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基于SELDI-TOF/MS技术的慢性乙型肝炎虚实证候研究
目的:考察不同中医证候的慢性乙型肝炎(乙肝)患者的血清蛋白质指纹图谱,寻找能够帮助辨证的差异蛋白.方法:研究采用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF/MS)技术对健康者和不同虚实证候的乙肝患者的血清蛋白进行监测.结果:乙肝不同虚实证候各具有特征性的血清蛋白质指纹图谱,能被正交偏小二乘法区分,且通过多种统计方法分析,发现了辨别乙肝不同证候潜在的生物标志物.其中,肝胆湿热证组与肝郁脾虚证组间的蛋白质差异峰为m/z 4 104和m/z 5 032;肝郁脾虚证组与肝肾阴虚证组间为m/z3 698和m/z 4 187;肝胆湿热证组与肝肾阴虚证组间为m/z4 187和m/z 5 032.同时,通过对差异峰预测得到了骨桥蛋白等蛋白质.结论:SELDI-TOF/MS技术能够分析乙肝虚实证候患者血清蛋白质指纹谱,并找到能够区分乙肝不同虚实证候的4个潜在生物标志物.
关键词： 慢性乙型肝炎 证候 蛋白组学 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱 -
基于表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术的慢性肾衰竭中医湿证尿液中相关蛋白研究
目的 采用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术研究慢性肾衰竭(chronic renal failure,CRF)中医湿证患者的尿液蛋白标志物.方法 采集CRF湿证患者90例和非湿证患者60例的尿液,采用H4蛋白芯片技术进行尿液蛋白质组学研究,用蛋白芯片阅读器PBSⅡ对芯片进行扫描、分析.结果 (1)湿证组与非湿证组尿液样本的蛋白质图谱在质荷比1 000-20 000范围内检测到25个差异蛋白峰(P<0.01).(2)经生物信息学分析建立CRF中医湿证尿液蛋白预测模型,得到M/Z 8 654.96、M/Z 2 081.65、M/Z 18 667.3和M/Z 2 242.14共4个差异蛋白峰组成的生物标记物可以将湿证组和非湿证组样本较好地分类,其正确率84.7%,灵敏度为92.2%,特异性为73.3%.(3)湿证组与非湿证组尿液中差异蛋白峰经SwissProt数据库鉴定,可能为7种蛋白质.结论 初步筛选出CRF中医湿证的尿液蛋白标志物,建立了CRF中医湿证尿液蛋白预测模型,通过数据库对尿液蛋白标志物进行了鉴定,为CRF中医湿证的临床辨证提供了一定的实验依据.
关键词： 慢性肾衰竭 中医湿证 尿液 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱 -
慢性肾功能衰竭中医不同证型患者尿液相关蛋白研究
目的 研究慢性肾功能衰竭(CRF)中医不同证型患者的尿液蛋白差异.方法 选择251例2009年1月-2010年1月上海中医药大学附属龙华医院肾病科住院的CRF患者,其中肝肾阴虚组34例,脾肾气虚组75例,脾肾气阴两虚组56例,脾肾阳虚组32例,阴阳两虚组54例,另选择健康人50名作为对照组.应用SELDI-TOF-MS技术,采用H4蛋白芯片技术进行尿液蛋白质组学研究,用蛋白芯片阅读器PBSⅡ对芯片进行扫描、分析.结果 CRF中医各证型组与对照组间发现49个差异蛋白峰,差异有统计学意义(P＜0.01).各证型组间ROC曲线下面积显示:肝肾阴虚组和脾肾气虚组、脾肾气阴两虚组、脾肾阳虚组、阴阳两虚组以及脾肾气阴两虚组和脾肾阳虚组组间差异度较明显,脾肾气虚组和脾肾气阴两虚组、脾肾阳虚组,脾肾气阴两虚组和阴阳两虚组及脾肾阳虚组和阴阳两虚组差异度一般,脾肾气虚组和阴阳两虚组差异度不明显.结论 尿液蛋白标志物能在一定程度上反映CRF各证型组间生物学特点的区别.
