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肝细胞生长和分化相关基因在大鼠肝再生中的表达方式及作用分析
目的 在基因转录水平了解肝再生中肝细胞的生长和分化情况.方法 用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得参与肝细胞生长和分化基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠肝再生(LR)中的表达情况,通过比较手术组和假手术组中基因表达差异性以确定上述基因中的肝再生相关基因.结果 初步证实上述基因中110个基因与肝再生相关.肝再生启动(PH后0.5～4h)、G0/G1过渡(PH后4～6h)、细胞增殖(PH后6～66h)、细胞分化和组织结构功能重建(PH后72～168h)等4个阶段起始表达的基因数为63、11、43和3,基因总表达的次数为63、43、101和80,表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达,在不同阶段发挥作用.它们共表达上调488次,下调248次,分为6种表达方式,表明肝再生中细胞生理生化活动的多样性和复杂性.结论 肝细胞生长和分化贯穿于整个肝再生中.
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脂类代谢和运输涉及的基因与大鼠肝再生的相关性分析
目的 在基因转录水平了解脂类代谢和运输相关基因在大鼠肝再生(LR)中的表达变化和模式.方法 用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得参与脂类代谢和运输基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中的表达情况,用比较手术和假手术中基因表达的差异性确定肝再生相关基因.结果 初步证实上述基因中193个基因与肝再生相关.肝再生早期[部分肝切除(PH)后0.5～4h]、前期(PH后6～12h)、中期(PH后12～66h)、后期(PH后72～168h)等4个阶段起始表达的基因数为113、20、66和1;基因的总表达次数为250、205、796和293.共上调852次,下调630次,分为27种表达方式.肝再生早期和前期胆汁酸代谢相关基因转录减弱;早期和后期糖皮质激素分解相关基因转录增强;前期和中期磷脂合成相关基因转录增强,磷脂分解相关基因转录减弱;中期脂肪酸、白三烯和鞘糖脂合成相关基因转录增强,甘油三酯和磷脂酰肌醇代谢相关基因转录增强,鞘糖脂分解相关基因转录减弱;中期和后期前列腺素合成和脂肪酸分解相关基因转录增强;几乎在整个肝再生中性激素、糖皮质激素和孕酮合成相关基因转录增强,鞘磷脂代谢相关基因转录增强,脂类运输相关基因转录增强,胆固醇代谢相关基因转录减弱.结论 肝再生中脂类代谢和运输变化较大,与肝再生密切相关.
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细胞表面受体介导的信号通路相关基因对大鼠肝再生的调控作用分析
目的 在基因转录水平了解12条细胞表面受体介导的信号通路相关基因对大鼠肝再生的调控作用.方法 用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得上述基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中的表达情况,用比较手术和假手术中基因的表达差异性确定肝再生相关基因.结果 初步证实上述基因中491个与肝再生相关,其中226个基因之间有742种直接作用关系.细胞因子和趋化因子介导的酶联受体、G蛋白耦联受体、谷氨酸;抗原受体介导的,整合素介导的,脂多糖介导的,Notch、Osmosensory、Smoothened、Toll、Wnt等12条信号通路中与肝再生相关的上调基因数和下调基因数,分别为26和23、164和54、59和51、5和1、22和14、21和10、1和1、4和11、23和11、32和17.肝再生中基因上调表达次数和下调表达次数分别为188和128、464和190、308和207、13和5、88和46、123和50、2和1、20和43、148和30、174和62.结论 除Osmosensory和脂多糖介导的信号通路在肝再生中作用较小,Smoothened信号通路作用减弱外,其他9条信号通路在肝再生中作用增强.
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核酸及其衍生物的代谢加工运输相关基因在大鼠肝再生中表达模式的分析
目的 在基因转录水平了解核苷酸及其衍生物、DNA及RNA代谢、加工、运输相关基因在大鼠肝再生(LR)中的表达变化.方法 用搜索网站资料和查阅相关论文等方法获得核苷酸及其衍生物、DNA及RNA代谢、加工、运输相关基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中的表达情况,用手术组和假手术组比较的方法确定肝再生相关基因.结果初步证实,上述基因中有240个基因与大鼠肝再生相关.肝再生早期[部分肝切除(PH)后0.5～4h]、前期(PH后6～12h)、中期(PH后16～66h)、后期(PH后72～168h)等4个时期起始表达的基因数分别为65、14、150和11,基因的总表达次数为133、87、627和169,它们的表达模式分别为6、5、22和9种,共表达上调768次,下调248次.肝再生前期和中期mRNA降解增强;前期、中期和后期DNA重组、修饰、转录及mRNA加工和运输增强;几乎整个肝再生中核苷酸及其衍生物代谢、DNA复制、包装和分解活动增强.结论肝再生相关基因主要在肝再生早期起始表达,在不同时期发挥作用.
