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分别应用基因芯片和solexa技术研究脐血干细胞体外诱导的巨核细胞基因表达谱
目的 分别应用基因芯片和solexa技术研究人脐带血CD34+细胞来源的巨核细胞的基因表达谱.方法 采用密度梯度离心法和免疫磁珠法分选人脐带血CD34+细胞.100 ng/ml TPO诱导培养12天后,应用免疫磁珠法分选巨核细胞(MKs)和非巨核细胞(非MKs).分别应用基因芯片和solexa技术检测MKs和非MKs的差异表达基因.结果 基因芯片技术在38000多个基因表达谱的筛选中,检测出呈现显著差异表达的基因有1834个,其中711个上调基因,1123个下调基因.应用solexa技术获取的MK和非MK细胞Tag初始数量分别为3773147和3533805个,整个清晰的Tag数量分别为3291132和2967947,明显独特的tag数量分别为197769和245318个.其中上调基因表达数量为1161个,下调为902个;上调Tag表达数量为2717个,下调为1519个.结论 MKs和非MKs mRNA表达存在显著差异,差异基因编码产物与细胞内信号转导、新陈代谢、细胞发育、运动、细胞凋亡、细胞黏连和免疫应答等功能相关,进一步深入研究将有助于探讨巨核细胞的表达机制、信号传导及调控机制.基因芯片和solexa技术的检测结果存在重叠,同时又相互补充,两种方法联合应用能得到更完整的巨核细胞的基因表达谱.
关键词： 巨核细胞 基因表达谱 体外扩增 基因芯片技术 Solexa测序技术 -
高通量测序技术在临床医学中的应用进展
高通量测序技术(第二代测序技术)近年来取得快速发展,与第一代测序技术相比具有速度快、准确率高、成本低等优点,主要以454测序技术、Solexa测序技术以及SOLiD测序技术为代表.高通量测序技术在生命科学以及医学领域方面的研究越来越广泛,该文介绍了几种高通量测序技术的作用原理以及它们在临床方面的应用情况.
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第二代高通量测序技术的原理及其在医学中的应用进展
第二代高通量测序技术近年来取得了较快发展，与第一代测序技术相比具有速度快、准确率高、成本低等优点，主要包括454测序技术、Solexa测序技术以及SOLID测序技术。高通量测序技术在医学领域的研究越来越广泛，本文介绍了几种高通量测序技术的作用原理以及它们在临床方面的应用情况。
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高通量测序分析系统性红斑狼疮患者外周血单个核细胞microRNAs表达谱差异
目的 探讨系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)外周血单个核细胞microRNA(miRNA)表达谱的差异及新miRNA序列.方法 采用Solexa高通量测序技术,对SLE组与正常对照组(NC)测序,比较两组外周血单个核细胞差异性表达miRNAs,进行生物信息学分析,并对部分差异表达基因通过Real-time PCR进行验证.结果 SLE组41种新miRNAs显著差异表达,33种上调,8种下调.结论 差异表达的新miRNAs在SLE的发生发展过程中起重要的调控作用,可能成为早期诊断SLE的新的生物标志物.
关键词： 系统性红斑狼疮 小核糖核苷酸 外周血单个核细胞 Solexa测序技术
