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长链非编码RNA在桥本甲状腺炎合并甲状腺乳头状癌中的表达研究
目的 探讨及分析长链非编码RNAs(lncRNAs)在PTC合并桥本甲状腺炎(hashimoto's thyroiditis,HT)及不合并HT组织中的表达差异.方法 选取55例甲状腺手术组织标本,利用高通量lncRNA基因芯片检测PTC合并HT(A组)及不合并HT(B组)之间lncRNAs的表达谱差异,并通过QRT-PCR进行验证.结果 芯片共筛选出1 031条差异表达的IncRNAs和1388条mRNA;GO分析显示了免疫系统进程、免疫反应等生物学过程发生了明显变化;QRT-PCR验证发现uc002stn.1、ENST00000452578及uc002sti.1这3个lncRNAs在A组和B组中表达存在明显差异.结论 PTC合并HT与不合并HT中存在明显的IncRNAs差异表达,且这些lncRNAs及某些生物学过程可能在HT恶变过程中发挥重要作用.
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长链非编码RNA在胰腺癌中的作用机制与临床应用价值
胰腺癌作为世界上致死率极高的一种肿瘤,其发病机制并未得到完全揭示.众所周知,在高通量测序中,一些长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在肿瘤的发生与发展过程中表达量发生显著变化.近年越来越多的研究表明,lncRNA可在肿瘤细胞的生长、增殖和分化等方面发挥作用;在胰腺癌诊断、治疗和预后预测中的潜在价值亦备受关注.文章对lncRNA在胰腺癌中的分子作用机制与临床价值作一综述.
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长链非编码RNA GHET1在肝癌肝移植组织中表达上调对患者预后的影响
目的 探讨长链非编码RNA GHET1对肝癌肝移植患者预后的影响,探讨其可否作为检测和治疗肝癌肝移植的潜在分子靶标.方法 收集20例肝癌组织及其对应的癌旁组织.另外收集106例肝癌肝移植患者的组织,根据是否复发肝癌分为复发组与未复发组,根据GHET1表达分为高表达组与低表达组.采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测所有组织的GHET1表达,结合临床资料分析GHET1表达与肝癌肝移植临床病理特征和预后的关系.结果 与邻近正常组织相比,GHET1在肝癌组织中表达增高(P<0.001),临床病理学特征分析结果表明GHET1表达与肿瘤包膜(P<0.001)、肿瘤直径(P<0.01)、分化程度(P<0.01)、血管侵犯(P<0.01)和TNM分期(P<0.01)密切相关,差异具有统计学意义,而与患者的年龄、性别、肝硬化、血清AFP水平、血清NLR值、肿瘤位置和肿瘤数量无关(P>0.05).106例肝癌肝移植患者的组织中,复发组与未复发组相比,GHET1表达明显升高(P<0.001);高表达组与低表达组相比,累积复发率明显升高(P<0.05),累积生存率明显下降(P<0.001),差异具有统计学意义.结论 GHET1过表达与临床病理资料和不良预后相关,提示GHET1可能参与肝癌的发生和发展过程,可以作为肝癌肝移植患者疾病预后标志物和临床治疗靶标.
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长链非编码RNA与胃癌的关系
胃癌(GC)是常见的消化道恶性肿瘤之一,在恶性肿瘤死亡患者比例逐年增加.尽管大多数的患者在胃癌的早期阶段可以通过手术治愈,但超过一半晚期胃癌的患者仍死于胃癌复发,甚至是接受胃癌切除术治疗后的患者.造成胃癌总体存活率低下的一个主要原因是缺乏明确的分子生物标记物,从而导致大多数GC患者在早期难以诊断,进而错过了手术治疗的黄金时间.近年来对于IncRNAs的研究使我们对于GC的早期诊断及治疗看到了希望,诸多证据表明,许多IncRNAs在GC中特异表达,而他们的异常表达与胃癌发生,转移,预后和诊断存在着密切的关系.本文将阐述不同IncRNAs在胃癌细胞及组织中的异常表达,以期为胃癌的研究提供帮助.
