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miRNA及lncRNA在胃癌中作用机制的研究进展
胃癌是世界上常见的恶性肿瘤之一,严重威胁着人们的健康,探明胃癌的机制对改善预后十分重要.在胃癌发生发展过程中许多基因的表达及活性发生了改变,其中非编码RNA〔包括微小RNA(miRNA)及长链非编码RNA(lncRNA)〕在胃癌中发挥了重要作用.miRNA通过参与肿瘤细胞的生长、迁移、侵袭以及凋亡等过程从而调控胃癌进程,血中循环miRNA对胃癌的诊断和治疗具有重要提示作用.lncRNA能够同时在转录和转录后水平参与调控胃癌进程,它不仅能够通过诱导染色质修饰或调控信使RNA(mRNA)稳定性的方式参与胃癌进程,还可作为竞争性内源RNA(ceRNA)与靶基因竞争结合miRNA,进而参与调控胃癌进程.因此,了解miRNA及lncRNA在胃癌中的具体作用机制,有利于我们对胃癌的机制进行深入的理解,同时也可以为胃癌的诊治提供新思路.
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滑膜肉瘤差异表达基因生物信息学分析
目的 通过生物信息学分析方法筛选滑膜肉瘤组织中关键lncRNA、microRNAs和mRNA,阐述其互相作用机制以及关键信号通路.方法 通过Gene Expression Omnibus (GEO)在线数据库检索并下载人滑膜肉瘤转录组数据,并应用基因本体论分析(Gene Ontology,GO)、京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)、竞争性内源RNA(competing endogenous RNAs,ceRNAs)互作网络分析和蛋白互作网络分析(Protein-Protein Interaction,PPI)对差异表达基因进行深入分析.结果 共4个数据集纳入本项研究包括GSE28866,GSE 18546,GSE2719和GSE42977,包含21个滑膜肉瘤组织和56个正常对照组织,在这些数据集中共获取了12个差异表达的lncRNA,119个差异表达的miRNA和1637个差异表达的mRNA.构建ceRNA调控网络并展示lncRNA-miRNA-mRNA之间的调控作用,发现6个IncRNA(RP11-123K19.1,RP11-261N11.8,MEG3,FOXD2-AS1,CTD-2228K2.7,LINC00982)和7个miRNA(hsa-miR-142-5p,bsa-miR-548c-3p,hsa-miR-1224-5p,hsa-miR-133b,hsa-miR-206,hsa-miR-378-3p,hsa-miR-765)在滑膜肉瘤病变中具有重要作用.KEGG分析示滑膜肉瘤病变与47个信号通路显著相关(P＜0.05),特别是癌症中转录失调的信号通路(P=5.56×10-8).PPI互作网络分析展示了154种蛋白质,6种转录因子和10个信号通路之间的相互作用.结论 通过对在线数据库进行生物信息学分析,滑膜肉瘤的多个关键分子靶点和信号通路被确认,有助于对滑膜肉瘤病变分子发病机制进行深入研究.
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骨髓间充质干细胞多能分化及骨疾病相关LncRNA研究进展
长链非编码RNA (LncRNA)是转录本长度超过200nt的RNA分子,不编码蛋白并在多种层面参与蛋白编码基因调控.骨髓间充质干细胞(BMSCs)是一种多能细胞,是正常组织以及病变组织修复的细胞来源.近期研究表明,LncRNA在干细胞的多能分化以及骨科相关疾病的发生发展起重要的调控作用.本文对与骨髓间充质干细胞成骨分化、成脂分化、成软骨分化及与骨科疾病相关的LncRNA进行综述.
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甲状腺肿瘤相关性非编码RNA研究进展
非编码RNA（non-coding RNA，ncRNA）是指除mRNA、tRNA和rRNA以外，不编码蛋白质的RNA。近年研究显示，ncRNA在细菌、真菌和哺乳动物等多种生物体的活动中可作为癌基因或抑癌基因，对肿瘤的发生、发展发挥调控作用。此外，ncRNA有希望成为肿瘤诊断的新型标志物。本文介绍了一些与甲状腺肿瘤相关的ncRNA新研究进展，并着重讨论微RNA（miRNA）及长链非编码RNA（lncRNA）在甲状腺肿瘤发生、转移中的作用。
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长链非编码RNA在消化系统肿瘤中的研究进展
长链非编码RNA（lncRNA）是一系列广泛转录自人及其他哺乳动物基因组的长度超过200 nt的核苷酸片段，通常没有蛋白编码功能，一度被认为是基因组的转录“噪音”。近年来一些 lncRNA 被发现具有多种生物学功能，成为分子生物学领域研究的热点。已经在多种肿瘤中发现有lncRNA的异常表达，并且异常表达的 lncRNA 和肿瘤的复发、转移及预后有关。本文中将探讨近期发现的与消化系统肿瘤相关的lncRNA，部分着重于具有促癌作用的lncRNA，以期为消化系统肿瘤的诊断、预后及分子治疗提供线索。
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非编码RNA与肿瘤发生发展的关系
非编码RNA(ncRNA)是一类不编码蛋白质的基因转录产物,在细胞分化和代谢等生命活动中起着非常重要的作用.根据大小、结构、功能和保守性的不同,又将ncRNA分为微小RNA (miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)和Piwi相互作用RNA(piRNA)等几类.近些年,ncRNA对肿瘤的调控功能及其发生发展之间的关系研究已成为生物医学热门的研究领域之一.本文将阐述一些非编码RNA与肿瘤发生发展的研究进展,重点讨论几种具有代表性的miRNA和lncRNA与肿瘤发生发展的关系.
