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miR-99a-5p在MDS患者骨髓中的表达及功能分析
目的:检测miR-99a-5p在骨髓增生异常综合症(MDS)患者中的表达,利用生物信息学预测其靶基因并进行功能分析,探讨miR-99a-5p在MDS的发生发展中可能的作用.方法:利用qRT-PCR技术检测miR-99a-5p在初治MDS患者骨髓中的表达量,分析其与MDS临床病理参数的相关性;运用靶基因在线预测软件Targetscan、Miranda和Microcosm预测其可能的靶基因,取预测结果的交集作为miR-99a-5p在MDS中的潜在靶基因.结果:与正常对照组相比,MDS患者骨髓中miR-99a-5p表达升高(P＜ 0.001).按IPSS的预后评分,将MDS患者分为相对低危组(包括低危险组和中危1组)和相对高危组(包括中危2组和高危组)发现,在相对低危组中miR-99a-5p的表达量是正常对照组的2.40倍(P＜0.001),相对高危组中miR-99a-5p的表达量是对照组的6.66倍(P＜0.001),相对高危组中miR-99a-5p表达量是相对低危组的2.80倍(P＜0.001);转白血病组(t-MDS)中miR-99a-5p的表达量是对照组的6.35倍(P＜0.001).相关分析显示,患者骨髓miR-99a-5p表达量与原始细胞比例呈显著正相关(P＜ 0.001);而与染色体核型、外周血血象无明显相关.利用靶基因在线预测软件预测miR-99a-5p的可能靶基因,并结合文献,得出ST5可能是miR-99a-5p在MDS中的潜在靶基因.结论:miR-99a-5p在MDS患者中表达明显上调,且随着危险度的增加其表达呈上升趋势,并可能通过负性调控靶基因ST5参与MDS的发病.
关键词： 骨髓增生异常综合症 miR-99a-5p ST5 -
社区获得性金黄色葡萄球菌ST398克隆株与医院获得性ST5、ST239克隆株毒力及耐药特征
目的 研究社区获得性金黄色葡萄球菌(金葡菌)ST398克隆株(CA-ST398)与医院获得性金葡菌流行ST5、ST239克隆株(HA-ST5,HA-ST239)在毒力基因携带及表达、耐药特征上的异同.方法 通过多位点保守基因测序分析方法对上海华山医院门诊和住院患者分离的金葡菌进行克隆分型.用聚合酶链反应(PCR)方法对随机选取的56株CA-ST398、50株HA-ST5和50株HA-ST239毒力基因携带情况进行分析,随后采用实时荧光定量(RT)-PCR方法检测3个黏附相关基因(sdrC、fnbA、clfA)、1个定植相关基因(icaA)、2个外毒素基因(hla、psm)、1个调控因子(RNAⅢ)的表达情况.采用纸片法和微量肉汤稀释法对克隆株进行药物敏感性检测,采用PCR方法确定甲氧西林耐药金葡萄(MRSA) SCCmec基因分型.结果 CA-ST398克隆株通常引起皮肤软组织感染(60.7％),而HA-ST239(72.0％)和HA-ST5克隆株(64.0％)通常引起呼吸道感染.与医院获得性金葡菌相比,CA-ST398克隆株sdrC、sdrE、声vl基因的携带率较高(P＜0.01),sea、sec、see、seg、sei、sek、sel、sem、sen、seo、sep、seq、tst、sdrD、sasX、bsaA、lukE基因的携带率较低(P＜0.05).黏附相关基因sdrC、fnbA和dfA基因表达HA克隆株高于CA-ST398克隆株(P＜0.05);外毒素基因hla、psm及调控因子RNAⅢ表达CA-ST398高于HA克隆株(P＜0.01).HA-ST239和HA-ST5克隆株对庆大霉素、左氧氟沙星、头孢西丁、头孢唑林的耐药率高于CA-ST398克隆株(P＜0.001).12.5％ (7/56) CA-ST398为MRSA,100％ (50/50) HA-ST239、94.0％ HA-ST5 (47/50)克隆株为MRSA.CA-ST398主要携带SCCmecⅤ (3.6％,2/56),HA-ST239主要携带SCCmec (92.0％,46/50),HA-ST5主要携带SCCmecⅡ(90.0％,45/50).结论 CA-ST398、HA-ST239和HA-ST5致病的差异可能与不同致病因子表达差异有关.HA-ST239和HA-ST5在医院环境中的持续定植感染可能与黏附相关因子sdrC、fnbA和clfA高表达有关.CA-ST398的高毒力可能与外分泌型毒素α溶血素(hla编码)、酚可溶性蛋白(psm编码)及阈值感应系统agr的高表达有关.
