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高通量测序技术进行流产组织染色体拷贝数检测的结果分析
目的 探讨高通量测序染色体DNA拷贝数(CNVs)分析技术在流产病因查找中的应用价值.方法 收集2015年11月至2017年11月在甘肃妇幼保健院就诊的266例自然流产患者的流产组织、稽留流产组织、绒毛组织,进行染色体核型分析与CNV检测.结果 266例样本中,核型分析共检测出异常79例,其中,单体17例、三体61例、双重三体1例;CNV分析共检测出155例异常,其中致病性CNVs改变119例,包括非整倍体112例(其中单体26例、三体83例、双重三体3例)、致病性缺失或者重复7例.结论 高通量测序技术可以更全面地发现染色体异常改变,查明流产的遗传学病因,为再次妊娠提供临床建议和遗传咨询.
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不同助孕方式中2318例早孕期自然流产物异常核型比较
目的:探讨辅助生殖技术是否会增加胚胎染色体异常的风险.方法:根据不同受孕方式,将2318例早孕期流产的患者分成体外受精(in vitro fertilization,IVF)组(n=310)、卵细胞质内单精子显微注射(intracytoplasmic sper-minjection,ICSI)组(n=86)、自然妊娠(natural conception,NC)组(n=1922)3组,分析比较3组的异常核型发生率,分析患者年龄与非整倍体发生率间的关系,以及单核苷酸多态性微阵列芯片(single nucleotide polymorphism-based ar-rays,SNP-array)、下一代测序(next generation sequencing,NGS)、传统细胞培养结合G显带这3种不同检测方法的异常核型检出率.结果:2318例流产绒毛中,1420例存在染色体异常,异常率为61.26%,其中异常核型以非整倍体占绝对多数,共发现1040例,发生率为44.86%(1040/2318),占异常核型的73.24%(1040/1420),涉及除1号染色体以外所有染色体,且以16-三体发生频率高,其次为22-三体和45,X单体.IVF组、ICSI组及NC组间的流产物染色体总体异常率差异无统计学意义(57.74%、55.81%、62.02%,P=0.207).但ICSI组的三倍体发生率明显低于NC组及IVF组(0、7.23%、7.42%,P=0.035).当根据流产患者年龄分组时,高龄组(≥35岁)的非整倍体发生率明显高于低龄组(<35岁)(60.25%比40.07%,P<0.01).SNP-array技术 、NGS及核型分析对异常核型的总体检出存在差异(62.94%比53.13%、59.92%,P=0.035),SNP-array技术对非平衡性结构异常、三倍体、微重复和微缺失的检出率高,还能检出单亲二倍体(uniparental disomy,UPD)和杂合性缺失(loss of heterozygosity,LOH),而核型分析对四倍体的检出率高.结论:胚胎染色体异常是自然流产的重要原因;IVF不增加胚胎染色体异常的发生率,但ICSI有增加胚胎性染色体非整倍体风险的趋势.随着母亲年龄的增长,胚胎非整倍体的发生率显著升高.以SNP-array和NGS为代表的分子检测技术有望成为流产物染色体检测的一线方法.
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420例流产物染色体核型分析
目的 探究流产物染色体异常核型.方法 选择420例首次流产(早期流产)患者的宫腔搔刮或负压抽吸的流产物进行染色体核型分析.结果 420例样本染色体核型分析结果正常145例(34.5％),异常230例(54.8％),体外培养未见细胞生长45例(10.7％).230例染色体异常样本中以染色体数目异常为常见,主要有16-三体42例(18.2％)、三倍体28例(12.2％)、X单体25例(10.8％)、四倍体12例(5.2％)、15-三体12例(5.2％),其他类型染色体异常包括染色体片段缺失、重复、插入、易位等.结论 染色体异常是早期流产的重要原因,其中16-三体是常见的染色体异常核型.
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用高通量测序技术检测流产物染色体数目和拷贝数变异的研究
目的 探讨半导体测序平台(semiconductor sequencing platform,SSP)对于检测自然流产物染色体数目改变和拷贝数变异(copy number variations,CNVs)的价值.方法 选择140例于孕7～16周停止发育的胚胎的流产物,提取DNA,制备文库,并对其进行高通量测序.结果 共发现染色体异常82例(58.57％),其中非整倍体67例,以16、21、22和X/Y号染色体为常见.共检出CNVs共15例,其中数据库注释为微缺失或微重复综合征者9例.年龄≥35岁的孕妇与年龄＜ 35岁的孕妇相比差异有统计学意义(P＜0.01).结论 SSP技术能够检出流产物中的染色体数目异常和CNVs.染色体数目异常是早期自然流产的主要原因,而女方高龄则是胚胎染色体异常的高危因素.
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测序技术检测流产物拷贝数目变异的应用
目的:采用测序技术检测拷贝数变异,探讨测序技术在染色体疾病上的应用和拷贝数变异在流产物检测中的应用价值.方法:选择2013年7月至2014年4月在贵阳医学院附属医院贵州省产前诊断中心就诊孕妇中胚胎停止发育的50例患者,孕周为7 ～ 23周,留取流产物,提取DNA,制备文库,高通量测序,对流产物DNA进行测序分析,得出流产物的拷贝数变异.同时对孕妇和流产物做染色体核型分析.结果:50例孕妇的流产物染色体基因拷贝数变异检测,除1例为母源性污染,未得出结果外,测序检出率78％,染色体核型检出率为28％.结论:测序技术检测流产物的检出阳性率高于染色体核型检出率,流产物染色体核型能检出的整倍体改变、非平衡易位改变,测序技术均能检出,且在染色体微缺失微重复检出上优于染色体核型检出,推荐临床上使用对流产物进行测序技术检测查找流产原因.