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长链非编码RNALOC728290在肝细胞癌患者肿瘤组织中的表达及意义
目的 探讨肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)患者肿瘤组织中长链非编码RNA(long non-coding RNA, LncRNA)LOC728290的表达及其临床意义.方法 应用实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR, qRT-PCR)检测HCC患者手术切除的癌组织及其配对癌旁组织中LncRNA LOC728290的表达水平;统计分析其表达水平与患者临床病理特征之间的相关性,同时结合患者生存时间及预后随访情况,分析LncRNA LOC728290表达水平和无复发生存率之间的关系.结果 83%(54/65)HCC患者癌组织中LncRNA LOC728290的表达量较配对癌旁组织下调(P<0.05);LncRNA LOC728290的表达水平在不同AFP水平、有/无微脉管浸润的患者中,呈显著差异表达(P<0.05);生存分析表明LncRNA LOC728290表达水平低的HCC患者无复发生存率较其表达水平高的患者显著降低(P<0.05).结论 LncRNA LOC728290在HCC患者肿瘤组织中呈显著低表达,其有望成为临床HCC早期诊断、转移及预后评估的潜在分子标志物和治疗靶标.
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竞争性内源RNA与消化系恶性肿瘤关联的研究进展
竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)是一种相互作用的RNA转录本,通过竞争性结合并降低靶标微小RNA(microRNA,miRNA)的水平,解除信使RNA(messenger RNA,mRNA)的抑制作用.miRNA、mRNA、长链非编码RNA、假基因、环形RNA之间形成了密不可分的网络,通过这种复杂的网络互相调节各自的表达水平,从而参与一系列的生物学行为,包括肿瘤的发生.肿瘤相关性ceRNA在消化系肿瘤的形成过程中发挥关键作用,我们对消化系肿瘤相关性ceRNA做简要综述,并简单分析其与靶标miRNA的相互作用,为进一步理解ceRNA介导的肿瘤生成分子机制提供新思路.
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竞争性内源RNA在胃癌发生发展中的作用
胃癌是常见的消化系肿瘤之一,在全球癌症死亡中排名第2位.其发病与遗传、环境及生活习惯等多种因素有关.近几年研究发现竞争性内源RNA成员中微小RNA和长链非编码RNA在胃癌的发生发展起着重要作用.本文就竞争性内源RNA在胃癌中作用作一综述.
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非编码RNA与肝脏疾病
非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是一类不具有编码蛋白质功能的RNA,在复制、转录和转录后等多种水平调控基因表达,参与细胞分化、个体发育和疾病发生发展等多种生物学进程.ncRNA表达或功能异常均与肝脏疾病的发生发展密切相关,目前研究显示肝细胞癌、病毒性肝炎和酒精肝损伤等肝脏疾病中有多种ncRNAs表达水平发生了显著变化,并在疾病的发生发展和预后中起着核心调控作用.因此,ncRNA的研究是生物学研究领域的热点和难点,有望成为肝脏疾病潜在的诊断标准、预后标志和临床治疗靶点.
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胃癌多药耐药在ABC转运蛋白、细胞凋亡和长链非编码RNA方面的研究进展
肿瘤多药耐药指癌细胞对多种不同的抗癌药物的交叉性耐药,可以是原发性的或继发性的,耐药的机制有多种.本文对胃癌细胞通过上调ABC转运蛋白超家族成员的表达使药物外排增加和抑制或逃避细胞凋亡而引起多药耐药以及长链非编码RNA在胃癌多药耐药形成中的作用的研究进展做了总结论述.
