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IBS法和ITO法应用于全同胞鉴定中的探讨
[目的]应用GoldeneyeTM 20A扩增体系,讨论IBS法和ITO法在全同胞鉴定中的应用价值.[方法]选取150对全同胞和500对无关个体,用GoldeneyeTM 20A体系进行19个常染色体STR基因座的扩增,计算状态一致性评分(IBS),用ITO法分别计算全同胞关系指数(FSI)、半同胞关系指数(HSI)及其比值(FSI:HSI).[结果]在检测GoldeneyeTM20A体系19个基因座时,(1)当两个体的IBS≥22时,倾向于全同胞;当IBS≤13时,倾向于无关个体;当13＜IBS＜22时,无法给出倾向性意见.(2)当FSI＜0.01时,倾向于无关个体;当FSI＞1且FSI:HSI＞1时,倾向于全同胞;当0.01≤FSI≤1或FSI＞1而FSI:HSI≤1时,无法给出倾向性意见.[结论]IBS法和ITO法都可以用在全同胞亲缘鉴定中,IBS法将作为新标准出台,其具有快速简便,高准确率的优势,而ITO法计算过程较为复杂,但具有较高的检出概率,是IBS法一种很好的补充.在实际检案中,可根据案件具体情况,综合运用.
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依据共有等位基因数判别叔侄关系
[目的]建立基于共有等位基因数(A)的典型判别函数,并探讨其在叔侄鉴定中的应用.[方法]根据119对叔侄、119对无关个体的15个STR基因座的分型结果,计算每对个体的共有等位基因数(A)和叔侄指数(AI),进行统计学处理.[结果]共有等位基因数(A)在叔侄对和无关个体对中均符合正态分布.采用共有等位基因数(A)建立的典型判别函数(f)=0.437A-5.268,判别叔侄和无关个体的平均准确率为80.7％;采用Ig AI建立的典型判别函数(f)=1.021 lg AI +0.051,平均准确率为82.8％,两者判别结果无统计学差异(P＞0.05).[结论]依据共有等位基因数建立的典型判别函数的判别效能与ITO法相近,且计算简便、易于掌握,可以应用于叔侄关系鉴定.
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51个常染色体STR基因座在ITO法判断全同胞中的应用
目的 探讨ITO法和判别函数法在全同胞鉴定中的应用价值.方法 根据342对全同胞和3 900对无关个体的19、21、39、51个常染色STR基因座的分型结果,采用ITO法计算全同胞关系指数(FSI).用SPSS软件Fisher判别分析法,分别建立lgFSI全同胞-无关个体的判别函数.结果 每组全同胞对和无关个体对的lgFSI符合正态分布,具有显著性差异.在19、21、39、51个STR基因座,全同胞组判别函数分别为L同胞=1.666 6×lgFSI-5.208 0,L同胞=1.643 9×lgFSI-5.512 0,L同胞=1.569 4×lgFSI-8.076 4,L同胞=1.480 7×lgFSI-9.860 9;无关个体组分别为L无关=-1.346 1×lgFSI-3.638 5,L无关=-1.3309×lgFSI-3.851 7,L无关=-1.319 2×lgFSI-5.910 2,L无关=-1.273 8×lgFSI-7.477 6.平均错判率分别为:1.361 9％、1.228 5％、0.438 6％和0.146 2％.结论 ITO判别函数法在全同胞-无关个体鉴定中具有很高的应用价值,且检测基因座越多,系统效能越高,并能降低错判风险.
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采用自主研发似然比率计算器进行ITO亲缘关系分析
目的 探讨采用自主研发的似然比率计算器进行ITO法亲缘关系鉴定的可行性.方法 针对GoldeneyeTM DNA ID System 20A系统的19个常染色体STR基因座分型数据,使用自主研发的似然比率计算器,人工模拟100 000对无关个体及100 000个家系的父子、同胞、半同胞、一、二代堂表兄弟,应用ITO法,自动分析计算亲权指数(PI)和亲缘关系概率(RCP).结果 父子和无关个体关系概率界值下无重叠,具有显著差异.同胞关系概率大于99.99％时,同胞占66.48％,无关个体占0％,具有显著差异；概率小于99.99％时,同胞个体和无关个体有部分重叠,具有一定差异.半同胞关系概率大于99.99％时,半同胞占1.52％,无关个体占0％,具有显著差异；概率小于99.99％时,两组有部分重叠,具有一定差异.一、二代堂表兄弟关系概率为10％ ～ 90％范围内时,无关个体分别占90％,99.98％,无法推断.结论 本文方法可用于推断父子关系、同胞关系、半同胞关系.
