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重症监护病房耐甲氧西林金黄色葡萄球菌基因同源性分析
目的 对重症监护病房(ICU)感染患者和环境监测分离出的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)进行耐药性及基因同源性进行分析.方法 对医院ICU医务人员手及高频接触的物品表面进行采样,对感染患者标本进行细菌培养,菌株采用Vitex 2 Compact微生物鉴定药敏系统进行检测,并用肠杆菌科基因间重复序列的聚合酶链反应(ERIC-PCR)对其进行基因分型,采用NTSYS-PC 2.0软件对ERIC-PCR扩增产物进行聚类分析.结果 ICU感染患者标本中有33株金黄色葡萄球菌,16株为MRSA,其检出率为48.48％,ICU医务人员手及环境表面检出6株金黄色葡萄球菌,5株为MRSA,其检出率为83.33％.21株MRSA对万古霉素、利奈唑胺、替考拉宁耐药率为0,对青霉素耐药率为100％,对环丙沙星、红霉素、左氧氟沙星等耐药率超过了80.00％;ERIC-PCR电泳结果显示,大的分子质量约为450 bp,小的分子质量约为100 bp,带型各不相同;对21株MRSA扩增产物进行聚类分析,DNA同源性在46.00％～ 67.00％之间,同源性在68.00％时可分为3个大类,第1、2、3、4、5、6、9、11、13、17菌株亲缘关系较近.结论 ICU临床分离出的MRSA呈多重耐药,临床医生应根据药敏结果合理用药;ICU环境分离出的MRSA也呈现多重耐药,与临床分离株耐药表型有一定的同源性,但基因同源性关联不大;ICU环境物体表面存在MRSA感染风险.
关键词： 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 重症监护病房 肠杆菌科基因间重复序列 基因分型 同源性 -
耐亚胺培南肺炎克雷伯菌耐药基因检测与分子流行病学研究
目的 对耐亚胺培南肺炎克雷伯菌的耐药基因携带情况及分子流行病学特征进行研究,以降低耐药率.方法 对2013年10月-2014年5月临床分离的15株耐亚胺培南肺炎克雷伯菌,采用Hodge试验检测碳青霉烯酶表型;采用PCR法检测碳青霉烯酶、AmpC酶和ESBLs耐药基因及整合子,进行测序及网上比对确定基因型;采用肠杆菌科基因问重复序列(ERIC)和多位点序列分型(MLST)对菌株进行同源性和遗传相关性研究.结果 15株耐亚胺培南肺炎克雷伯菌均检出KPC-2、TEM-1、SHV和CTX-M型基因,SHV12和CTX-M-24为主要基因亚型;未检测到IMP、VIM、OXA和NDM碳青霉烯酶基因和AmpC酶基因;各带有Ⅰ类整合子,整合的主要耐药基因为aadA2;同源性和遗传相关性分析,15株耐亚胺培南肺炎克雷伯菌可分为A、B、C3种ERIC类别,12株A菌为ST11型,2株B菌为ST290和ST147,1株C菌为ST967;15株肺炎克雷伯菌呈多药耐药或泛耐药,仅磺胺甲噁唑/甲氧苄啶的敏感率＞50.0％.结论 15株肺炎克雷伯菌的多药耐药或泛耐药与菌株携带KPC-2碳青霉烯酶、CTX-M型ESBLs和其他β-内酰胺酶及整合子有关;产KPC-2肺炎克雷伯菌在神经外科病区呈克隆传播,ST11型菌株为此次流行的主要株;发现ST290和ST967型产KPC-2肺炎克雷伯菌.
