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循环肿瘤DNA在结直肠癌临床诊疗中的应用 价值研究
结直肠癌(CRC)属常见消化道恶性肿瘤之一,临床早期诊断较为困难,多数患者确诊时多已进展至中晚期,不利于治疗的充分展开,预后较差.ctDNA检测是一种新兴技术,能够克服传统肿瘤组织活检的缺点,具有操作便捷、高重复性、能够克服肿瘤的异质性等优点,患者接受度高,在早期诊断、判断疗效、指导靶向用药、评估预后等方面均具有显著应用价值,现综述如下.
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肺癌早期诊断的新肿瘤标志研究
肺癌是全世界范围内发病率和死亡率高的恶性肿瘤之一,严重影响人类健康.早期诊断对肺癌治疗和预后至关重要,可显著减少病死率.血清标志在早期肺癌中的异常表达已成为肺癌早期诊断研究领域中有前景的科学探索.目前,临床常用血清学标志包括癌胚抗原(carcino-embryonic antigen,CEA)、神经元特异性烯醇化酶(neuron-specific enolase,NSE)、细胞角蛋白19片段(cytokeratin 19 fragment,CYFRA21-1)、糖类抗原125(carbohydrate antigen 125,CA125)、胃泌素释放肽前体(pro-gastrin-releasing peptide,Pro-GRP)等.随着分子生物学和高通量技术平台的飞速发展,热休克蛋白90α亚型(heat shock protein 90α,HSP90α)、肺癌自身抗体、循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)、微小RNA(microRNA,miRNA)、循环肿瘤细胞(circulating tumor cells,CTC)等新型标志正不断涌现.本文主要围绕肺癌早期诊断的新肿瘤标志的功能和特点进行阐述.
关键词： 肺癌 热休克蛋白90α亚型 自身抗体 循环肿瘤DNA 微小RNA -
循环肿瘤DNA临床应用的研究进展
循环肿瘤DNA (circulating tumor DNA,ctDNA)是一类源于肿瘤细胞的双链DNA片段.研究证实肿瘤患者ctDNA所携带的肿瘤基因组信息与肿瘤组织具有良好的一致性,能克服常规肿瘤组织活检所无法突破的肿瘤异质性问题.通过对外周循环样本进行ctDNA检测,能帮助实时动态监测肿瘤原发灶及转移复发灶基因组信息,协助早期诊断、疗效监测、预后判断,也有助于靶向治疗适应症的评估,从而推进精准医疗的实施.作为“液体活检”新手段,ctDNA检测在肿瘤诊疗领域具有广阔应用前景,也是推动肿瘤基础研究进展的重要助力.
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循环肿瘤DNA在胶质瘤研究中的进展
循环肿瘤DNA (ctDNA)检测是一种新兴技术,在胶质瘤的早期诊断、疗效监测以及个体化治疗方案制定中有重要意义.异柠檬酸脱氢酶(IDH)基因突变、表皮生长因子受体vⅢ(EGFRvⅢ)基因突变、06-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)启动子甲基化、染色体杂合性缺失(LOH)是近期胶质瘤ctDNA的研究热点.
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液体活检在淋巴瘤中的研究和应用进展
液体活检作为一种新兴的非侵入性检测方法,在实体肿瘤的诊断、疗效和预后评价、早期复发和耐药监测等方面发挥着重要的作用.淋巴瘤是一组具有很强异质性的血液肿瘤,其多数亚型并没有特异的肿瘤标记物,其疗效和预后评价主要依赖和受限于组织活检和影像学检查,相比于其他组织起源的实体肿瘤,淋巴瘤具有肿瘤细胞更易进入外周循环系统,并且可以通过免疫受体分子多样性标志进行监测的特点,而液体活检具有更为明确的应用意义.随着检测技术的进展,液体活检在淋巴瘤中的研究和应用也受到越来越多的关注.本文就液体活检的概念,液体活检的实现基础和应用现状,以及液体活检在淋巴瘤中的研究和应用进展作一综述.
