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Richards模型在甲型H1N1流感大流行实时预测研究中的应用
目的 研究浙江省甲型H1N1流感的流行规律,为有效防控甲型H1N1流感疫情提供科学依据.方法 利用浙江省2009-2010年的甲型H1N1流感发病资料,拟合Richards模型,估计流行拐点、预测发病总数和估算基本再生数R_0.结果 2009年5月至2010年3月,全省共报告甲型H1N1流感病例13 487例,发病率26.04/10万.浙江省甲型H1N1流感的流行分两波峰,2009年9月22日为第一个小高峰下降的拐点,R_0为2.44 (95 % Cl:1.75～3.96).2009年10月10日为第二波峰出现上升的拐点,2009年11月28日为全省疫情出现下降的真正拐点,该拐点在出现后的第16天即能被监测到.全省预测的总病例数为13 642.82例,实际报告13 706例,误差率仅为0.46%,模型拟合的确定系数R(2)为0.999,R_0为1.33(95%CI:1.31～1.35).结论 Richards模型在实时预测甲型H1N1流感流行时效果良好,且能较为及时的监测到流行拐点.
关键词： 甲型H1N1流感 Richards模型 基本再生数 流行拐点 -
学校乙型流感爆发的传播模式研究
目的 探讨乙型流感爆发疫情的时空传播规律,为流感爆发防控提供科学依据.方法 采用易感者-染病者-恢复者(Susceptible - Infected - Recovered,SIR)动力学模型特点以及爆发调查资料计算基本再生数；通过详细流行病学调查,绘制疫情时空传播过程图.结果 该起乙型流感爆发疫情的基本再生数为1.88；疫情历时8d,共出现病例39例,病例均在同一班级,班级罹患率为78.0％:在无干预情况下,新发病例数呈指数增加趋势,随着时间推移,病例出现的空间顺序有很明显的规律,先从左到右再覆盖至整个班级,新发病例均在上一代病例的附近出现.结论 乙型流感在学校爆发时具有较强的传播能力,近距离飞沫传播可能是此次流感爆发的主要传播途径,应及早采取隔离治疗患者、减少近距离接触、加强健康宣教等防控措施.
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WONCA研究论文摘要汇编--西非爆发埃博拉病毒病：流行9个月的情况和后续预测
背景2014年3月23日WHO发布了几内亚爆发埃博拉病毒病（EVD）的通知，8月8日WHO认定此次爆发的流行病属于“世界关注的公共卫生紧急事件”。方法截止至2014年9月14日，已经有疑似和确诊病例4507例，其中包括西非5个国家（几内亚、利比里亚、尼日利亚、塞内加尔及塞拉利昂）报告的2296例死亡病例。本研究对几内亚、利比里亚、尼日利亚及塞拉利昂报告的3343例确诊病例和667例疑似病例的数据子集进行细化分析。结果大多数感染者的年龄处于15～44岁（49％为女性），估计病死率为70.8％〔95％CI （69，73）〕。此次爆发与以往状况类似，包括感染体征和症状、潜伏期（11.4 d）及连续间歇期（15.3 d）。根据初期成倍增长速度，估算基本再生数目（ R0）：几内亚为1.71〔95％CI （1.44，2.01）〕；利比里亚为1.83〔95％CI （1.72，1.94）〕；塞拉利昂为2.02〔95％CI （1.79，2.26）〕。估算当前再生数目（R）：几内亚为1.81〔95％CI （1.60，2.03）〕；利比里亚为1.51〔95％CI （1.41，1.60）〕；塞拉利昂为1.38〔95％CI （1.27，1.51）〕。估算对应倍增时间：几内亚为15.7 d 〔95％CI （12.9，20.3）〕；利比里亚为23.6 d 〔95％CI （20.2，28.2）〕；塞拉利昂为30.2 d 〔95％CI （23.6，42.3）〕。如不改变本次流行病的控制措施，预计到2014年11月2日，累计报告确诊和疑似病例数将超过2万例，其中几内亚5740例、利比里亚9890例、塞拉利昂5000。结论如果控制措施得不到根本性改善，未来几个月内， EVD的患病例数和死亡例数将达到每周几百至几千例，且呈持续增长趋势。
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隔离患者对控制学校甲型H1N1流感暴发疫情效果的数学模拟
目的 采用动力学模型模拟隔离措施在学校甲型H1N1流感暴发疫情处理中的效果.方法 根据甲型H1N1流感疾病特征和学校人口学特点,建立易感者-潜伏期-显性／隐性感染者-移出者(susceptible-exposed-infectious/a-symptomatic-removed,SEIAR)模型,对长沙市某校甲型H1N1流感暴发疫情进行模拟,采用卡方检验评价模拟结果与实际疫情的拟合优度,并确定模型的关键参数.在SEIAR模型基础上引入隔离措施,构建易感者-潜伏期-显性／隐性感染者-移出者-隔离者(susceptible-exposed-infectious/asymptomatic-removed-quarantine,SEIARQ)模型.为方便基层公共卫生工作者,将对患者(显性感染者)的隔离等分为10个等级(10％、20％、…、90％、100％),以评估不同隔离比例的效果.结果 无干预情况下,疫情基本再生数(λ0)为5.64,疫情持续31天,人群感染率高达99.51％.在对显性感染者采取隔离措施后,随着隔离比例的增加,人群感染率(含显性和隐性感染)和人群罹患率(仅含显性感染)逐渐下降.当隔离全部显性感染患者后,可减少63％的罹患率.在只隔离显性感染措施时,仅当隔离比例超过30％,疫情控制效果才相对显著.结论 单纯隔离患者多能降低63％的人群甲型H1N1流感罹患率.各地公共卫生机构应根据当地人力和物力情况,采取部分隔离(隔离比例≥30％)与其他措施相结合的方式阻断甲型H1N1疫情的发展.
