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2005-2016年北京市侵袭性脑膜炎奈瑟菌分子分型特征研究
目的 了解2005-2016年北京市侵袭性脑膜炎奈瑟菌(Nm)分子分型特征,为完善预防控制措施提供依据.方法 通过玻片凝集对经过生化方法鉴定的24株Nm进行血清分群,用荧光聚合酶链式反应对所有菌株和4份核酸阳性标本进行基因分群检测;采用多位点序列分型方法对收集的28份标本Nm序列进行分型分析,同时对porA和fetA基因进行分型分析.结果 北京市侵袭性Nm主要为A、B、C血清群,2009年前16份标本全部为A群和C群,2009年后12份标本全部为C群和B群.A群序列型均属于ST-5克隆群,porA P1.20,9仅在ST-7型中检出,fetA均为F3-1;ST-4821克隆群在C群菌株中占绝对优势,ST-4821型porA有P1.12-1,16-8、P1.7-2,14和P1.20,23-7,fetA均为F3-3.B群序列型结构复杂、分散.结论 北京市侵袭性Nm优势菌特征为A:P1.20,9,F3-1:ST-5(ST-5克隆群)和C:P.12-1,F3-3:ST-4821(ST-4821克隆群),且有A群明显减少、B群增长趋势.提示侵袭性Nm随时间变迁已经发生改变,需加强其分子流行病学监测,尤其要关注尚无有效疫苗应对的B群菌株.
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牦牛携带的产志贺毒素大肠杆菌分离株的多位点序列分型研究
目的 对牦牛携带的产志贺毒素大肠杆菌(Shiga toxin-producing Escherichia coli,STEC)进行多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)分析,了解菌株的遗传进化关系及致病潜力.方法 根据E.coli MLST数据库(http://mlst.ucc.ie/mlst/dbs/Ecoli)提供的MLST方案,对青海玉树牦牛中分离的54株STEC分离株的7个管家基因进行PCR扩增并测序,通过序列比对确定其等位基因及菌株序列型(Sequence type,ST),并使用BioNumeries软件构建小生成树(Minimum spanning tree,MST),分析牦牛ST型与HUSEC及人源主要流行血清群STEC菌株ST型间的进化关系.结果 54株牦牛STEC菌株呈现高度遗传多态性,可分为31个ST型别,其中包括7个新的等位基因型和17个新的ST型,并存在与HUSEC及主要流行血清群STEC亲缘关系相同或相近的ST型别.结论 青藏高原牦牛携带的STEC具有遗传多样性及一定的特异性,部分菌株具有对人致病的潜力.
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非O157产志贺毒素大肠杆菌分离株的多位点序列分型研究
目的 对国内部分地区非O157产志贺毒素大肠杆菌分离株进行分子分型分析,了解菌株间的遗传进化关系.方法 根据mist.ucc.ie数据库提供的大肠杆菌多位点序列分型(Multilocus Sequence Typing,MLST)方案,对来自我国河南、黑龙江2省的29株非O157产志贺毒素大肠杆菌分离株的7个管家基因进行PCR扩增并测序,通过序列比对确定其等位基因谱及菌株序列型(Sequence type,ST),使用MEGA、eBURST生物信息软件分析不同ST序列群及菌株间的进化关系.结果 29株非O157产志贺毒素大肠杆菌呈现较大的遗传多态性,可分为13个ST型别,其中ST155为优势型别(34.48％).同时研究发现2个新等位基因型(fumC376、recA214)和3个新序列型(ST2460、ST2467、ST2468).结论 29株非O157产志贺毒素大肠杆菌菌株之间具有分子多态性,与国际流行菌株具有一定的亲缘关系.加强我国对这一类菌株的检测和监测具有重要的公共卫生意义.
关键词： 非O157产志贺毒素大肠杆菌 多位点序列分型 序列型 -
中国汉赛巴尔通体分离株的多位点序列分型分析
目的 了解中国汉赛巴尔通体的遗传背景和流行的常见亚型.方法 对分离到的汉赛巴尔通体应用多位点序列分型方法(multilocus sequence typing,MLST),分析它们的分子流行病学特征和系统发育情况.结果 80株汉赛巴尔通体一共分为3个序列型(sequence type,ST),其中ST1占90% (72/80),ST9占8.75% (7/80),另一个序列型为仅包含一株细菌的ST30;所有3个序列型均属于克隆群1 (clonal complex 1).结论 与国外汉赛巴尔通体多位点序列分型结果相比,中国的序列型相对集中,说明中国汉赛巴尔通体的变异度和多样性较低,提示其进化相对缓慢.