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长链非编码RNA在造血系统中的研究进展
长链非编码 RNA（lncRNA）可在遗传水平、转录水平、转录后水平等多层面上通过多种机制调控基因表达，参与生理、病理过程，与多种人类重大疾病关系密切。 lncRNA 在造血细胞成熟、分化过程中也起重要的调控作用，深入探索其作用机制可为血液疾病的诊治提供新思路。
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长链非编码RNA与mRNA在胰腺癌中的差异表达及其预后价值
目的:对基因芯片表达汇编(GEO)数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的胰腺癌数据进行生物信息学分析,探讨长链非编码RNA(lncRNA)与mRNA在胰腺癌中的差异表达和预后价值.方法:首先对GEO数据库中的胰腺癌数据注释获得mRNA和lncRNA,并对芯片中的mRNA和lncRNA取交集获得差异mRNA和lncRNA.然后对差异mRNA和lncRNA进行基因分析,同时对TCGA数据库中胰腺癌的相关数据进行生存分析.结果:通过基因分析获得与胰腺癌相关可信度高的差异mRNA 1147个,lncRNA 336个,通过基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,构建lncRNA-mRNA共表达网络、lncRNA-mRNA-pathway网络、信号通路关系网络及蛋白质相互作用网络,结果证明mRNA和lncRNA对胰腺癌的发生发展有着重要影响;生存分析发现有12个lncRNA与胰腺癌的预后相关,分别是ATP1A1-AS1、CBR3-AS1、CTD-3080P12.3、FAM66D、FAM87A、FLJ38576、LINC00476、LINC00574、LINC01554、PYY2、LINC00857、OVOL1-AS1.结论:lncRNA对胰腺癌的发生发展及预后有显著影响,有望为胰腺癌的靶向治疗和预后评估提供新的治疗靶点和分子标志物.
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MARDHRS4的鉴定及其对DHRS4转录的调节
目的:筛选新的小鼠DHRS4反义链转录本并对其功能进行研究.方法:采用快速cDNA末端扩增方法,从小鼠正常肝细胞株NCTC1469中克隆DHRS4反义链转录本,据此转录本设计合适siRNA,然后转染NCTC1469细胞,转染成功36 h后应用RTqPCR检测细胞内DHRS4 mRNA水平的改变.结果:成功克隆出1个新的天然反义RNA,全长835 nt,属于长链非编码RNA (longnon-coding RNA,LncRNA),命名为MARDHRS4,应用siRNA干扰MARDHRS4后,DHRS4 mRNA降低约40%.结论:来自DHRS4反义链的LncRNA MARDHRS4具有增强DHRS4转录的作用.
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长链非编码RNA作为急性心肌梗死标志物的研究进展
长链非编码RNA,是一类长度大于200nt,不编码蛋白质的RNA.长链非编码RNA通过基因印记,染色体重构,剪切调控,mRNA降解和翻译调控等方式调节基因的转录和翻译.研究表明,长链非编码RNA参与多种心血管疾病发生、发展的重用调控因子,与急性心肌梗死关系密切.
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长链非编码RNA PVT1对MDA-MB-231细胞增殖和侵袭能力的影响
目的：探讨长链非编码RNA PVT1（lncRNA-PVT1）对于乳腺癌细胞系MDA-MB-231增殖和侵袭的影响。方法构建pcDNA3.1-PVT1表达载体，并将其转染入MDA-MB-231细胞，用实时定量PCR方法检测转染细胞中lncRNA-PVT1的表达，用Edu标记技术检测转染细胞的增殖能力，用Transwell实验检测转染细胞的侵袭能力。结果构建成功的pcDNA3.1-PVT1重组质粒转染入MDA-MB-231细胞后lncRNA-PVT1表达增加；转染细胞的增殖能力增强；转染细胞的侵袭能力增强。结论lncRNA-PVT1能增强MDA-MB-231细胞的增殖和侵袭能力。
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长链非编码RNA RP11-307P5.2在喉癌及喉咽癌中的表达特点
目的 对喉癌及下咽癌中异常表达的lncRNA进行探讨.方法 从Gene Expression Omnibus(GEO)收集喉癌、喉咽癌及头颈部正常黏膜上皮的高通量芯片数据,利用ncFANs筛选出喉癌及喉咽癌中显著异常表达的lncRNA.收集44例初发喉癌及喉咽癌患者的临床数据及新鲜组织标本,提取RNA,通过RT-PCR验证显著异常表达的lncRNA.结果 共筛查出7个lncRNA在肿瘤及正常组织的表达量之间存在显著差异,其中仅有RP11-307P5.2在喉癌及喉咽癌组织验证中显著低表达,与电脑筛选结果一致.此外,晚期病例中的RP11-307P5.2表达量较早期病例中显著降低.结论 RP11-307P5.2缺失与喉癌及喉咽癌的发生发展密切相关,未来仍需进一步探明RP11-307P5.2在喉癌及喉咽癌发生发展过程中的具体作用位点及机制
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c-Myc转录上调长链非编码RNA ZEB1-AS1促进结直肠癌细胞增殖
目的 探讨长链非编码RNA ZEB1-AS1在结直肠癌中高表达的机制及其在结直肠癌中的作用.方法 实时荧光定量PCR检测结直肠癌细胞和组织中ZEB1-AS1的表达,分析其表达量与患者预后的相关性.生物信息学预测ZEB1-AS1转录因子结合位点,双荧光素酶报告基因进行转录因子验证.MTS方法检测ZEB1-AS1对结直肠癌细胞增殖能力的影响.结果 ZEB1-AS1在结直肠癌细胞和组织中高表达,且与结直肠癌患者较差的预后正相关.转录因子c-Myc在ZEB1-AS1启动子上有一个结合位点.过表达c-Myc转录上调ZEB1-AS1的表达,反之亦然.MTS结果显示过表达ZEB1-AS1促进结直肠癌细胞增殖,而敲低ZEB1-AS1则抑制该细胞的增殖能力.结论 c-Myc转录上调ZEB1-AS1,进而促进结直肠癌进程.c-Myc/ZEB1-AS1或许可作为结直肠癌治疗的潜在靶标.