关键词： 肺炎克雷伯菌 耐药基因 肠杆菌科基因间重复序列 多位点序列分型 分子流行病学 -
碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌ERIC-PCR指纹图谱分型的研究
目的 探究碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(KPC)的ERIC-PCR指纹图谱分型.方法 收集成都中医药大学2016年7月—2017年4月临床标本中分离出的KPC31株,行药敏试验、改良Hodge试验,并采用PCR检测碳青霉烯酶基因;阳性结果行DNA测序,并与BLAST比对确定基因型,以肠杆菌科基因间重复序列(ERIC-PCR)行同源性分析.结果 31株KPC主要来源于重症监护室;所测KPC菌株对 β-内酰胺类药物100％ 耐药,仅部分菌株对四环素、庆大霉素、阿米卡星、复方新诺明表现敏感,敏感率分别为3.23％、9.68％、90.32％、67.74％;改良Hodge试验显示29株KPC均为阳性;DNA测序及PCR扩增证实bla KPCA1型30株及A2型1株.结论 bla KPC-2基因型30株;bla IMP-1基因型1株;ERIC-PCR同源性分析发现KPC-2是导致KPC产生的主要分型,且A1型已在我院流行,应引起临床重视,加强院感监控及预防.ERIC-PCR是一种适合于做同源性分型筛查的简便快捷的初步基因分型技术.
关键词： 肺炎克雷伯菌 碳青霉烯类 耐药性 肠杆菌科基因间重复序列 基因型 -
碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌基因型检测及同源性分析
目的 了解福建医科大学附属第一医院耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(KPC)的耐药基因分型及同源性分布情况.方法 收集临床分离的29株KPC,改良Hodge试验检测碳青霉烯酶表型.PCR检测碳青霉烯酶blaKPC、blaIMP-1、blaVIM-1、blaOXA-48及blaNDM-1基因;阳性结果进行DNA测序,并进行BLAST比对确定其基因型.采用肠杆菌科基因间重复序列(ERIC-PCR)对KPC进行同源性分析.结果 29株KPC中Hodge试验阳性27株,阳性率为93.1％(27/29).PCR扩增和DNA测序显示28株为blaKPC-2,1株为blaIMP-1,未检出blaVIM-2、blaOXA-48和blaNDM-1基因.同源性分析发现KPC主要存在两种型别:28株A1和1株A2.结论 blaKPC-2型碳青霉烯酶是该院KPC的主要型别,A1型已在该院流行,应加强院感监测和预防.ERIC-PCR是一种简便、快捷的基因分型技术,适合同源性的初步分型筛查.
关键词： 耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌 肠杆菌科基因间重复序列 基因型 同源性 -
ERIC-PCR技术在鲍曼不动杆菌基因分型中的应用评估
目的 了解仁济医院鲍曼不动杆菌的基因同源性,验证肠杆菌科基因间重复序列(ERIC)-聚合酶链反应(PCR)在鲍曼不动杆菌基因分型中的实用性.方法 采用琼脂稀释法检测临床分离的81株鲍曼不动杆菌对临床常用抗菌药物的低抑菌浓度(MIC)；采用ERIC-PCR对81株鲍曼不动杆菌进行基因分型；使用脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术对其中的43株耐亚胺培南鲍曼不动杆菌进一步分型,以PFGE分型为参考标准,验证ERIC-PCR在基因分型中的实用性.结果 81株鲍曼不动杆菌对临床常用的13种抗菌药物普遍耐药,只对米诺环素耐药率低,为30.9％,其次是亚胺培南,为53.1％,对其他抗菌药物的耐药率均＞60％.81株鲍曼不动杆菌ERIC-PCR分型主要为A、B、C、D、E、F6型,其中A、B、C型为主要的流行株.43株耐亚胺培南鲍曼不动杆菌分型为A型41株(A1型29株,A2型12株)、B型1株、C型1株.PFGE分型将其分为5型,A型34株(A1型31株,A2型3株),B型6株,C、D、E分型各1株.结论 仁济医院鲍曼不动杆菌存在克隆播散,且主要为耐亚胺培南鲍曼不动杆菌.ERIC-PCR分辨力较强,结果可靠,与PFGE结果具有一定的相关性,是一种简便、快捷的基因分型技术.
关键词： 鲍曼不动杆菌 肠杆菌科基因间重复序列 聚合酶链反应 脉冲场凝胶电泳 同源性