关键词： 慢性肾功能衰竭 证型 尿液蛋白 蛋白峰 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱 -
SELDI-TOF-MS联合蛋白质组学实验数据库对结直肠癌血清标志物的鉴定
目的:探讨表面增强激光解析离子化飞行时间质谱仪(SELDI-TOF-MS)联合蛋白质组学实验数据库方法研究结直肠癌患者血清标志物的可行性.方法:应用SELDI-TOF-MS对169例结直肠癌患者与83例正常人血清进行了蛋白质谱检测.通过Biomarker WizardTM与BiomarkerPatternsTM软件分析发现差异蛋白,建立结直肠癌诊断模型;用蛋白质组学实验数据库检索鉴定出有意义的差异蛋白,并用ELISA法对结直肠癌患者及正常人血清样本中差异蛋白表达进行验证.结果:发现34种差异蛋白,以质荷比(m/z)为2873,3163,6121,7778的4种差异蛋白组成的分类树诊断模型.在学习模式下其诊断结直肠癌的灵敏度为91.57%,特异度为90.53%:在测试模式下分别为82.25%.80.72%.其中m/z为7778的蛋白峰强度在结直肠癌患者血清中明显高于正常人(p<0.01),数据库检索结果提示该蛋白为血小板因子4(PF4).ELISA法测定结直肠癌患者血清PF4水平显著高于正常人(p<0.01),其灵敏度及特异度分别为61.1%,76.9%.结论:SELDI-TOF-MS联合蛋白质组学实验数据库的方法简便可行.可为蛋白芯片研究提供新思路;PF4(m/z=7778)在结直肠癌患者血清中明显升高,是结直肠癌患者新的血清学标志物.
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乳腺癌患者与健康人血清蛋白质谱的差异分析
目的 探索乳腺癌与健康人群的血清蛋白质谱差异,寻找能够帮助鉴别诊断乳腺癌的候选血清蛋白标志物.方法 收集117例乳腺癌患者和56例健康人的血清标本,随机分为训练组(74例乳腺癌和36例健康人)与测试组(43例乳腺癌和20例健康对照).采用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF MS)技术检测所有血清标本的蛋白质谱.用Biomarker Wizard统计软件比较训练组乳腺癌与健康对照间的蛋白质谱差异,再用Biomarker Pattern软件筛选出一组差异蛋白构建决策分类树模型以鉴别乳腺癌病例和健康人群,后用测试组对分类模型进行验证.结果 乳腺癌组和健康对照组的血清蛋白质谱存在14个差异显著的蛋白峰,以质荷比分别为3958、4288、4974、5902、8518、8930、9282和11360的8个差异蛋白构建决策树分类模型,鉴别乳腺癌与健康对照的敏感性为82.43% (61/74),特异性为83.33% (30/36) ,准确性为82.73%(91/110),用测试组进行验证的敏感性为86.05% (37/43),特异性为65.00% (13/20), 准确性为79.37%(50/63).结论 乳腺癌与健康人群的血清蛋白质谱存在差异,SELDI-TOF MS技术筛选出的血清差异蛋白有助于乳腺癌的鉴别诊断.
关键词： 乳腺肿瘤 蛋白质组学 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱 血清 诊断 -
血清蛋白指纹图谱技术筛查前列腺癌患者特异性血清标志物的应用价值
目的 应用蛋白指纹图谱技术筛查前列腺癌患者血清蛋白质表达谱,寻找血清中的特异性标志物.方法 选择前列腺癌患者22例和前列腺增生患者26例以及同期正常对照者25例,用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术检测各血清样本的血清蛋白指纹图谱,比较血清蛋白指纹图谱的差异.结果 前列腺癌组的血清蛋白质谱图中质荷比为3 165、3 982、4 291的蛋白质相对含量(9.794±4.449、3.968±2.247、11.020±6.069)高于正常对照组(5.062±2.245、1.823±1.432、6.525±5.270),而质荷比为2 747、10 268的蛋白质相对含量(22.390±12.179、0.953±0.338)低于正常对照组(42.231±16.970、1.932±0.864);质荷比为10 268的蛋白质的相对含量前列腺癌组(0.953±0.338)低于前列腺增生组(1.314±0.493),差异均有统计学意义(均P<0.05).但前列腺增生组与正常对照组差异均无统计学意义(均P >0.05).PSA阳性的前列腺癌组质荷比为3 960的蛋白质相对含量(3.447±1.434)高于PSA阳性的前列腺增生组(1.473±0.971),而PSA阳性的前列腺癌组质荷比为10 268的蛋白质相对含量(0.847±0.408)低于PSA阳性的前列腺增生组(1.538±0.182),差异均有统计学意义(均P<0.05).结论 血清蛋白质谱图存在差异的6个不同质荷比蛋白质组成的蛋白质组有可能成为前列腺癌筛查的血清标志物.质荷比为10268Da的蛋白指纹峰有助于区分前列腺癌患者与前列腺增生患者和正常人群.
