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骨髓增生异常综合征的中医辨证论治
目的:探讨骨髓增生异常综合征(MDS)辨证论治的临床意义.方法:选取2014年6月至2016年6月中国中医科学院西苑医院血液科门诊MDS患者43例,辨证分为肝肾阴虚与脾肾阳虚2个证型,接受复方青黄散治疗2个疗程,分析2个证型患者在遗传学、危度分层、基因突变等精准指标下的客观化差异以及对复方青黄散的治疗反应.结果:1)2个证型患者临床特征:a.MDS亚型:脾肾阳虚组RAEB患者(5/31)显著高于肝肾阴虚组(0/12) (P ＜0.05).b.遗传学:脾肾阳虚组预后好的核型(正常核型、+8、-Y)患者比例(22/31,)明显低于肝肾阴虚组(11/12) (P ＜0.05).c.危度分层:脾肾阳虚组低危患者比例(4/31)明显低于肝肾阴虚组(3/12) (P ＜0.05).d.基因测序:脾肾阳虚组合并突变者(11/14)较肝肾阴虚组(1/4)多见(P＜0.05).2)患者对复方青黄散的治疗反应:患者总有效率为90.69％.a.有效率:脾肾阳虚组(30/31)显著高于肝肾阴虚组(9/12) (P ＜0.05).b.外周血细胞计数:脾肾阳虚组HB、NEUT显著升高(P＜0.05).输血量:48％患者摆脱输血(12/25).2组患者人均月输血量显著下降(P＜0.05).结论:在遗传学、危度分层以及基因测序等层面上,脾肾阳虚型MDS较肝肾阴虚型更容易伴随预后较差的客观指标,但脾肾阳虚型患者对复方青黄散的治疗反应好于肝肾阴虚型.辨证分型有利于提供精准治疗方案.
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骨髓增生异常综合征患者骨髓与循环肿瘤DNA突变位点一致性的分析
目的:分析骨髓增生异常综合征(MDS)患者骨髓肿瘤DNA(BM-tDNA)与外周血浆循环肿瘤DNA(PP-ctDNA)突变位点的一致性.方法:用NGS 127-gene panel的骨髓与外周血同期送检者(19例)检测肿瘤DNA,分析BM-tDNA与PP-ctDNA突变位点VAF的一致性.随机加测其中5例患者外周血细胞的肿瘤DNA(PC-tDNA),并分析PC-tDNA与PP-ctDNA以及BM-tDNA突变位点VAF的一致性.另外检测和分析13例非同期送检患者PP-ctDNA与BM-tDNA的VAF差值,并与同期患者PP-ctDNA与BM-tDNA VAF差值进行比较.结果:同期(19例)与非同期(13例)患者人均PP-ctDNA浓度分别为0.59 ng/μl和0.604 ng/μl,其中位数浓度分别为0.330 ng/μl和0.338 ng/μl.19例同期送检患者BM-tDNA与PP-ctDNA交集位点的VAF有较好的一致性(R2=0.9693;P＜0.05),其中单碱基置换(SNP)位点VAF的一致性(R2=0.9712)较插入缺失(Indel)位点为好(R2=0.6813),BM-tDNA与PP-ctDNA中有临床意义的位点的检出率和VAF均有较好的一致性(R2=0.9203,P＜0.05).19例同期送检患者中,12例初诊(R2=0.9325,P＜0.05)和5例治疗后(R2=0.9875,P＜0.05)患者BM-tDNA与PP-ctDNA的VAF均有较好的一致性.随机加测其中5例患者的PC-tDNA结果显示,PC-tDNA与PP-ctDNA(R2=0.8783)以及BM-tDNA(R2=0.9633)突变位点的VAF均有较好的一致性(P＜0.05).与19例同期送检患者相比,13例非同期送检BM-tDNA与PP-ctDNA VAF差值显著增大(P＜0.05).结论:PP-ctDNA浓度稳定,临床有意义位点与BM-tDNA一致性高,样本容易采集,可代替骨髓作为基因检测的生物样本.
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晚期恶性肿瘤基因突变状态二代测序临床意义分析
目的 靶向治疗是晚期恶性肿瘤的重要治疗方法,二代测序能够准确、高通量地检测基因突变情况,对恶性肿瘤治疗有重要意义.本研究运用二代基因测序(next-generation sequencing,NGS)技术检测晚期恶性肿瘤的基因突变情况,并初步分析错义突变的临床意义.方法 2011-09-01-2016-09-30收集陕西省人民医院肿瘤内科93例晚期恶性肿瘤患者病理组织石蜡标本,利用离子个体化基因检测仪(Ion Personal Genome Machine,Ion Torrent PGM)平台检测标本16个肿瘤相关基因428个常见的突变位点的突变状态,并查询临床试验(Clinical Trails)与美国食品与药物管理局(Food and Drug Administration,FDA)官网数据资料.结果 共发现119个错义突变,其中TP53发生频率高为34.5％(41/119);除TP53突变在各瘤种中均占较大比例外,肺癌突变频率高为表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR) 25.7％(9/35),结直肠癌为KRAS 31.6％ (6/19),胃癌为KDR 3/6,卵巢癌为KRAS 2/7,宫颈癌为KDR 3/5.70例(75.3％,70/93)检测发现＞1个的错义突变位点;93.8％(15/16)的被检测基因有正在研发中的小分子抑制剂和(或)单抗类制剂,75.0％(12/16)的被检测基因已有FDA批准用于特定瘤种的靶向药物,68.8％(11/16)的被检测基因有尚未被FDA批准的靶向药物.结论 晚期恶性肿瘤基因错义突变发生率较高,且不同瘤种的突变谱不同,目前基于NGS指导的恶性肿瘤个体化靶向治疗有广阔的应用前景.
