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外泌体来源的长链非编码RNA结直肠肿瘤差别表达基因在胶质瘤中的表达
目的:通过基因芯片分析长链非编码RNA(lncRNA)-结直肠肿瘤差别表达基因(CRNDE)在多形性胶质母细胞瘤(GBM)中的表达,比较lncRNA CRNDE差异表达与组织之间的表达谱差异.方法:应用基因芯片技术检测lncRNA在GBM和正常脑组织的表达谱差异,并筛选出差异表达lncRNA CRNDE进行分析.结果:lncRNA芯片的数据:GBM与正常脑组织比较,lncRNA CRNDE表达上调3倍基因1201个,lncRNA CRNDE表达下调3倍基因1206个(P＜0.05).其中5个lncRNA CRNDE上调30倍以上,1个lncRNAs下调超过30倍(P＜0.01).结论:与正常脑组织相比,GBM组织lncRNA CRNDE表达谱发生明显变化,其在胶质瘤的发生发展中可能具有重要作用.
关键词： 长链非编码RNA 结直肠肿瘤差别表达基因 胶质瘤 基因芯片 -
甲状腺乳头状癌组织中CRNDE的表达变化及对甲状腺癌细胞增殖、迁移、侵袭能力的影响
目的 观察甲状腺乳头状癌(PTC)组织中lncRNA结直肠肿瘤差异表达基因(CRNDE)的表达变化,及CRNDE对甲状腺癌细胞TPC-1增殖、迁移、侵袭能力的影响.方法 采用荧光定量PCR法检测30例PTC组织及其相应癌旁正常组织中的CRNDE.培养TPC-1细胞并分为敲低组、阴性对照组、空白对照组.合成3个CRNDE-siRNA序列即CRNDE-siRNA-1/2/3.敲低组转染CRNDE-siRNA-1/2/3并筛选敲低效果好的CRNDE-siRNA序列进入下一步实验;阴性对照组转染NC-siRNA;空白对照组不做特殊处理.分别于转染后0、12、24、48、72 h检测细胞增殖能力.转染48 h后检测细胞迁移、侵袭能力.转染72 h后检测各组细胞中的上皮间充质转化(EMT)相关蛋白.结果 PTC组织与癌旁正常组织中CRNDE相对表达量分别为31.99 ±38.05、4.33 ±3.30,两组相比,P<0.05.转染后24、36、48、60、72 h敲低组细胞增殖能力低于阴性对照组和空白对照组(P均<0.05).敲低组迁移细胞数、侵袭细胞数均少于阴性对照组和空白对照组(P均<0.05).敲低组上皮细胞标志物E-cadherin蛋白相对表达量高于阴性对照组和空白对照组,间质细胞标志物N-cadherin蛋白、Vimentin蛋白相对表达量低于阴性对照组和空白对照组(P均<0.05).结论 CRNDE在PTC癌组织中呈高表达.敲低CRNDE后,TPC-1细胞的增殖、迁移、侵袭能力减弱,EMT相关蛋白表达发生变化.CRNDE表达异常可能与PTC的发生发展有关,其机制可能涉及调节肿瘤细胞增殖、迁移、侵袭能力及EMT特性.
