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  • HCV5'非编码区基因分型与病毒复制水平的分析

    作者:王越;雷金娥;段巍;江啸;穆丽君;惠凌云;史雯欣;周聪雅;杜忆华

    目的 研究丙型肝炎病毒(Hepatitis C Virus,HCV)的基因分型与各基因型的病毒复制水平,为判断病情及抗病毒治疗提供参考.方法 收集未经抗病毒药物治疗的抗-HCV阳性血清标本60份,经逆转录聚合酶链反应(Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)及核苷酸序列分析HCV的5'非编码区,对标本进行基因分型,并采用定量-PCR检测患者的血清HCV-RNA含量.统计学数据用Graphpad Prism 5.0和SPSS21.0软件进行分析.多组间的比较采用方差分析,两独立样本比较的t检验.结果 本研究人群中HCV各基因亚型的检出率依次为1b型48.3%(29/60)、3 a型23.3% (14/60)、1a型16.7% (10/60)和2a型10%(6/60),并检出一例2c亚型.HCV各基因亚型的血清平均病毒RNA含量的对数值log10(IU/ml)和标准差分别是:1a型5.46±1.19、1b型6.22±0.78、2a型5.47±0.65、3a型5.38±0.98 log10 (IU/ml).结论 本研究人群中1型HCV感染率显著高于2型和3型的感染率(P<0.01).1b亚型组血清HCV-RNA含量显著高于1a、2a和3a亚型感染人群的血清HCV-RNA含量(P<0.05).研究HCV准确的基因分型与血清HCV-RNA含量,有助于对各基因型丙型肝炎患者抗病毒治疗方案的制定.

  • HIV感染对HCV肝损害病毒水平和基因分型的影响

    作者:刘春云;孔蕾;普冬

    目的:了解HIV感染者合并HCV 感染后导致的丙型肝炎比单纯感染HCV时,在肝功能、病毒水平以及基因分型方面的影响及意义.方法:HCV DNA定量检测采用荧光实时聚合酶链反应(PCR)法,丙型肝炎患者基因分型检测采用RT-PCR体外扩增法结合DNA反向点杂交技术检测.结果:40例HIV/HCV感染者的肝损害程度及病毒水平明显高于单纯HCV感染者水平,而在基因分型方面比较,差异无统计学意义(P>0.05).结论:HIV/HCV 混合感染加速了肝脏病度,提高了HCV 病毒水平.HIV/HCV 混合感染对丙型肝炎病毒基因分型无影响.

  • 中国HCV 2a的分子流行病学研究

    作者:王敏;许茹;戎霞;廖峭;黄杰庭;宋丹丹;单振刚;范小苗;尤庆柱;黄珂;付涌水

    目的 对我国HCV 2a亚型的分子流行病学进行研究.方法 收集全国18个省、直辖市HCV感染患者标本776份,逆转录巢式PCR扩增E1基因,通过比对得出HCV基因分型.从NCBI数据库中下载HCV 2a序列作参考序列,与此次的HCV 2a序列进行分析.在 Exponential模型下进行进化树构建以及BSP曲线绘制.结果 扩增E1基因664份,有8种亚型及HCV 6新亚型:1a、1b、1c、2a、3a、3b、6a、6n、6new的例数分别为10、392、3、127、28、48、44、6、6份.进化树分析显示HCV 2a于20世纪60年代早期分成了两簇,cluster Ⅰ全是来自中国的序列,主要是来自西北的序列,cluster Ⅱ包括了来自全球的序列,clusterⅤ、Ⅵ和Ⅶ显示日本与中国形成各自的传播网络,而cluster Ⅷ和Ⅸ均可以看出是由日本传到中国. BSP曲线显示1992—1996年增长速率明显较快.结论 全国范围内,HCV 1b为主要亚型,2a次之,HCV 2a尤其在我国北方、东北、西北等省、直辖市分布比较高,还是应该引起足够的重视.进化分析显示HCV 2a一部分序列是由日本传到中国.