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长链非编码RNA-ROR功能的研究进展
在人类基因组中,存在大量的非编码RNA(non-coding RNAs,ncRNAs).近年来随着研究的发展,这些ncRNA已成为继microRNAs和siRNAs之后又一研究热点.长链ncRNA-ROR(large intergenic ncRNA-regulator of reprogramming,lincRNA-ROR),是新发现对细胞重编程过程具有重要调控作用的长链非编码RNA.现有的研究表明,ROR在诱导多能性干细胞(induced pluripotent stem cells,iPSCs)形成、DNA损伤、氧化应激等过程中发挥重要的作用;此外,在肿瘤中,目前发现ROR与乳腺癌、肝癌的发生、转移等密切相关.ROR拥有丰富的生物学功能,但其具体的作用机制尚不明确,本文就ROR的研究背景、发现过程、功能及特点做一概述,对其在肿瘤上的作用及相关调控机制的进行探讨.
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长链非编码RNA在结直肠癌中的作用及临床价值
结直肠癌是常见的消化系恶性肿瘤之一,其发生和发展是一个涉及多因素、多步骤的复杂过程.长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)是一类长度大于200个核苷酸,缺乏开放阅读框,无蛋白质编码功能的RNA.通过诱饵分子、信号分子、支架分子、引导分子等4种形式在转录、转录后和表观遗传学多个水平调控基因的表达,参与了多种疾病的发生发展.同时,LncRNA在结直肠癌的临床应用中也有重大价值,参与结直肠癌的诊断、预防、治疗与预后.本文就近年来人们对于LncRNA与结直肠癌关系的研究进展作一综述,并探讨通过LncRNA治疗结直肠癌的现状和前景.
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心肌梗死长链非编码RNA-相关转录本基因与心血管疾病研究进展
心血管疾病(cardiovascular disease,CVD)目前已成为影响人类健康的主要疾病之一,每年因CVD导致患者死亡的例数逐年增加,尤其是老年人[1].CVD的主要危险因素包括吸烟、高血脂、高血压、糖尿病(diabetes mellitus,DM)、肥胖等非遗传因素[1]以及遗传易感性[2],GWAS分析发现,CVD与基因异常表达存在密切的关系,但分子机制仍不甚清楚.长链非编码RNA (long no coding RNA,LncRNA)是长度＞200bp的转录本,从表观遗传、转录及转录后翻译等多个层面参与基因表达调控,研究发现其与多种疾病如冠心病(coronary heart disease,CHD)、DM、神经系统疾病等有关,因而成为目前研究的重点和热点,如ANRIL与CVD存在着明显的相关性[3].心肌梗死相关转录本(myocardial infarction association transcript,MIAT)作为一种重要的心脏相关lncRNA,尽管MIAT特异性表达于神经系统,但在心脏相关基因的转录、翻译、翻译后调控起着重要的作用,因而本文将对Ln-cRNA-MIAT在心血管疾病的研究进展进行综述.
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长链非编码RNA HIF1A-AS1对缺氧诱导的胰腺癌PANC1细胞自噬的调节作用
目的 观察长链非编码RNA HIF1A-AS1对缺氧诱导的胰腺癌PANC1细胞自噬的调节作用.方法 应用三气培养箱及缺氧混合气体(94%N2、5% CO2、1% O2)缺氧培养胰腺癌PANC1细胞3、6、12、24、36、48 h,实时荧光定量PCR法检测HIF1A-AS1的表达.通过携带HIF1A-AS1过表达的重组腺病毒感染PANC1细胞和通过脂质体将靶向HIF1A-AS1的siRNA转染PANC1细胞分别获得过表达、低表达HIF1A-AS1的PANC1细胞株,以常规培养的PANC1细胞作为对照.对照组、过表达组、低表达组细胞分别缺氧培养24 h,采用实时荧光定量PCR法检测各组PANC1细胞HIF1A-AS1的表达,流式细胞术检测细胞凋亡率,蛋白质印迹法检测自噬相关蛋白Beclin 1的表达.结果 缺氧培养的PANC1细胞HIF1A-AS1的表达随缺氧时间的延长而增加,36 h时达峰值,从6 h开始均显著高于对照组,差异均有统计学意义(P值均<0.01).以对照组表达量为1,过表达组、低表达组细胞HIF1A-AS1的表达量分别为4.49±0.53、0.49±0.07,过表达组高于对照组,低表达组低于对照组,差异均有统计学意义(P值均<0.01).对照组、过表达组、低表达组PANC1细胞经缺氧培养24 h后的细胞凋亡率分别为(8.27±1.28)%、(6.56±1.49)%、(19.9±2.34)%,过表达组低于对照组,低表达组高于对照组,差异均有统计学意义(P值均<0.01);Beclin 1表达量分别为1.05±0.11、1.29±0.19、0.38±0.18,过表达组高于对照组,低表达组低于对照组,差异均有统计学意义(P值均<0.01).结论 HIF1A-AS1可能通过促进缺氧诱导胰腺癌PANC1细胞的自噬,参与胰腺癌的发病过程.