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新疆巴州地区梅毒的动力学建模与仿真
目的 建模分析2008-2014年新疆巴音郭楞蒙古自治州(简称巴州)地区梅毒新发病例数据,为巴州地区制定梅毒控制策略提供一些切实有效的定量参考依据.方法 利用2008-2014年新疆巴州统计局报道的梅毒新发病数据,根据梅毒的传播机理和人群性活跃程度,采用传染病动力学的方法构建梅毒动力学模型,对模型进行数值模拟和定量分析.结果 建立了梅毒的传播动力学模型,发现建立的模型拟合效果较好[平均绝对百分比误差(MAPE)=1.59％,均方根百分比误差(RMSPE)=0.68％],基本再生数=1.06[95％置信区间(95％CI):1.01～1.15],该模型预计到2024年新疆巴州梅毒的累积发病数为18 145例,2023年累积发病数为16 465例,2024年新发病数达到1 680例.参数敏感性分析发现,感染率、核心组性伙伴数量和治愈率是影响梅毒流行的主要因素.结论 新疆巴州地区梅毒新发感染有上升趋势,相关部门应加对强高危人群的防控,推广安全套的使用等综合性干预措施来控制梅毒的流行.
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基于季节性动力学模型预测与控制新疆布鲁氏菌病的流行
目的：构建季节性动力学模型,拟合并预测新疆新发的急性人间布鲁氏菌病的流行趋势,提出有效控制布鲁氏菌病的决策依据。方法针对布鲁氏菌病的传播机理分析建立具有周期性传播率的动力学模型,拟合2010—2014年新疆新发的急性人间布鲁氏菌病数量并长期预测波动规律。改变模型参数对基本再生数 R0的影响,可确定消除布鲁氏菌病的措施。结果SEIV模型较好的拟合新疆新发的急性人间布鲁氏菌病季节性波动规律,平均绝对百分比误差MAPE ＝20.3794％,拟合累积新发病数量时 MAPE ＝6.3715％。模型预测2015—2019年疫病数量呈周期性上升,同时估计基本再生数 R0＝1.9028,说明布鲁氏菌病尚不能被消除。参数敏感性分析确定有效策略为：减少羊/牛新出生数量；增大已感染布病羊/牛屠杀率；加强易感羊/牛疫苗接种率；降低疫苗丢失率。结论季节性动力学模型适用于拟合及预测新疆新发的急性人间布鲁氏菌病,具有较高可行性,同时为相关部门提供控制布鲁氏菌病的参考措施。
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2005-2017年新疆14个地州市基于传染病动力学结核病流行状况定量研究
目的 对新疆 14个地(州、市)结核病发病数据进行建模分析,定量给出新疆各地(州、市)结核病的流行状况,并对新疆各地(州、市)结核病新发病数进行预测.方法 采用动力学模型对新疆 14 个地(州、市)2005—2014年的结核病数据进行拟合,利用2015—2017年结核病数据进行验证,对验证结果进行评价,得到各地区参数的估计值和基本再生数(R0),并对各地(州、市)2018—2022年新发结核病数据进行预测.结果 2015—2017 年结核病数据验证结果显示,实际值均落在预测值曲线 95%置信区间内,模型拟合效果良好.南疆喀什地区R0为1 1.38 (95%CI :1 1.33～1 1.50),东疆地区乌鲁木齐市和北疆地区的伊犁哈萨克自治州R0分别为 5.46 (95%CI :5.28～5.50)、2.22 (95%CI :2.18～2.28),南疆地区结核病疫情远高于北疆和东疆地区,尤其是喀什地区结核病疫情严重.2018—2022年预测结果显示,大部分地区结核病新发病数在波动中呈缓慢增长趋势.结论 此结核病动力学模型拟合良好,具有可行性,可以用来预测结核病新发病数,同时应采取干预措施,加强对南疆地区的管理,控制结核病的流行.
