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线粒体COI和CYTB基因在虫草属物种寄主昆虫鉴定中的适用性分析
目的:利用DNA条形码技术对冬虫夏草、凉山虫草、亚香棒虫草、戴氏虫草等物种的寄主昆虫分别通过COI序列和Cytb序列进行条形码分析,探索虫草属物种寄主昆虫鉴定序列的适用性.方法:通过DNA提取、PCR、电泳检测和序列测定,分别获得26份虫草寄主虫体的COI序列和Cytb序列,再用拼接和分析软件进行序列的比对和聚类分析.结果:COI序列和Cytb序列都能很好地区分鉴定虫草类各物种,但COI序列的扩增成功率大于Cytb基因,同时在COI基因片段中共检测到129个多态位点,变异率为19.51％;在Cytb基因片段中共检测到113个多态位点,变异率为26.10％.COI序列的简约信息点多于Cytb序列,且基因变异率低于后者.结论:本研究建议COI序列更适用于虫草寄主昆虫的DNA条形码研究.
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32种不同产地与品种商品燕窝的 DNA基源鉴定＊
目的：利用DNA条形码鉴定技术，快速、准确地鉴别不同种类及产地的商品燕窝，揭示其不同基源的物种差异。方法：采用试剂盒提取基因组DNA，利用PCR技术扩增Cytb序列，应用DNAStar软件进行校对拼接，采用MEGA 6.0软件对32份样品的条形码序列进行比对，构建邻接树（Neighbor-Joining tree，NJ），并进行遗传距离分析。结果：实验所用的Cytb条形码可鉴别出燕窝的物种及亚种；收集的32个商品燕窝中，23个官燕窝的基源为爪哇金丝燕Aerodramus fuciphagus，8个官燕窝的基源为其亚种淡腰金丝燕Aerodramus fuciphagus germani，而1个毛燕窝的基源为大金丝燕Aerodramus maximus或其亚种Aerodramus maximus lowi。结论：不同来源的商品燕窝基源差异较大，利用Cytb条形码可快速、准确鉴别出燕窝基源。
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燕窝DNA条形码的鉴定研究
应用Cytb6序列对燕窝进行DNA条形码(DNA barcodes)研究,为燕窝的溯源研究及全面评价燕窝质量提供理论依据.以马来西亚、印度尼西亚、越南、泰国等地的燕窝,共计39个样本为研究对象,提取基因组DNA,扩增Cytb6序列并双向测序.采用MEGA 7.0软件,对39条样本序列及36条从Gcn Bank中下载5种金丝燕的Cytb序列进行序列特征分析,基于Kimura双参数法计算序列种内、种间遗传距离,构建NJ和UPGMA系统聚类树进行分析.研究结果表明,39个样本共来源于3个不同的金丝燕物种.Cytb序列种间变异显著大于其种内变异,可以准确地区分不同种类的燕窝.所构建的NJ和UPGMA系统发育树,也能将全部物种区分开.表明基于Cytb序列的DNA条形码技术可用于准确快速地鉴别燕窝的生物基原.