关键词： 前列腺癌 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱 蛋白质组学 -
采用血清蛋白指纹图谱技术筛选食管鳞状细胞癌特异相关性蛋白的研究
目的 应用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测食管鳞状细胞癌患者血清蛋白指纹图谱,筛选候选肿瘤标志物并建立诊断模型,初步探讨所建的诊断模型在食管鳞癌诊断中的临床意义.方法 144例经手术后病理证实的食管鳞状细胞癌患者和50例健康人血清,用SELDI-TOF-MS检测各血清标本获得血清蛋白指纹图谱.用Biomarker Wizard筛选差异峰.扩大样本量,采用SPSS 12.0中ROC曲线分析入选差异峰用于食管癌诊断的灵敏度和特异性.结果 在分子量1 500～30 000范围内,共检测到93个蛋白峰,其中10个差异峰有统计学意义(P＜0.01).ROC曲线面积超过0.8的有2 768、2 745、3 403、6 638、5 972、6 440、3 321和3 978m/z差异峰.当差异峰3 403m/z以3.0为临界值时,其敏感性和特异性分别为87.5%和94.0%;3978m/z以2.0为临界值时,其敏感性和特异性分别为84.7%和72.0%.其诊断价值均超过CA724、CEA和CA242单独或联合检测.结论 3 978和3 403m/z两个蛋白对区分食管鳞癌患者和健康人群具有较好的诊断价值.
关键词： 食管肿瘤 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱 蛋白质组学 诊断 -
WCX纳米磁珠在子宫内膜癌血清蛋白质组中的应用
目的 利用弱阳离子交换型(WCX)纳米磁珠联合表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)分析子宫内膜癌患者血清蛋白质谱,筛选潜在的特异性肿瘤标志物,探讨其临床意义.方法 应用WCX纳米磁珠联合SELDI-TOF-MS对24例子宫内膜癌患者及28例正常人血清标本进行蛋白质质谱分析,用Biomark Wizard软件分析差异蛋白峰,并在Swiss蛋白数据库中搜索鉴定差异蛋白,受试者工作特征(ROC)曲线评价该技术的应用价值.结果 在质荷比(m/z)2000-20000范围内,子宫内膜癌患者血清中筛选出与正常人血清有统计学意义的差异蛋白11个(P<0.05),其中6个高表达:m/z分别为4 175、5 315、7 970、8 047、15 930、16074;5个低表达:m/z分别为4 592、4675、7 019、9188、9 358.m/z为7 970的差异蛋白与子宫珠蛋白(UG)相符.应用ROC曲线分析,确定11个差异蛋白对子宫内膜癌有中等诊断价值,灵敏度为70.5%～96.4%,特异度为89.3%～100%.结论 WCX纳米磁珠联合SELDI-TOF-MS能在子宫内膜癌患者血清中筛选出灵敏度和特异度较好的差异表达蛋白,其有助于子宫内膜癌的筛查、早期诊断及预后监测.
关键词： 子宫内膜肿瘤 肿瘤标记 纳米磁珠 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱 -
血清蛋白指纹图谱筛选卵巢癌血清标记物的意义
目的:探讨表面增强激光解析离子化飞行时间质谱仪(surface-enhanced laser desorption-ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)及其配套蛋白质芯片筛选卵巢癌生物学标记物在卵巢癌诊断中的临床意义.方法:用美国Ciphergen公司研制的蛋白指纹图谱仪和蛋白质芯片检测20例卵巢癌患者、20例卵巢囊肿、20例正常人血清蛋白质的相对含量,筛选标志物,建立诊断模型.结果:在卵巢癌20例、20例卵巢囊肿患者和正常人中共发现3个差异有统计学意义的蛋白质峰表达,质荷比(m/z)分别为:5 900 Da、8 900 Da、11 910 Da.结论:蛋白指纹图谱技术在卵巢癌的早期诊断及筛选生物学标记物等方面有很大的价值,值得进一步研究及推广应用.
