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2011年北京地区儿童病例A组链球菌超抗原基因特征研究
目的 分析2011年北京市儿童来源A组链球菌(GAS)临床分离株13种超抗原基因的携带情况及其与病例特征和emm分型间的关系.方法 2011年5-7月在北京市36家医院收集儿童来源GAS临床分离株635株.采用实时荧光PCR方法检测菌株超抗原基因speA、speB、speC、speF、speG、speH、speI、speJ、speK、speL、speM、smeZ、ssa的携带情况,PCR法扩增M蛋白N末端基因片段,并对产物测序确定GAS的emm型别.结果 13种超抗原基因的携带率分别为speA (22.4％)、speB (100.0％)、speC (99.4％)、speF (99.7％)、speG (99.7％)、speH (76.4％)、speI(76.2％) 、speJ(21.7％)、speK(0.6％) 、speL(1.1％) 、speM(2.2％) 、smeZ(99.7％)、ssa(98.0％),共观察到26种超抗原谱.超抗原speA、speH、speI、speJ在emm1和emm12型GAS间分布的差异有统计学意义(P＜0.05).致咽部感染菌株超抗原speK和speL的检出率高于致猩红热菌株(P＜0.05)；而对ssa的携带率低于致猩红热菌株(P＜0.05).结论 2011年北京市儿童来源GAS对超抗原基因speB 、speF、smeZ 、speG 、speC和ssa的携带率较高,speM、speL和speK的携带率较低.GAS的emm分型与超抗原基因间存在密切联系.未观察到超抗原基因speA和speC在致猩红热和致咽部感染菌株间的分布差异.
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中国儿童A族链球菌感染菌株emm分型及超抗原基因谱分布
目的 研究A族β溶血性链球菌感染菌(GAS)株emm分型及其超抗原在我国儿童中的分布情况.方法 用聚合酶链反应(PCR)联合测序对2005年～2006年中国5家儿童医院的222株A族β溶血性链球菌感染的临床菌株进行emm分型;PCR检测speA,speC,speH,speI,speG,speJ,ssa和SMEZ超抗原基因的分布情况.结果 共检测到9个emm型,emm12为主占55.86%(124/222),其次emm1占39.64%(88/222);78.39%的A族溶血性链球菌(GAS)分离株携带有6个或以上的超抗原基因,emm型和超抗原基因谱之间存在密切联系.结论 中国儿童GAS感染流行菌株具有emm型分布集中和超抗原基因携带率高的特点,不同的emm分型有不同的超抗原基因谱,这将为我国GAS疫苗的研制提供重要的分子流行病学依据.
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应用emm基因序列分析对104株A群链球菌分型
目的通过emm基因序列分析对A群链球菌(GAS)进行分型,探讨T型与emm型的对应关系. 方法用引物以PCR法扩增GAS M蛋白的N末端并进行测序,确定GAS的emm型,并与T分型对照比较. 结果 (1) 104株菌株中,emm1所占比例大,为29.8%,然后依次是emm18(9.6%),emm12(7.7%),和emm69(5.8%)等.(2) T1、T12和T14/49与emm基因对应关系好,T1 16株全部对应emm1型(100%),T12对应emm12,符合率83.3%,T14/49 2株均对应emm49型;其它菌型对应关系差;同一T型可对应数个emm基因型,同一emm基因型可对应不同的T型.(3) 发现1株新的emm型菌株,序列已递交GenBank,注册号为AY347259. 结论 emm基因分型方法具有准确、快速、分辨力高的优点;我国部分地区A群链球菌emm基因分型主导型为emm1、18、12、69、110等菌型.
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上海市嘉定地区感染患儿分离的化脓链球菌分子流行病学分析
目的：了解上海市嘉定地区感染患儿分离的化脓链球菌emm分型及其耐药特点，为临床治疗和感染控制提供相关信息。方法收集2014年11月至2015年7月在上海交通大学医学院附属瑞金医院北院门诊就诊的急性上呼吸道感染、急性扁桃体炎、急性咽炎等患儿或带菌者咽拭子样本分离的化脓链球菌75株。应用API 20 Strep链球菌鉴定板条进行菌株鉴定，并用纸片扩散法检测菌株对8种常用抗菌药物的敏感性。应用聚合酶链反应（PCR）扩增编码M蛋白的emm基因，对PCR扩增后的emm基因产物进行测序，通过比对，获得菌株的emm分型结果。采用脉冲场凝胶电泳（PFGE）分析不同emm基因型菌株的特征，并将75株化脓链球菌结果导入BioNumerics软件进行聚类分析。结果上海市嘉定地区化脓链球菌对红霉素、克林霉素的耐药率分别为94.7%和97.3%，对红霉素和克林霉素的双重耐药率为93.3%。具有相同emm基因型的菌株在PFGE带型上高度聚集，其中存在占优势的PFGE型。在临床分离的75株化脓链球菌中，emm1基因型菌株25株（33.3%，25/75），emm12基因型菌株49株（65.3%，49/75），emm22基因型菌株仅1株（1.3%，1/75）。结论目前上海市嘉定地区儿童咽拭子样本分离得到的化脓链球菌对红霉素普遍耐药，且与克林霉素存在较严重的交叉耐药现象。emm12或emm1基因型菌株是上海市嘉定地区儿童主要感染的化脓链球菌类型。
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北京市丰台区2011-2014年A组乙型溶血性链球菌emm基因分型及耐药基因分析
目的 了解北京市丰台区2011-2014年A组乙型溶血性链球菌(GAS)的基因分型及对红霉素耐药基因谱的特点.方法 用猩红热、扁桃体炎或咽峡炎患者的咽拭子进行细菌分离培养,应用PCR方法检测emm基因及耐药基因ermA、ermB、mefA、转座子基因Tn 916.结果 北京市丰台区2011-2014年感染GAS的emm 12.0基因型占78.33％,其次为emm 1.0基因型(20.00％)、emm 22.3基因型少(1.67％);耐药基因ermB及转座子基因Tn916的携带率均为100.00％,所有菌株都不携带耐药基因ermA和mefA.结论 北京市丰台区2011-2014年感染GAS的流行株为emm 12.0型;本地区菌株对红霉素耐药率较高,菌株间耐药基因扩散现象明显.
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广东省新兴地区儿童致病性A组链球菌emm基因测序分型的研究
目的 了解新兴地区儿童感染A群链球菌(GAS)emm基因型的分布状况.方法 收集本院门诊和住院的呼吸道感染、皮肤化脓感染、风湿热、猩红热患儿咽拭子和皮肤感染伤口分泌物进行培养,并采用PCR法扩增GAS的M蛋白N末端,进行测序,确定GAS的emm基因分型.结果 共分离鉴定出GAS98株,GAS感染引起的咽炎、扁桃体炎、脓皮病在学龄前儿童和学龄儿童中发病率较高;98株GAS的emm基因型以emml(35.7%)、emm18(13.3%)、emm12(9.2%)多见.结论 学龄前儿童和学龄儿童感染GAS发病率无年龄差异(P>0.05).新兴地区A群链球菌emm基因分型主导型为emml、emm18等菌型,可初步认定它们是主要流行菌株,作为合适本地的基因疫苗的基础.
