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外膜蛋白基因A文献资料
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致病性大肠埃希菌O2、O78及融合双价弱毒菌株O2,78(Chlr Norr) ompA 基因的克隆及序列分析
目的 应用PCR扩增大肠埃希菌O2、O78及融合双价弱毒菌株O2,78的外膜蛋白A(ompA)基因,并进行克隆.方法 根据GenBank中人源大肠埃希菌K-12的ompA核苷酸序列设计特异引物,应用PCR对大肠埃希菌O2、O78及融合双价弱毒菌株O2,78的ompA 基因进行体外扩增、克隆和序列分析. 结果 O2、O78和O2,78经PCR获得的ompA基因片段大小为1 041 bp,与理论值相符;经过克隆和测序分析,该基因的核苷酸序列均由2 271 nt组成,编码1个由346个氨基酸组成的前外膜蛋白A,三菌株ompA基因核苷酸序列与GenBank提供的已知基因序列比较,同源性均为100%. 结论 本研究成功克隆了大肠埃希菌ompA基因全长.
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人咽拭子中肺炎嗜衣原体基因型的初步鉴定
目的 了解中国咽部感染患者肺炎嗜衣原体(Cpn)的基因型.方法 从中国不同城市收集疑为Cpn感染患者的咽拭子标本465份,巢式PCR扩增Cpn主要外膜蛋白基因(ompA)片段,其中包括4个变异区,对所得58份阳性标本进行ompA基因序列测序,对照Cpn参考株基因,根据同源性对这些临床株基因进行分型.结果 从58份Cpn临床株标本中,检出CpnA、CpnB、CpnC、CpnD共4种基因型,14个基因变体,其中以C型为常见(89.7%),其次依次为A型(5.2%)、B型(3.4%)、D型(1.7%).结论在中国部分城市,Cpn存在CpnA、CpnB、CpnC、CpnD等4个基因型,其中以C型为常见,呈现较大的多态性,可为其疫苗的研制提供重要的实验依据.