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骨髓增生异常综合征患者骨髓与循环肿瘤DNA突变位点一致性的分析
目的:分析骨髓增生异常综合征(MDS)患者骨髓肿瘤DNA(BM-tDNA)与外周血浆循环肿瘤DNA(PP-ctDNA)突变位点的一致性.方法:用NGS 127-gene panel的骨髓与外周血同期送检者(19例)检测肿瘤DNA,分析BM-tDNA与PP-ctDNA突变位点VAF的一致性.随机加测其中5例患者外周血细胞的肿瘤DNA(PC-tDNA),并分析PC-tDNA与PP-ctDNA以及BM-tDNA突变位点VAF的一致性.另外检测和分析13例非同期送检患者PP-ctDNA与BM-tDNA的VAF差值,并与同期患者PP-ctDNA与BM-tDNA VAF差值进行比较.结果:同期(19例)与非同期(13例)患者人均PP-ctDNA浓度分别为0.59 ng/μl和0.604 ng/μl,其中位数浓度分别为0.330 ng/μl和0.338 ng/μl.19例同期送检患者BM-tDNA与PP-ctDNA交集位点的VAF有较好的一致性(R2=0.9693;P＜0.05),其中单碱基置换(SNP)位点VAF的一致性(R2=0.9712)较插入缺失(Indel)位点为好(R2=0.6813),BM-tDNA与PP-ctDNA中有临床意义的位点的检出率和VAF均有较好的一致性(R2=0.9203,P＜0.05).19例同期送检患者中,12例初诊(R2=0.9325,P＜0.05)和5例治疗后(R2=0.9875,P＜0.05)患者BM-tDNA与PP-ctDNA的VAF均有较好的一致性.随机加测其中5例患者的PC-tDNA结果显示,PC-tDNA与PP-ctDNA(R2=0.8783)以及BM-tDNA(R2=0.9633)突变位点的VAF均有较好的一致性(P＜0.05).与19例同期送检患者相比,13例非同期送检BM-tDNA与PP-ctDNA VAF差值显著增大(P＜0.05).结论:PP-ctDNA浓度稳定,临床有意义位点与BM-tDNA一致性高,样本容易采集,可代替骨髓作为基因检测的生物样本.
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高通量测序平台发展及在临床分子诊断中的应用与展望
高通量测序又称下一代测序(NGS),是一种新型的遗传学筛查和诊断技术,它的不断革新加速了人们对遗传学标志物及疾病分子机制的认识,特别是针对复杂遗传性疾病.NGS技术的发展,特别是靶向基因组测序、全基因组外显子组测序以及全基因组测序项目的出现,NGS在临床已经应用到检测单核苷酸变性以及结构重排和拷贝数变异,监测循环肿瘤DNA,并分析先前对标准生物信息学算法进行管理所挑战的基因组区域等.
关键词： 高通量核苷酸序列分析 分子诊断技术 DNA拷贝数变异 循环肿瘤DNA 基因组 -
肿瘤液体活检临床应用的研究进展
近年来,针对恶性肿瘤患者血液中循环肿瘤细胞(CTC)、循环肿瘤DNA(ctDNA)和外泌体(exosomes)的液体活检(liquid biopsy)引起了医疗领域的巨大关注.与传统的组织活检相比,液体活检具有实时、全面、无创等优势.其检测技术的发展为肿瘤的精准诊疗开辟了新的途径,使得液体活检能够应用于肿瘤的早期筛查、诊断、治疗、疗效评估以及预后判断等众多领域.本文将从检测技术及临床应用等方面就近年来有关CTC、ctDNA及外泌体的研究进行阐述.
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结直肠癌液体活检研究进展
近年来,包括循环肿瘤细胞、循环肿瘤DNA和外泌体在内的液体活检技术有效地应用在结直肠癌早期诊断、复发和耐药监测及预后评估等临床与基础研究中.现就液体活检在结直肠癌基础与临床的研究与应用作一综述.