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核糖体相关基因在大鼠再生肝及肝肿瘤中表达异同的比较
目的 在基因转录水平了解核糖体相关基因在大鼠再生肝(RL)和肝脏肿瘤(LT)中的表达异同.方法 用搜索网站资料和查阅相关论文等方法获得核糖体发生、组装和功能相关基因及它们在肝脏肿瘤中的表达变化,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中的表达情况,用统计学方法比较上述基因在再生肝和肝脏肿瘤中的表达异同.结果 初步证实上述基因中75个基因与肝再生相关.其中,18个基因在再生肝和肝脏肿瘤中表达上调,6个基因在两者中表达下调,51个基因在肝脏肿瘤中未发生有意义的表达变化.结论 再生肝的核糖体相关基因表达谱与肝脏肿瘤有相同之处,也有不同之处,前者的基因表达更具阶段性和复杂性.
关键词： 部分肝切除 核糖体 肝再生相关基因 基因组230 2.0芯片 大鼠 -
细胞凋亡相关基因表达谱与大鼠再生肝的细胞凋亡关系
目的 在基因转录水平探讨细胞凋亡相关途径对大鼠肝再生的作用.方法 采用大鼠2/3部分肝切除(PH)方法,制备再生肝模型,同时设对照手术(假手术).用查阅网站资料和相关论文等方法获得凋亡相关基因,用大鼠基因230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中的表达情况,通过比较真、假手术中上述基因的表达差异性确定肝再生相关基因.结果 细胞凋亡相关基因中,252个基因与肝再生相关.在肝再生启动(PH后0.5～4h)、G0/G1过渡(PH后4～6h)、细胞增殖(PH后6～66h)、细胞分化和结构功能重建期(PH后72～168h)等4个阶段起始表达的基因数为81、23、155和16,总表达的基因数为161、100、733和192,表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达,在不同阶段发挥作用.它们共上调795次,下调291次,表明肝再生中大部分基因表达增强.它们的表达模式分为35种.表明肝再生中细胞凋亡相关基因的表达情况多样和复杂.结论 15条细胞凋亡途径参与肝再生调控.
关键词： 部分肝切除 细胞凋亡 基因组230 2.0芯片 肝再生相关基因 大鼠 -
转录因子基因在大鼠肝再生中的表达方式和作用分析
目的 探讨转录因子基冈在肝再生中的表达变化及作用.方法 经查阅网站资料和相关论文获得转录因子基因及其参与的生理活动,用大鼠基因组230 2.0芯片检测转录因子基因在大鼠再生肝中的表达,用手术组和假手术组比较的方法确定肝再生相关基因.结果 初步证实上述基因中有320个基因与肝再生相关,涉及细胞代谢、增殖、分化、凋亡等16种生理活动.它们在肝再生中的表达分为41种方式,表明肝再生中细胞生理生化活动具有阶段性、多样性和复杂性.其中,肝再生早期[部分肝切除(PH)后0.5～4h]和前期(PH后6～12h)糖类合成,脂类代谢和炎症反应相关转录因子基因表达增强,中期和后期细胞增殖、生长、分化和凋亡相关转录因子基因表达增强.结论 肝再生的生理生化活动受多种转录因子基因调控.其中,e2f1、fos、copeb等转录因子基因发挥关键作用.
关键词： 部分肝切除 转录因子 肝再生相关基因 基因组230 2.0芯片 大鼠 -
大鼠肝再生中糖代谢相关基因的表达变化
目的 了解糖类代谢相关基因在大鼠肝再生中的表达变化.方法 本研究用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得糖类代谢相关基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中的表达情况,用比较手术组和假手术组中基因表达的差异性确定肝再生相关基因.结果 初步证实上述基因中118个基因与肝再生相关.肝再生早期[部分肝切除(PH)后0.5～4h]、前期(PH后4～12h)、中期(PH后16～66h)和后期(PH后72～168h)等4个阶段起始表达的基因数为33、6、68和7;基因的总表达次数为68、44、210和83.表明肝再生相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达,在不同阶段发挥作用.它们共上调205次,下调200次,分为12种表达方式,表明肝再生中糖代谢活动多样和复杂.其中,单糖和糖原代谢、糖蛋白和糖脂(主要为神经节苷脂)合成相关基因几乎在整个肝再生中表达增强,寡糖和糖胺聚糖合成及糖蛋白和糖脂分解相关基因表达下调.结论 肝再生与糖代谢密切相关.
关键词： 部分肝切除 糖代谢 肝再生相关基因 基因组230 2.0芯片 大鼠 -
细胞核结构与发生相关基因在大鼠肝再生中表达模式的分析
目的 了解大鼠肝再生中细胞核结构与发生相关基因的表达动态.方法 用查阅网站资料和相关论文等方法获得上述基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中的表达情况,用比较手术和假手术组中基因的有意义表达异同,确定肝再生相关基因.结果 初步证实上述基因中406个基因与肝再生相关.部分肝切除(PH)后,肝再生早期(0.5～4h)、前期(6～12h)、中期(12～66h)、后期(72～168h)等4个阶段起始表达的基因数为200、29、179和5;基因的总表达次数为374、290、1876和603.共上调1224次,下调496次.肝再生前期和中期核形成与发生相关基因表达增强;中期核被膜、核基质和核质相关基因表达增强;中期和后期核染色体、核仁和核功能蛋白复合体相关基因表达增强.结论 细胞核结构与发生相关基因在大鼠肝再生中表达活跃,并与肝再生密切相关.