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某高校甲型 H1N1流感传播元胞自动机模拟研究
目的：探索元胞自动机（CA）在模拟分析甲型 H1N1流感暴发传播中的应用价值。方法通过中国知识基础设施工程（CNKI）查询2009年1月—2015年3月间公开发表的甲型 H1N1流感相关文献，按纳入标准选择并提取流感疫情数据，并以重庆市某综合性大学2009年10月12日—11月20日发生的一起甲型 H1N1流感疫情为数据原型，利用 Matlab 7．0软件构建 CA 模型，对疫情进行模拟和分析。结果该高校共有在校学生17820名，2009年流感疫情持续时间为40 d，当近距离有效感染发病率为0．04时，CA 模型对此次疫情的模拟情况好，基本再生数为1．202。结论CA 在模拟一定条件下经空气传播性疾病的流行特征方面具有一定的可靠性，可为疾病的预防与控制提供参考依据。
关键词： 甲型 H1N1 流感 元胞自动机 基本再生数 传染病 模型 -
不同隐性感染和传播能力条件下的流感暴发防控措施效果模拟
目的 计算暴发疫情中流感隐性感染比例(p)以及传播能力(基本再生数,R0),模拟不同p和R0条件下的防控措施的效果.方法 系统收集长沙市2004年1月1日-2013年12月31日所有流感暴发疫情资料作为p和R0估计基础数据库,在2011年1月1日-2013年11月30日期间暴发疫情中收集病例的病程资料.根据流感的疾病自然史建立易感者-潜伏期-显性/隐性感染者-移出者(susceptible-exposed-infectious/asymptomatic-removed,SEIAR)模型.将SEIAR模型与所有暴发疫情进行一一拟合,计算各起暴发疫情的p和R0.同时模拟隔离、治疗患者、预防服药、停课1周、暴发前和暴发中的疫苗接种措施的效果.结果 暴发疫情中流感病例病程均数为(4.27±1.98)d,季节性流感暴发疫情的p均数为(0.190 3±0.295 3).流感暴发疫情的R0均数为(10.12±5.16),其中甲型H1N1流感R0均数为(11.32±5.74),季节性流感暴发疫情R0均数为(7.79±2.67),t检验结果显示两者差异有统计学意义(P=0.006).R0和p的大小对隔离效果的影响异质性较大.暴发前疫苗接种措施效果取决于R0,与p值大小无关;R0、P越小,暴发期间疫苗接种的效果以及治疗患者的效果越好;预防服药的总体效果并不明显;停课1周的总体效果较差.结论 甲型H1N1流感隐性感染比例和传播能力均比季节性流感高.流感暴发疫情处置需要根据流感隐性感染比例和传播能力不同采取针对性防控措施.
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我国乙型病毒性肝炎流行趋势的动力学模型拟合分析
目的 探讨中国乙型病毒性肝炎的流行趋势并对现有防控措施进行评估.方法 首先建立数学模型并利用遗传算法拟合中国国家卫生和计划生育委员会每年发布的国家法定传染病疫情中乙肝患者人数,确定模型参数,从而得到HBV基本再生数的估计值;再利用拉丁超立方抽样和偏等级相关系数方法分析各参数对HBV传播的敏感程度.结果 中国HBV传播的基本再生数(95％置信区间0.659 1～0.671 8),说明在现有防控措施下HBV疫情已得到较好控制;敏感性分析结果表明对基本再生数的影响参数从大到小依次为HBV急性患者传播系数(B)、乙肝疫苗的年失效率(ψ)、HBV疫苗接种率(y3)、HBV携带者传播权重(ε)、HBV急性患者未能清除感染的平均概率(q)和HBV携带者向康复人群转化的系数(γ2).结论 现有防控措施对中国乙型病毒性肝炎的流行已产生积极作用,并且现阶段我国HBV疫情传播的主要特点是携带者的影响作用远大于急性患者的影响.加强对社会人群的健康宣教以降低感染风险、严格实施乙肝疫苗接种计划是现阶段防控措施的重点.
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2013-2014年间新疆巴州地区布鲁氏菌病暴发模型研究与评价
目的 探究Richards模型拟合2013-2014年间新疆巴州地区布鲁氏菌病的暴发流行趋势,为制定控制措施提供依据.方法 通过单波形Richards模型拟合每月报告的实际累积发病者数量,检测出布鲁氏菌病爆发的拐点,有助于研究干预措施相对于拐点的影响.估计出模型参数和基本再生数R0.结果 布鲁氏菌病爆发的拐点为2014年6月至7月之间,早于实施各种预防措施.布鲁氏菌病爆发的基本再生数为Ro=1.1207(95％CI:0.6091-1.1379),说明布鲁氏菌病还不能被消除.结论 Richards模型较好的拟合出布鲁氏菌病累积发病者数量,加强控制措施的实施是减少布鲁氏菌病暴发流行的基础.
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结核病筛查策略评估模型
本研究在课题组前期创建的流动人口模型基础上进一步探讨了固定人群对流动人口的影响.模型数值模拟提示,要在全人群中根除结核病,必须保证基本再生数R0<1,即R M0< 1,RL0< 1.利用模型,我们对加拿大移民政策进行了评估,评估结果提示,模型能够有效评估加拿大移民结核病筛查政策,并能够敏感反映政策的实施力度.