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液体活检在常见肿瘤中的应用
目前治疗肿瘤的手段多种多样,已经不完全局限于传统的手术切除及放化疗等,分子靶向治疗药物的普及使"精准医学"正逐步被应用到临床肿瘤领域.肿瘤精准医学将个体疾病的遗传学信息、诊断、治疗三者结合,使肿瘤的诊治更具有针对性、靶向性和特异性.液体活检是一种新兴的无创检测技术,该项技术是通过采集患者体液(包括血液、唾液、汗液及分泌物等)对体内的肿瘤或移植器官状态进行监测的方法.了解和临床应用这项检测技术对肿瘤的诊断尤为凸显.本文综述了液体活检的生物学特性及其在常见肿瘤精准治疗的应用.
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体液检测在结直肠癌中应用的研究进展
体液检测是指以血液为主的体液标本中细胞及核酸的检测，包括了循环肿瘤细胞和循环肿瘤DNA两大类。能帮助实时动态监测肿瘤原发灶及转移复发灶基因组信息，协助早期诊断、疗效监测、预后判断，也有助于靶向治疗适应症的评估，从而推进精准医疗的实施。液态活检属于新型的无创性分子病理检测方式。在结直肠癌诊疗领域具有广阔的临床应用前景，也是推动肿瘤基础研究进展的重要助力。
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循环肿瘤DNA应用于乳腺癌的潜在价值探索
循环肿瘤DNA（ctDNA）是肿瘤细胞通过坏死、凋亡或直接分泌的方式向血液中释放的游离DNA。ctDNA常携带肿瘤相关的单核苷酸变异、拷贝数改变及结构变异等遗传学改变，这一特点促使循环肿瘤DNA成为潜在的生物标记物。以聚合酶链式反应（PCR）或二代测序（NGS）为基础的检测技术的进步提高了ctDNA检测的敏感性和信息量。ctDNA作为一种“液体活检”方法因其简便易行、侵害性小、实时动态佳等优势在乳腺癌领域得到了广泛研究，可以协助早期诊断、监测疗效、探索耐药机制、预测疾病复发和判断预后，为确定肿瘤患者治疗策略提供依据，从而真正实现乳腺癌的个体化治疗。
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循环肿瘤DNA预测激素受体阳性晚期乳腺癌患者内分泌治疗耐药的临床分析
目的 探讨多基因联合检测预测激素受体阳性晚期乳腺癌患者内分泌治疗耐药的临床应用价值.方法 采用回顾性病例分析方法,收集2015年1月至2016年8月中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院收治的30例激素受体阳性晚期乳腺癌患者的临床资料.于患者治疗前采集其外周血10 ml,利用目标区域捕获测序技术检测循环肿瘤DNA(ctDNA)突变情况.根据患者是否存在耐药相关基因(TP53、PIK3CA、mTOR、ERBB2、ESR1、FGFR1)突变,将其分为基因突变组和非基因突变组.分析内分泌治疗耐药与基因突变的关系.采用Kaplan-Meier法绘制2组患者的无进展生存(PFS)曲线,用Log-rank检验比较两者之间的差异.并用 χ2检验比较基因突变组与非基因突变组患者发生原发耐药的差异.结果 在30例患者中,基因突变组与非基因突变组患者分别有20例和10例.随访1~19个月,中位随访时间为3个月,2组患者中位PFS分别为3个月和5个月,并且,基因突变组患者6个月PFS率明显低于非基因突变组(10%比50%,χ2=8.328,P=0.004).20例基因突变组患者中,原发耐药者18例,继发耐药者2例,而10例非基因突变组患者中原发耐药者5例,继发耐药者5例;基因突变组原发耐药者比非基因突变组多(χ2=5.963,P=0.026).结论 联合检测多个耐药相关基因的ctDNA,能够预测晚期乳腺癌患者内分泌治疗耐药.
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循环肿瘤DNA与结直肠癌的靶向治疗
液体活检之循环肿瘤DNA是一种快速、经济、可靠的恶性肿瘤血液检测方法,因其无创性、便捷性、高度重复性等特点而具有广泛的应用前景.就结直肠癌靶向治疗而言,连续监测循环肿瘤DNA的水平变化及其特异性基因改变,有望实现结直肠癌的预后判断、耐药监测、疗效评估,甚至指导联合靶向治疗,更加精准地指导结直肠癌的治疗.
