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  • 长链非编码RNA:气道变应性疾病基因治疗新靶点

    作者:马志祺;滕尧树;李勇

    随着基因组深度测序工作的完成,大量非编码 RNA被发现,其中长链非编码 RNA ( long non-coding RNA, lncRNA)是近备受瞩目的哺乳动物转录组重要成员,可在表观遗传水平、转录水平和转录后水平调控基因的表达,广泛参与机体的生理和病理过程。作为多基因调控的气道变应性疾病, lncRNA在其发病过程中的作用正逐步受到关注,并有望成为该病基因治疗的新靶点,本文对lncRNA在气道变应性疾病中的作用及其机制进行综述。

  • 基于GenMAPP的气道变应性疾病基因芯片实验差异基因的功能路径分析

    作者:薛金梅;赵长青;梁爱华

    目的:利用生物信息学方法对变应性鼻炎并发哮喘机制进行初步探讨.方法:利用GenMAPP软件对季节性变应性鼻炎(SAR)与SAR并发哮喘患者鼻黏膜组织Affymetrix寡核苷酸芯片表达谱结果进行分析.首先筛查差异表达基因,然后对差异基因做数据库检索,并对其生物路径进行分析.结果:在38500多个基因中(47000个转录本中),SAR并发哮喘者,其鼻黏膜发生4倍以上差异表达的基因共有689个,其中有233个基因表达上调,456个基因表达下调.MAPPfindder分析示这些差异表达基因参与了69条生物路径.其中细胞因子与细胞因子受体间作用路径中差异表达基因多,且在此路径中趋化因子CXCL12及其受体CXCR4在变应性鼻炎并发哮喘患者中较单纯变应性鼻炎患者表达均发生显著上调.结论:变应性鼻炎及其并发哮喘过程中许多生物路径参与此过程,其中CXCL12/CXCR4相互作用构成的反应轴在气道变应性疾病中发挥着重要作用.

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