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ceRNAs在结直肠癌中的研究进展
结直肠癌在我国乃至全球范围发生率和死亡率都居于前列,严重危害着人体的健康,虽然结直肠癌的诊断和治疗技术不断提高,但中晚期结直肠癌患者的生存期仍然不佳,因此需要深入理解结直肠癌的发生发展机制,竞争内源性RNA理论的提出加深了对肿瘤形成机制的理解.竞争内源性RNA理论认为假基因转录本、长链非编码RNA、环状RNA、mRNA能作为竞争性内源性RNA,它们拥有编码蛋白mRNA相同microRNA反应元件,能竞争结合microRNA的结合位点,影响功能蛋白的表达而发挥促癌或抑癌的作用.近来大量研究表明竞争性内源性RNA分子在结直肠癌恶性行为中发挥重要功能,因此有必要对这些研究进行归纳梳理,本文目的 在于将这些在结直肠癌中研究的竞争性内源性RNA分子进行归类,并阐述这些分子在结直肠癌中的作用.
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长链非编码RNA在胶质母细胞瘤中异常表达研究
背景与目的:近来研究表明,长链非编码RNA在胶质瘤的发生与发展中发挥重要作用.本研究旨在通过基因芯片分析lncRNAs在胶质母细胞瘤(GBM)和正常脑组织中的表达概况,比较lncRNA差异表达与组织之间的表达谱差异.方法:应用基因芯片技术检测lncRNAs在GBM和正常脑组织的表达谱差异,并筛选出差异表达lncRNA进行分析.结果:lncRNA芯片的数据:原发性胶质母细胞瘤与正常脑组织中LncRNA表达上调3倍基因2032个,LncRNA表达下调3倍基因2036个(P＜0.01).其中21个lncRNAs上调30倍以上,7个lncRNAs下调超过30倍(P＜0.01).结论:利用lncRNA基因芯片较大规模地对胶质瘤中的lncRNAs差异表达进行探讨,对lncRNA在其中的功能及潜在的基因治疗功能具有十分重要的意义;差异表达的lncRNAs包括一些抑癌及促癌lncRNA,其在胶质母细胞瘤的发展中扮演重要的角色,通过它们的目标基因在GBM的复发和恶性进展中发挥作用.
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MicroRNA与胶质瘤
已经有越来越多的证据表明基因组的非编码序列的转录对于生命活动具有重要的意义,相对于蛋白编码序列以及各种小分子RNA,miRNA的研究还仅仅处于起步阶段,其功能与调控机制仍有待进一步研究.本文对目前关于miRNA与胶质瘤关系的研究进展进行综述,认为miRNA可能为胶质瘤诊断和治疗提供新依据和靶点.
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外周血长链非编码RNA-同源盒基因反义转录RNA与卵巢癌术后转归关系及意义
目的 探讨外周血长链非编码RNA(LncRNA)-同源盒基因反义转录RNA(HOTAIR)与卵巢癌术后转归的关系及意义.方法 选取自2014年5月至2016年5月武汉大学中南医院收治的138例卵巢癌患者为研究对象,根据复发情况将患者分为复发组(n=37)和未复发组(n=101).比较两组患者术前、后的血清糖类抗原125(CA125)水平及LncRNA-HOTAIR表达情况;应用受试者工作特征曲线(ROC)分析CA125和LncRNA-HOTAIR对患者术后转归的预测价值.结果 复发组的血清CA125水平、外周血LncRNA-HOTAIR表达均高于非复发组,组间比较,差异有统计学意义(P<0.05).ROC曲线分析结果显示,术前、术后LncRNA-HOTAIR和CA125对卵巢癌术后复发均有较高的预测价值,术前LncRNA-HOTAIR和CA125的佳工作点分别为2.75和356.7 U/ml,术后LncRNA-HOTAIR和CA125的佳工作点分别为1.62和46.3 U/ml.结论 外周血LncRNA-HOTAIR表达水平与卵巢癌术后转归密切相关,可作为血清CA125的辅助指标对术后复发做出预测.