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循环肿瘤DNA在肿瘤精准治疗中的意义
活组织检查不仅是癌症诊断的标准,还适用于癌症的靶向治疗.然而由于肿瘤异质性和不断演化的特点,使得活组织检查在用于癌症诊断、发展评估、预后和基因分型时有一定局限性.循环肿瘤DNA(ctDNA)是由肿瘤细胞释放到血液循环系统中的DNA,能实时反映肿瘤状态.随着新技术不断涌现,检测ctDNA的特异性及灵敏性的方法 不断改善.对ctDNA检测可以用来分析肿瘤基因和表观遗传的改变,ctDNA能够广泛应用于肿瘤分子分型、评估肿瘤动态和肿瘤负荷、检测微小残留病灶和复发、预后评估、监测耐药和发现新治疗靶点.
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循环肿瘤DNA检测及临床应用研究进展
精准医学的发展使得肿瘤基因的寻找和检测变得至关重要,由于活组织检查存在局限性,近年液体活组织检查尤其是循环肿瘤DNA(ctDNA)检测受到广泛关注.然而目前尚鲜见对其较为全面的阐述,如已有哪些ctDNA检测方法?其敏感性和特异性如何?各有哪些优缺点?ctDNA检测的临床应用有哪些?文章就上述问题作一综述.
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液体活检技术及在精准医疗中的应用
液体活检是一种快速、简便的癌症血液检测方法，是精准医疗重要途径之一，是非介入性的、可重复性地抽取肿瘤样本。应用液体活检技术实现癌症的预防、诊断、预后，从而在抗癌药物的选择、药物功效的评估、耐药的监测等方面拥有广泛的前景。笔者分别对液体活检技术之循环肿瘤DNA和循环肿瘤细胞监测及其在精准医疗中的应用进行综述。
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基于Web of Sciences的循环肿瘤DNA研究文献计量分析
目的 用文献计量的方法探索循环肿瘤DNA研究的文献分布特点.方法 检索Web of Sciences数据库,用文献计量方法分析循环肿瘤DNA研究的年发文量、年引文数、国家、作者单位、期刊、被引频次.结果 共检索得到708篇循环肿瘤DNA研究的相关文献,虽然文献总数不多,但其发文量和年引文数逐年递增,且增长迅速.美国的发文量大,JClin Oncol的载文量多.所有文献年引被引11.53次,以介绍循环肿瘤DNA对肿瘤的诊断和预后相关的文献引用次数较多.结论 循环肿瘤DNA的研究较为新颖,是当年的研究热点.相关文献多被高水平杂志收录,且引用次数较高.预期其在肿瘤的诊断和预后中将发挥越来越重要的作用.
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基于深度测序的循环肿瘤DNA检测在肿瘤诊治中的应用进展
循环肿瘤DNA为血液中与肿瘤相关的游离核酸,可作为肿瘤诊治的标志物.基于深度测序的循环肿瘤DNA检测在肿瘤诊治中具有高通量、高灵敏度、微创、一定程度上能克服肿瘤异质性等优势,在评估肿瘤动态和肿瘤负荷、检测微小残留病灶和复发风险预测、个体化用药指导和预后评估等方面显示出很高的价值.本文将对基于深度测序的循环肿瘤DNA检测在肿瘤诊治中的应用做一综述.
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循环肿瘤DNA在肿瘤临床应用中的进展
循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)是肿瘤细胞在坏死、凋亡后释放的一种游离DNA(cell free DNA,cfDNA),由于其在血液中循环,所以对ctDNA的检测可以及时反映肿瘤状态.随着高度特异性及灵敏性的新技术不断涌现,通过ctDNA检测可以分析肿瘤基因和表观遗传的改变.ctDNA广泛应用于肿瘤分子分型、评估肿瘤动态和肿瘤负荷、检测微小残留病灶和复发、预后评估、监测耐药和发现新治疗靶点.本文从以上几方面综述ctDNA在临床应用中的进展.
