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二至丸对去卵巢所致AD小鼠海马蛋白质组学的影响
目的:应用蛋白质组学方法探究二至丸对去卵巢所致阿尔茨海默病 (Alzheimer's disease, AD) 小鼠的生物学基础的影响.方法:小鼠去卵巢后随机分为4组, 分别为模型组、阳性药组、二至丸高、低剂量组, 每组14只小鼠, 另设14只为假手术组, 术后6周开始给药, 二至丸高、低剂量组分别用对应药物灌胃给药 (2, 1 g·kg-1);阳性药组隔天皮下注射苯甲酸雌二醇0.02 mg;假手术组与模型组灌胃等容量的蒸馏水, 每日1次, 持续给药32 d.取小鼠海马组织, 提取蛋白, Nanol-ESI液相-质谱联用系统检测蛋白, Protein Discovery软件鉴定蛋白, SIEVE软件对海马蛋白进行相对定量定性分析.PANTHER Classification System对差异蛋白进行基因本体 (GO) 分析, 京都基因与基因组百科全书 (KEGG) 富集信号通路.结果:与模型组相比较, 正常组、二至丸高、低剂量组小鼠共有80多个差异表达蛋白, 通过GO分析分析发现这些蛋白可分为微管蛋白、热休克蛋白、能量代谢相关蛋白和脑保护相关蛋白等与AD相关的蛋白;KEGG分析发现以上差异蛋白共涉及20条信号通路, 以上差异蛋白可能是二至丸防治AD的靶点蛋白.结论:二至丸可能通过促进能量代谢与囊泡运输, 同时减少Aβ的生成与神经细胞的氧化损伤来达到治疗AD的作用.
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环状RNA在慢性HBV感染者不同时期的差异表达及生物信息学分析
目的 探讨环状RNA(circRNA)分子在慢性HBV感染者不同时期的差异表达及其作用.方法 收集泰州市人民医院感染病科2014年10月至2015年10月就诊的慢性HBV感染者7例,其中慢性乙型肝炎(CHB)患者4例,慢性HBV携带者3例,3名对照来自健康体检者.采集所有研究对象外周血单个核细胞(PBMC),应用新一代circRNA表达谱芯片检测PBMC中circRNA分子的表达,并通过荧光定量PCR进行验证.采用微小RNA(miRNA)靶预测软件分析circRNA和miRNA的相互作用位点.应用基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)对其靶向miRNA及调控靶基因进行分析.采用SPSS 17.0软件对数据进行分析.结果 与健康对照者比较,CHB患者表达差异的circRNA分子有137个,其中上调89个,下调48个;慢性HBV携带者表达差异的circRNA分子有444个,其中上调130个,上调5倍以上的有34个,下调314个.CHB患者与慢性HBV携带者相比,差异表达的circRNA分子有1041个,其中上调663个,下调378个,下调超过5倍以上的有54个.差异表达的circRNA上具有miRNA应答元件,可与miRNA种子区域的碱基互补配对.靶基因预测分析显示,hsa_circ_0038646相关miRNA调控的靶基因有533个,hsa_circ_0087354分子相关miRNA调控的靶基因有249个.GO分析显示,hsa_circ_0038646分子相关miRNA调控靶基因的功能主要富集于激活素结合等,hsa_circ_0087354分子相关miRNA调控的靶标富集于犰狳重复区域结合等.KEGG分析显示,hsa_circ_0038646分子相关miRNA主要参与T细胞受体结合途径、雌激素受体信号通路等,hsa_circ_0087354分子相关miRNA主要参与粘附连接、MAPK信号途径等.结论 HBV感染不同时期患者circRNA的表达存在差异,差异表达的circRNA可能通过影响相关miRNA分子的多个靶基因及其信号途径参与慢性HBV感染者的免疫调控.
