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基于系统药理学探索莪术有效成分的药理作用机制
目的:通过一系列系统药理学方法初步探讨了莪术有效成分的药理作用机制.方法:利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库获取莪术中有效成分;从PharmMapper Server中获得莪术有效成分的靶蛋白;UniProt数据库中获取靶标的基因名称并于CTD数据库中获取基因相对应的疾病;运用网络可视化软件,构建莪术有效成分-靶点-疾病相互作用网络;借助DAVID工具进行莪术有效成分蛋白质群的基因本位论(GO)分析和靶蛋白作用通路的富集分析.结果:文本挖掘结果表明莪术主要相关疾病有肿瘤性疾病、神经系统疾病和代谢性疾病;GO分析结果表明莪术主要通过类固醇激素介导的信号通路、从RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录起始、凋亡过程的负调控、肽基络氨酸磷酸化、蛋白质自磷酸化、视黄酸受体信号通路、从RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录的正调节等作用发挥生物学功能;信号通路富集结果表明莪术主要作用蛋白与癌症途径,PPAR信号通路,癌症中的蛋白多糖,非小细胞癌,PI3K-Akt信号通路等信号通路有关.结论:莪术可能主要通过调控癌症途径,PPARP,PI3K-Akt信号通路等多途径发挥其药理作用.综合运用系统药理学的方法可以实现快速而全面地分析药物的药理作用.
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计算机模拟研究冠心宁注射液主要成分治疗心血管疾病的网络药理学机制
目的 利用计算机模拟研究冠心宁注射液主要成分治疗心血管疾病的网络药理学机制.方法 以冠心宁注射液中主要药效成分丹参素、丹酚酸B、原儿茶醛、迷迭香酸、丹参酮ⅡA、紫草酸、阿魏酸、洋川芎内酯Ⅰ、川芎嗪、丁苯酞、藁本内酯为研究对象,利用反向分子对接技术进行靶点预测和筛选,通过蛋白互作网络、GO生物过程富集、KEGG信号通路富集,研究冠心宁注射液治疗心血管疾病的药理机制.结果 冠心宁注射液11个药效成分作用于INS、Aktl、TNF、MAPK1、ESR1、F2、SERPINE1等142个潜在心血管疾病治疗靶点,参与甾类激素介导的信号通路、谷胱甘肽代谢过程、平滑肌细胞增殖的正调控、凝血等生物过程,调控凝血、炎症和免疫、内分泌等20条相关通路.结论 冠心宁注射液通过抗炎、抗氧化、抗凝、促纤溶、调节激素以及维持心血管功能稳态等药理作用治疗心血管疾病.
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基于网络药理学葛根治疗2型糖尿病的分子机制研究
目的:基于网络药理学方法探索葛根治疗2型糖尿病分子机制.方法:基于化学成分数据库检索葛根的的化学成分,结合活性成分筛选、靶点预测技术及生物信息学手段,确定葛根治疗2型糖尿病特异性靶点,富集相关通路,分析葛根治疗2型糖尿病的机制.结果:检索葛根157个化学成分,其中94个成分具有较好的口服吸收特性,24个化学成分无有效靶点,获取葛根特异性靶点180个,葛根治疗2型糖尿病的关键基因33个,相关通路包括脂肪摄取及消化,PPAR信号通路,甘油三酯催化通路及甘油三酯代谢通路,游离脂肪酸联合长链脂肪酸通路,调节脂肪细胞脂化,前列腺素合成及调节通路,硒微量元素网络通路,AGE/RAGE等通路.结论:葛根治疗2型糖尿病机制具有多靶点、多通路的特点;主要通路不仅直接参与脂肪分谢,PPAR信号通路,而且还通过一氧化氮、AGE/RAGE等改善循环系统发挥对2型糖尿病的治疗作用.
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基于网络药理学的枳术汤活性成分-靶点-通路研究
目的 运用网络药理学研究枳术汤活性成分-靶点-通路,明确其药理机制.方法 利用中药分子机制生物信息学分析平台获取枳术汤活性成分及对应靶点;利用STRING数据库构建PPI网络,依据度值和介数筛选关键靶蛋白;利用BiNGO和MCODE插件对靶基因进行GO生物过程富集和聚类分析;利用DAVID数据库分析靶点的KEGG信号通路.结果 获得辛弗林、N-甲基酪胺、白术内酯Ⅲ等16个主要活性成分及127个靶点,发现了MAPK1、DRD2、ADRB1、CHRM2、HTR、MAOB、DBH等30个关键靶点.聚类分析809个GO生物过程得到内环境、神经递质、中枢神经、心血管系统、炎症、激素、蛋白质代谢、核酸代谢等28个子簇.KEGG信号通路富集主要涉及神经递质、内分泌、信号转导、物质代谢及其他等5大类17条信号通路.结论 枳术汤活性成分作用于乙酰胆碱、多巴胺、5-羟色胺、肾上腺素等神经递质的受体及代谢酶,参与神经递质调节、心肌信号转导、内分泌等信号通路和生物过程,主治胃肠动力障碍性疾病,对心血管、神经系统疾病也具有一定药理作用.
