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遗传发育文献资料
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柯萨奇病毒A组16型河南省分离株基因组序列分析
为了解河南省手足口病患者标本中分离柯萨奇A组的16型(CoxA16)病毒基因组特征,对2010年采集的手足口病患者临床标本406份进行RT-PCR扩增和病毒分离鉴定;通过10对引物分段扩增和拼接CoxA16分离株基因组序列,利用生物信息学软件对序列分析,构建序列遗传发育树.测序获得河南省CoxA16分离株HN1162/HN/CHN/2010基因组全长序列7 411bp,5'非编码区(5'UTR)、P1、P2、P3、3'非编码区(3'UTR)区域核苷酸序列与GenBank公布的其它分离株相似性分别为87.0％～97.9％、77.0％～95.4％、80.3％～96.9％、77.9％～96.2％、80.5％～100％;VP1区核苷酸相似性为91.4％～96.4％,氨基酸相似性为99.3％～99.7％;遗传发育树分析表明与我国深圳、广州、福建分离株处于同一分支.河南省手足口病患者标本CoxA16病毒分离株属于C2基因亚型/B-2基因亚型,对加强该病毒变异检测,预防控制手足口病疫情具有重要意义.
