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肝内胆管癌细胞系ICC-9810与肝细胞系L02蛋白质组学的差异分析
目的:分析肝内胆管癌细胞系ICC-9810与正常肝细胞系L02的蛋白质表达差异,筛选肝内胆管癌的潜在分子标志物.方法:应用表面增强激光解吸离子化(surface enhanced laser desorption/ionization,SELDI)蛋白质芯片技术检测肝内胆管癌及正常肝细胞系的蛋白质谱.用PBSII-C型蛋白质芯片阅读机读取数据,采用Proteinchip Software 3.0.2软件分析数据.结果:IMAC3、WCX2两种蛋白芯片共捕获376个蛋白峰,发现27个差异蛋白.与正常肝细胞系L02蛋白谱相比,9个蛋白在肝内胆管癌细胞系ICC-981O中高表达,18个蛋白在肝内胆管癌细胞系ICC-9810中低表达.其中3767、7999、10555、12163、22066和26794 Da6个差异蛋白可被WCX2和IMAC3芯片共同捕获.结论:肝内胆管癌与正常肝细胞存在差异蛋白表达,这些差异蛋白为寻找肝肿瘤标志物,了解肝内胆管癌的发病机制提供了重要线索.
关键词： 肝内胆管癌 肝细胞 差异蛋白 表面增强激光解吸离子化 -
SELDI筛选绒癌耐氨甲喋呤细胞株耐药相关蛋白
目的 应用飞行时间质谱技术结合蛋白芯片分析筛选人绒毛癌细胞株JAR及其与人绒毛癌耐氨甲喋呤细胞株JAR/MTX之间的蛋白质表达差异,寻找出绒癌耐药的相关蛋白.方法 采用体外细胞培养来提取两种细胞的胞浆蛋白和分泌蛋白,应用SELDI-TOF-MS技术检测各细胞株提取的胞浆蛋白和分泌蛋白,采用CM-10型弱阳离子交换芯片检测.结果 经SELDI技术检测发现质荷比(m/z)为8132.043,10738.36的胞浆蛋白在JAR/MTX细胞中呈高表达;质荷比(m/z)为11555.09的分泌蛋白及m/z为4896.68的胞浆蛋白在JAR细胞中高表达,在JAR/MTX中呈低表达.结论 应用飞行时间质谱技术结合弱阳离子交换芯片,可有效筛选绒癌耐氨甲喋呤细胞株中的特异性表达蛋白;寻找到的差异蛋白与绒癌耐药密切相关,并可能成为本病耐药的标志物.
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应用seldi-TOF MS技术分析高低转移肺腺癌细胞株差异表达蛋白
目的分析体外培养的高低转移肺癌细胞株蛋白质表达差异.方法采用表面增强激光解吸离子化(SELDI)蛋白质芯片技术检测了两种肺癌细胞株(肺腺癌细胞高转移株Anip973和肺腺癌细胞低转移株AGZY)的蛋白质谱.分析不同细胞株之间的蛋白质表达差异.每种细胞用WCX2和IMAC3两种芯片检测.采用PBSⅡC型蛋白质芯片阅读机读取数据,获得的数据采用Ciphergen公司的Proteinchip Software 3.2.1软件分析.结果获得WCX2和IMAC3两种蛋白芯片上Anip973和AGZY细胞株蛋白质谱图谱;在对两种肺癌细胞株的蛋白质谱比较时发现,有14个蛋白质在两种肺癌细胞株中出现明显的变化,其中9个差异蛋白在Anip973细胞中高表达,5个差异蛋白在Anip973细胞中低表达.结论高低转移肺腺癌细胞之间蛋白质谱表达比较时有差异蛋向.
关键词： 蛋白质芯片 肺癌细胞株 差异蛋白 表面增强激光解吸离子化 -
SELDI技术对马尔尼菲青霉菌酵母相和霉菌相蛋白质组表达差异的分析
目的 比较马尔尼菲青霉菌酵母相和霉菌相蛋白质组表达差异.方法 应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱技术(SELDI)检测马尔尼菲青霉菌酵母相和霉菌相的蛋白质谱.用PBSIIC型蛋白质芯片阅读机读取数据并进行分析.结果 在WCX2芯片上共捕获75个蛋白峰,其中10个蛋白质在酵母相高表达,3个蛋白质在霉菌相高表达.相对分子质量为2900和3151蛋白质仅在酵母相表达,13 151和13 285蛋白质仅在霉菌相表达.结论 SELDI技术可以检测出马尔尼菲青霉菌霉菌相和酵母相表达的小分子蛋白质差异.
关键词： 马尔尼菲青霉菌 酵母相 霉菌相 蛋白质组 表面增强激光解吸离子化