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应用靶向二代测序诊断疑诊先天性贫血46例
目的 评估靶向二代基因测序(NGS)在先天性贫血诊断中的价值.方法 设计含217个先天性贫血相关致病基因的NGS基因组合——BDHAP-2014,对2014年8月至2017年7月连续就诊的临床怀疑诊断先天性贫血的患者进行NGS检测和亲代验证.结果 共纳入46例患者,临床疑诊分别为范可尼贫血(FA)11例、先天性红细胞生成异常性贫血(CDA)8例、先天性铁粒幼红细胞性贫血(CSA)6例、先天性溶血性贫血(CHA)12例、先天性角化不良(DC)1例、铁剂难治性缺铁性贫血(IR-IDA)4例及未明原因的血细胞减少(Uc)4例.经靶向NGS检测,28例(60.9%)患者明确了诊断和(或)分型,累及12个基因共44种致病性突变.其中26例(56.5%)基因诊断结果与临床疑诊相符,包括FA(5/11,45.5%)、CSA(6/6,100.0%)、CDA(3/8,37.5%)及CHA(12/12,100.0%);2例(4.3%)患者的基因诊断结果与临床疑诊不一致,依据NGS纠正了诊断,包括1例DC和1例家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增生症(FHL);12例CHA依据基因检查结果进一步明确了溶血类型.18例(39.1%)患者未明确致病基因,终未能明确诊断.结论 NGS对临床疑诊先天性贫血患者具有重要的诊断价值,可为临床治疗选择提供依据.
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埃克替尼治疗EGFR突变晚期卵巢癌1例
卵巢癌发病率高,死亡率居妇科肿瘤首位[1],但是治疗手段有限.研究表明卵巢癌虽然高表达表皮生长因子受体(EGFR),但靶向EGFR的相关临床研究效果却不佳.我科对1例不能耐受化疗的晚期卵巢癌患者行二代基因测序发现EGFR突变,给予口服表皮生长因子受体-酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKI)埃克替尼疗效显著,现将结果报告如下.
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骨髓增生异常综合征患者基因突变情况分析
目的 分析骨髓增生异常综合征(MDS)患者的基因突变情况.方法 选择2016年1月至2017年7月中国中医科学院西苑医院初诊的47例MDS患者,采用NGS 127-gene panel检测基因突变,分析基因突变与临床特征的关系.结果47例MDS患者中,31例(66.0％)检测到基因突变,涉及有临床意义的突变基因23个,检出率>5％的基因共7个,由高到低依次为U2AF1(23.4％)、SF3B1(12.8％)、ASXL1(10.6％)、TET2(8.5％)、BCOR(8.5％)、TP53(8.5％)、DNMT3A(6.4％).31例基因突变患者中,16例(51.6％)存在2个以上基因协同突变,其中12例患者的协同基因突变存在于不同基因功能组内,高于单一基因功能组内的基因协同突变(4例).IDH2-KRAS、IDH2-SRSF2、IDH2-STAG2、KRAS-SRSF2、KRAS-STAG2、RUNX1-PHF6、EZH2-ASXL1、EZH2-ZRSR2、NPM1-NRAS基因之间有共存关系(均P<0.05).JAK2、KRAS、NRAS、SH2B3四个信号通路相关的变异等位基因频率(VAF)较低,处于亚克隆地位.1例JAK2突变见于MDS-U患者;1例SH2B3基因突变见于核型预后极高危患者;2例SETBP1以及2例EZH2突变均见于修订的国际预后评分系统(IPSS-R)预后高危患者.结论 MDS患者常见突变基因为U2AF1、SF3B1、ASXL1、TET2.不同基因功能组内的基因倾向于协同突变.基因突变可用于判断MDS患者预后,作为其治疗的靶点.
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二代测序在急性髓系白血病中的应用
二代测序(NGS)目前被广泛用于急性髓系白血病(AML)的检测,由于其具有高通量、高灵敏度特性,为AML的诊断、治疗与预后判断带来了新的进展.在第54届美国血液学会(ASH)年会上关于NGS在AML中的应用有大量的报道,反映了NGS这门新技术在现代血液病诊治中的重要地位及对血液病未来发展的影响.
