了前所未有的热潮.
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药物基因组学与临床合理用药
由于人类基因组计划的实施,特别是目前较为精确的人类基因组全序列的初步绘制,以及大量单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphisms,SNPs)的检测与发现,在基因水平研究药物反应个体差异的药物基因组学在生物技术和医药工业界掀起了前所未有的高潮.药物基因组学[1]是以提高药物疗效及安全性为目标,研究影响药物吸收、转运、代谢、消除等个体差异的基因特征,以及基因变异所致的不同病人对药物的不同反应,即应用已获得的遗传信息预测药物治疗结果(治疗作用和毒副作用),阐明决定药物反应个体差异的根本机理,将从根本上改变临床药物治疗模式和新药开发方向.本文简述药物基因组学对药物效应、药物不良反应和新药临床评价等方面的影响,希望对我们从事医院临床药学研究工作的同仁有参考价值.
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后基因组时代的病毒学
人类基因组计划的提出及实施完成了人类基因组全序列的测定,与此同时,其他多个物种的基因组序列也相继被获知[1],加速了学界从分子水平破译人类所有DNA序列和识别其中所有基因的进程.
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生物信息学(1):概论
生物信息学产生的背景被称为生命科学"登月计划"的人类基因组计划(Human Genome Project,HGP)的主要目标是:提供公开的、完全的、高质量的含有30亿碱基的人类基因组全序列.
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带科绦虫线粒体基因组全序列研究进展
带科绦虫(Taeniidae)幼虫引起的绦虫蚴病(Larval cestodiasis/infections with larva of cestodes)如棘球蚴病、囊尾蚴病等是一类重要的人兽共患寄生虫病,在我国和世界各地普遍流行,危害严重.本文将对带科绦虫线粒体基因组序列分析的研究进展、应用和今后发展方向做一简要综述.
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蛋白质组学研究及其在临床中的应用
随着人类基因组全序列草图的完成,从基因水平向蛋白质水平的深化,已成为生命科学研究的迫切需要和新的任务.蛋白质组学(proteomics)是研究细胞内蛋白质的组成、结构及其自身特有的活动规律的一门新兴学科.蛋白组研究的兴起和发展,在揭示生命运动的本质及疾病的诊断、治疗等方面发挥着重要作用.本文阐述了蛋白质组学的产生、概述、研究方法、临床应用及展望.
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肿瘤外科实验研究动向
世纪之交,我们迎来了人类科学史上的又一重大突破--人类基因组全序列的阐明.全基因组图谱的绘制必然使人类从分子水平来识别自我,识别疾病及指导诊治与预防.学科的发展始终依托于基础理论、实验技术、各种设施以及学科交叉新起点的开拓发展与应用,从而带动了进展与突破.肿瘤是全身疾病的局部表现,是受内外各种因素交互作用,多基因参与多步骤积累所致.肿瘤外科正是依托于其他相关学科深化而发展的,尤其对肿瘤生物学特征的认识更具重要意义.