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长链非编码RNAs在心血管疾病中的研究进展
长链非编码RNAs (long noncoding RNAs,lncRNAs)是一类长度大于200个核苷酸,不具有蛋白质编码功能的RNA,过去被视为转录的噪音,但近年的研究表明,它们在基因表达的调控中发挥重要作用.LncRNAs能在表观遗传、转录以及转录后水平多个层面发挥作用.本文概述了lncRNAs的分类及分子作用,并综述了其在心血管疾病中的研究进展.
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长链非编码RNA ASO3973调控内皮细胞IL-6和ICAM-1的基因表达
目的 本研究探索冠心病差异表达长链非编码RNA ASO3973在人脐静脉内皮细胞中对白细胞介素-6(IL-6)和细胞间黏附分子(ICAM-1)的表达调控作用.方法 应用敲低和过表达ASO3973的策略,利用real-time PCR技术检测炎症因子和黏附分子的mRNA表达水平;利用Western Blot和ELISA检测IL-6、ICAM-1的蛋白表达水平;利用免疫荧光流式细胞术检测细胞膜表面ICAM-1的表达.结果 敲低ASO3973导致炎症因子(IL-6、IL-8、IL-1 β)和黏附分子(ICAM-1、VCAM-1)的mRNA水平显著降低(P＜0.05),细胞上清液中的IL-6分泌量显著降低(P＜0.05),细胞总蛋白中IL-6和ICAM-1的蛋白表达水平显著降低(P＜0.05),细胞膜表面ICAM-1的表达显著降低(P＜0.01);过表达ASO3973导致IL-6、ICAM-1、VCAM-1的mRNA表达水平显著升高(P＜0.05),细胞上清液中的IL-6的分泌量显著升高(P＜0.05),细胞膜表面ICAM-1的表达显著升高(P＜0.01).结论 LncRNA ASO3973显著调控内皮细胞IL-6、ICAM-1的基因表达水平.提示ASO3973可能通过调控内皮细胞炎症因子和粘附分子的表达,影响血管内皮细胞功能,参与动脉粥样硬化的发生.
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长链非编码RNA在糖尿病肾脏疾病中作用机制的研究进展
长链非编码RNA(lncRNA)作为一类长度超过200个核苷酸的功能性RNA与许多内分泌和代谢疾病密切相关.研究表明,lncRNA可在多水平调控基因表达,包括参与染色质印记,与表观修饰复合物或转录因子结合发挥转录水平的调控,与miRNA、mRNA或蛋白质结合发挥转录后水平的调控等.lncRNA表达的失调及一级序列的突变或二级结构的改变与许多人类疾病相关,而在糖尿病肾脏疾病(DKD)方面的研究还处于起步阶段.此外,由于部分lncRNA可以在人体液中检测到并且具有良好的特异性和可及性,因此,推测lncRNA可作为DKD诊断和预后的新型潜在生物标记物.
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微小RNA和长链非编码RNA作为心脏疾病生物标志物的研究进展
人类基因组中有超过85%的基因转录为核糖核酸(RNA),但只有约2%的基因转录成编码蛋白质的信使核糖核酸(mRNA),其余均为非编码RNA(ncRNA).ncRNA根据长度分为短链ncRNA[如微小RNA(miRNA)]和长链ncRNA(lncRNA).目前研究发现ncRNA可以通过不同的机制调节心脏功能,同时其调节异常与心血管疾病的发生和发展有很大联系.研究显示,循环血中某些ncRNA稳定性良好,其表达水平异常变化与心血管疾病的病程进展密切相关,提示循环血中的ncRNA具有作为心脏疾病生物标志物的潜在价值.故本文对循环血液中miRNA和lncRNA作为心脏疾病生物标志物的进展进行综述.
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长链非编码RNA在心血管系统中的研究进展
非编码RNA(ncRNA)指由基因组的序列转录形成，但不具备指导蛋白质合成的一大类RNA。其中，分子大于200 nt的非编码RNA统称为长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)。随着高通量测序的出现，lncRNA成为新的研究热点。目前，在心血管领域，科研人员主要从发育、病理生理、临床疾病诊断等方面进行着lncRNA方面的研究，并取得了一系列的成果。本文将从lncRNA的分类、功能等方面简要介绍lncRNA，同时列举近期心血管领域的重要研究成果来介绍lncRNA在心血管领域研究进展以及潜在的临床运用前景。
