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乙型肝炎病毒前S1抗原关键表位基因分型及其与全长前S1抗原基因型的相关性

张晓晨;李玉敏;李家亿;康新迪;何欣悦;牛俊奇;温晓玉;刘镇宁

摘要: 目的 明确乙型肝炎病毒(HBV)大表面蛋白前S1区(PreS1)两个重要表位在中国乙型肝炎患者群中的基因型分布,探讨两表位基因型之间及两表位基因型与PreS1全长基因型之间的相关性,确定能否根据关键表位的多肽序列判断PreS1全长基因型. 方法 从患者血清中提取HBV DNA进行PCR扩增,对扩增成功的278例样本进行DNA测序,并与GenBank中已知的HBV序列比对,确定HBV大表面蛋白PreS1的两个关键表位(第21 ~ 47号氨基酸表位和第94 ~ 117号氨基酸表位,分别简称为P21表位和P94表位)基因型及PreS1全长基因型,并对3组基因分型结果进行一致性分析.一致性检验采用Kappa分析. 结果 成功测序232例样本.根据P21表位蛋白序列的分型结果为:C基因型201例,B基因型23例,基因型不确定8例.根据P94表位蛋白序列的分型结果为:C基因型199例,B基因型25例,基因型不确定8例.根据PreS1全长序列的分型结果为:C基因型207例,B基因型25例.P21表位基因分型和P94表位基因分型与PreS1全长基因分型结果均高度一致,分别为96.55%和96.12%(Kappa值分别为0.841,0.826),且两表位的基因分型结果也具有很好的一致性(93.10%,Kappa值为0.718). 结论 本研究创新性地提出基于关键表位氨基酸序列的基因分型方法,验证了中国乙型肝炎患者群的HBV基因型以B和C基因型为主,且HBV PreS1关键保守表位的基因分型结果与全长基因分型结果具有高度一致性(>96%),可以采用一个或两个关键保守表位的基因分型代替全长基因分型.

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