关键词： 长链非编码RNA 同源盒基因反义转录RNA 血清糖类抗原125 卵巢癌 术后转归 -
HPV与长链非编码RNA关系的研究新进展
人乳头瘤病毒（HPV）与宫颈癌等疾病的发病密切相关。研究证实，HPV的致病作用可能与长链非编码RnA （lncRnA）存在一定的联系。本文对HPV与lncRnAs的研究新进展做一综述。
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肝癌ceRNA调控网络的分析研究
目的:通过对TCGA数据库中肝癌和癌旁组织lncRNA、miRNA和mRNA进行差异表达分析,研究lncRNA、miRNA和mRNA对肝癌发生发展的影响.方法:用得到差异表达的lncRNA、miRNA和mRNA构建肝癌ceRNA调控网,明确肝癌中lncRNA、miRNA和mRNA之间相互作用的关系及其对肝癌发生发展的影响;为了进一步明确ceRNA调控网对肝癌疾病的作用,对ceRNA调控网中的mRNA进行GO注释分析、KEGG通路分析和蛋白互作分析.结果:发现调控网中的mRNA在肿瘤MiRNAs、细胞周期、膀胱癌、黑色素瘤、小细胞肺癌、胰腺癌、前列腺癌、结肠癌、P53信号通路、PI3K-Akt信号通路、TGF-β3信号通路等18个KEGG信号通路中明显富集(校正后的P＜0.01),通过对肝癌ceRNA调控网中的lncRNA、miRNA和mRNA进行Kaplan-Meier曲线分析,筛选与肝癌预后有明显相关性的lncRNA、miRNA和mRNA.结论:lncRNA LOC107985899影响miRNA-137的表达,从而调控mRNA MITF的表达;lncRNA C2orf48、C10orf91、LINC00114影响miRNA-204的表达,从而调控mRNA ITPR1、BCL2、AP1S2、TGFBR2、SLC43A1、PRLR、ZCCHC24、ANGPTL2、CHRDL1的表达;lncRNA LOC 107985899影响miRNA-222的表达,从而调控mRNAESR1、TIMP3、ZEB2、GALNT3的表达.
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lncRNA MALAT1在2型糖尿病微血管病变中的致病性作用
随着2型糖尿病患病率的持续升高,糖尿病引发的微血管及大血管病变已引起广泛关注,血管并发症与糖尿病的死亡率直接关联.微血管病变是糖尿病血管并发症中的重要并发症之一,目前对其发病机制尚未完全了解,主要与高血糖相关的葡萄糖毒性产物的形成及其干扰细胞信号通路,从而引起内皮细胞功能障碍相关.人类基因组包含有大量转录但不翻译成蛋白质的RNA序列,其通过不同的机制控制和调节着细胞功能.随着研究的深入,一类长度>200个核苷酸的非编码RNA,即长链非编码RNA(long intergenic noncoding RNA,lncRNA),逐渐受到关注,其中肺腺癌相关转录本1(metastasis associated lung adenocarcinoma transcript 1,MALAT1)初被发现是一种与肿瘤相关的lncRNA,也称为非编码核内富含转录物2,参与调节基因表达的剪接和控制表观遗传.目前的研究显示,MALAT1参与了糖尿病微血管病变的发病,对其进一步深入研究将可为糖尿病并发症的预防和治疗提供相应的策略.
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与前列腺癌相关的长链非编码RNA研究新进展
长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNA)指的是长于200核苷酸的不编码蛋白质的转录物.以往学者们认为,lncRNA在基因表达过程中属于一类具有重要能力的调控因子.lncRNA的不正常表达和恶性前列腺肿瘤发生发展有着极为重要的相关性.结合实际情况,本文全面分析了lncRNA与前列腺癌的新进展情况,旨意为相关学者的研究工作提供参考建议.
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长链非编码RNA H19与胃癌
长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸的非编码RNA的总称.近年发现,lncRNA可在表观遗传、转录和翻译等不同水平发挥基因表达和调控作用,参与肿瘤的发生和发展.LncRNA H19是早被发现与肿瘤相关的长链非编码RNA,在不同肿瘤中表现出癌基因或抑癌基因特性.本文就lncRNA H19与肿瘤的相关研究,以及其在胃癌增殖、凋亡、浸润、预后等相关机制进行了综述.