关键词： 卵巢癌 血清标志物 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱 诊断 -
肺腺癌患者术后血清蛋白质组构型动态随访研究
目的用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术建立肺腺癌患者血清蛋白质组构型,并筛选出相对特异标记物,随访分析其手术后的动态变化及意义.方法肺腺癌患者71例,均经手术病理证实;正常志愿者71例,按照性别、年龄、吸烟史与71例肺腺癌患者配对.用弱阳离子交换芯片(WCX2)检测各血清标本,筛选肺腺癌相对特异性蛋白质峰.随访分析71例肺腺癌患者手术后3个月、6个月和9个月血清蛋白质组构型变化. 结果与正常志愿者比较发现肺腺癌患者有5个显著高表达的潜在标记物,相对分子量分别为4 047.79,4 203.99,4 959.81,5 329.30和7 760.12 Da;肺腺癌患者手术后血清蛋白质组构型变化的个体差异较大,并与患者病理分期密切相关.结论SELDI-TOF MS蛋白质质谱技术是一种快速、简便易行且高通量的分析方法,能直接筛选出肺腺癌患者血清中相对特异的潜在标记物,且可能具有较好的临床应用前景.
关键词： 肺腺癌 生物标记物 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱 蛋白质组学 -
血清蛋白指纹图谱筛选乳腺癌血清标记物的意义
目的:利用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱仪(Surface-enhanced laser desorption-ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)及其配套蛋白质芯片筛选乳腺癌生物学标记物,初步探讨其在乳腺癌诊断中的临床意义.方法:用美国Ciphergen公司研制的蛋白指纹图谱仪和蛋白质芯片检测30例乳腺癌患者、30例乳腺纤维瘤患者、30例正常人血清蛋白质的相对含量,用SPSS 11.5软件分析处理数据,筛选标志物,建立诊断模型.结果:在乳腺癌、乳腺纤维瘤患者和正常人中共发现3个差异有统计学意义的蛋白质峰表达,质荷比(m/z)分别为:5 700Da、8 900Da、5 910Da.用于乳腺癌诊断灵敏度和特异度分别为86.7%和96.7%.结论:蛋白指纹图谱技术在乳腺癌诊断及筛选生物学标记物等方面有很大的价值,值得进一步研究.
关键词： 乳腺癌 蛋白质组学 血清标志物 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱 诊断 -
宫颈癌患者与健康人血清蛋白质谱的差异分析
目的:探索宫颈癌患者与健康人群的血清蛋白质谱差异,寻找能够帮助鉴别诊断宫颈癌的候选血清蛋白标志物.方法收集73例宫颈癌患者和56例健康人的血清标本,随机分为训练组(56例宫颈癌和36例健康人)与测试组(17例宫颈癌和2O例健康对照).采用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF MS)技术检测所有血清标本的蛋白质谱.用Biomarker Wizard统计软件比较训练组宫颈癌与健康对照间的蛋白质谱差异,再用Biomarker Pattern软件筛选出一组差异蛋白构建决策分类树模型以鉴别宫颈癌病例和健康人群,后用测试组对分类模型进行验证:结果宫颈癌组和健康对照组的血清蛋白质谱存在14个差异显著的蛋白峰,以质荷比分别为3958、4288、4974、5902、8518、8930、9282和11 360的8个差异蛋白构建决策树分类模型,鉴别宫颈癌与健康对照组的敏感性为82.43 (61/4),特异性为83.33 (30/36),准确性为82.73 (91/110),用测试组进行验证的敏感性为86.O5 (37/43),特异性为65..0 (13/20),准确性为79.37 (50/63).结论宫颈癌与健康人群的血清蛋白质谱存在差异,SELDI-TOF -MS技术筛选出的血清差异蛋白有助于宫颈癌的鉴别诊断.
关键词： 宫颈肿瘤 蛋白质组学 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱 血清 诊断