  • 慢性丙型肝炎患者 HCV 基因分型与 HCV-RNA 浓度和凝血功能关系的探讨

    作者:姜树朋;李艳;汪明;乔斌

    目的:探讨慢性丙型肝炎病毒(HCV )患者基因分型与 HCV‐RNA 浓度和凝血功能之间的关系。方法选取该院HCV患者66例作为慢性HCV患者组,健康人群20例作为健康对照组。对该院66例HCV患者采用ABI3500dx基因测序仪进行外周血 HCV‐RNA基因分型检测以及采用罗氏Light Cycler荧光定量 PCR仪进行外周血HCV‐RNA定量检测,对该院66例HCV患者和20例健康体检者进行凝血酶原时间(PT )、活化部分凝血活酶时间(APTT)、凝血酶时间(TT)、血浆纤维蛋白原(FIB)检测。结果在66例 HCV患者中,分别检测出1a、1b、2a、3a、3b和6a型6种病毒基因型,其中基因1型39例,非基因1型27例。不同 HCV基因型患者血清 HCV病毒浓度比较差异有统计学意义(P<0.05)。HCV基因1型和非基因1型之间比较,凝血功能差异均无统计学意义(P>0.05);HCV基因1型和非基因1型分别与健康对照组比较,凝血功能差异均有统计学意义(P<0.05)。HCV‐RNA浓度与PT、APTT、TT、FIB的相关性差异均无统计学意义,相关系数分别为0.020、0.002、-0.072、-0.088(P>0.05);HCV‐RNA低浓度组(<5.0×105 U/mL)和高浓度组(≥5.0×105 U/mL)之间凝血功能比较差异无统计学意义(P>0.05);HCV‐RNA低浓度组和高浓度组分别与健康对照组比较,差异有统计学意义(P<0.05)。结论不同基因型 HCV感染与血液中 HCV的病毒浓度相关,基因1型患者 HCV‐RNA浓度高于非1型患者;HCV基因分型和RNA病毒浓度与凝血功能各项指标大小无关,但是 HCV患者较健康人群凝血功能降低,对于HCV感染者有必要进行凝血功能检查,以便了解 HCV患者凝血功能状态,防止出现严重的出血。

  • 丙型肝炎病毒感染的流行病学

    作者:付涌水

    丙型肝炎病毒(hepatitis C vires,HCV)是丙型肝炎的病原体.1989年由美国学者首次分离,1991年国际病毒分类与命名委员会将HCV归类为黄病毒科丙型肝炎病毒属.由于其高致病性和广泛流行,HCV感染巳成为一个世界性的公共卫生问题,对HCV的研究也成为继乙型肝炎病毒(hepati-tis B vires,HBV)之后的又一热点.

  • 昆明地区人类免疫缺陷病毒(HIV-1)合并丙型肝炎病毒(HCV)感染及丙肝病毒基因亚型分析

    作者:古善群;李重熙;金永梅;田波;白劲松;于闵;刘俊

    目的 了解昆明市2011~2016年新入组进行艾滋病抗病毒治疗HIV/AIDS患者合并丙型肝炎病毒感染情况及丙肝基因亚型情况.方法 收集昆明市第三人民医院感染一科(2011~2016)午新入组进行抗病毒治疗HIV/AIDS患者的临床资料,分析其基线情况,同期我院检验科测序分析HCV基因分型并进一步进行整理分析.结果 近5年HIV-1合并HCV占HIV-1总体感染率19.2%(687/3 571),HCV合并HIV-1感染呈逐年下降趋势(2011年27.3%、2012年24.1%、2013年18.1%、2014年17.5%、2015年14.4%),HIV/HCV共感染率及静脉吸毒患者比例均逐年下降(P=0.000).HIV/HCV共感染322例HCV基因分型以3a(24.2%)、3b(41.7%)型为主,6a(6.2%)、1b(18.6%)、不能确定分型(9.3%),2a(0%),单纯HCV感染2 140例HCV基因分型亚型以2a(12.5%)、3a(18.5%)、3b(41.3%)为主,6a(3.2%)、1b(15.5%)、不能确定分型(9%),经卡方检验两组感染者在各基因亚型之间差异具有统计学意义x2=87.169,P<0.05.).结论 昆明市新入组抗病毒治疗HIV/AIDS患者合并HCV感染较为常见,昆明市HCV基因分型以3a、3b亚型为主,3a、6a、1b亚型在HIV/HCV共感染者中的感染率高于在单纯HCV感染者,而2a基因亚型在HIV/HCV感染者中暂未检出.

  • HCV基因分型在丙肝诊断和治疗中的应用探讨

    作者:常凤霞;董力;闫金南

    目的:探讨HCV基因型同肝病严重程度的关系,研究HCV基因型同疾病治疗的关系,为丙肝诊断和治疗提供理论依据.方法:选取抗-HCV阳性患者的血清标本190份作HCV、RNA检验与HCV的基因分型.结果:HCV基因型与患者肝病严重程度相关,尤其是1b型肝硬化及肝癌比例高于其他基因型;1b型基因病毒应答率显著低于2a型,P<0.05,差异有统计学意义.结论:HCV基因型同肝病严重程度关系密切,并对抗病毒治疗影响重大.HCV基因分型对于患者的诊断及治疗具有重要指导意义.

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