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同胞关系鉴定尸源2例
利用亲子鉴定进行尸源鉴定,国内外已很常见[1～4],当父母或单亲与子女关系已确定时,鉴定无名尸体或碎尸与其有无亲缘关系,从而达到尸源认定的目的.其中,以父母关系确定,要求鉴定无名尸体或碎尸与父母间的亲缘关系多见[2,3].但应用该原理对其他亲缘关系(隔代成员、同胞、旁系亲属等)进行尸源鉴定并不多见,本文在实际案件中成功利用同胞血缘关系鉴定尸源2例.现报道如下:
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祖孙亲缘关系鉴定1例
1 案例1.1 简要案情张某(独女)未婚生育一男孩,孩子生父不详,后张某意外身亡,张某的父母为给孩子上户口,委托本鉴定所进行祖孙亲缘关系鉴定.
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姨与外甥亲缘关系鉴定1例
1 案例1.1 简要案情孙某与张某(男)户口本上显示两人为母子关系,因遗产继承问题,孙某委托本单位证明二人为姨与外甥关系,进行亲缘关系鉴定.1.2 检验方法应用Chelex-100法提取二人外周血基因组DNA,采用GoldeneyeTM DNA身份鉴定系统20A试剂盒、GoldeneyeTM DNA身份鉴定系统22NC试剂盒[基点认知技术(北京)有限公司]、PowerPlexTM Fusion试剂盒(美国Promega公司)、HDplex试剂盒(德国QIAGEN公司)检测的常染色体基因座个数分别为19个、21个、22个、12个,其中D3S1358基因座为GoldeneyeTMDNA身份鉴定系统20A试剂盒、GoldeneyeTM DNA身份鉴定系统22NC试剂盒和PowerPlexTM Fusion试剂盒共有,D18S51、D12S391基因座为GoldeneyeTM DNA身份鉴定系统20A试剂盒、HDplex试剂盒和Power-PlexTM Fusion试剂盒共有,D19S433、D5S818、D21S11、D13S317、D7S820、D16S539、CSF1PO、Penta D、vWA、D8S1179、TPOX、Penta E、TH01、D2S1338、FGA 15个基因座为GoldeneyeTM DNA身份鉴定系统20A试剂盒和PowerPlexTM Fusion试剂盒共有,D2S441、D1S1656、D10S1248基因座为GoldeneyeTM DNA身份鉴定系统22NC试剂盒和PowerPlexTM Fusion试剂盒共有,D4S2366、D7S1517、D3S1744 、D8S1132、D5S2500基因座为GoldeneyeTM DNA身份鉴定系统22NC试剂盒和HDplex试剂盒共有.
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应用常染色体STR基因座共有等位基因数判别全同胞关系
目的 建立基于常染色体STR基因座共有等位基因数的全同胞关系判别标准. 方法 根据280对全同胞及2003对无关个体Identifiler系统15个STR基因座的分型结果 .对15个STR基因座的共有等位基因数(S15)和全同胞指数(FSI)进行统计,应用SAS 8.2软件包得出Fisher判别函数并与ITO法结果 进行比较. 结果 全同胞对及无关个体对中共有等位基因数目均符合正态分布.采用Identifiler系统15个STR基因座共有等位基因数进行全同胞关系判别时,判别函数分别为:ZFS=3.26970S15-31.511 74和ZUI=1.70058S15-8.52411.用上述判别函数进行全同胞/无关个体关系判别时的平均错判率为0.0298.15个STR基因座共有等位基因数法、CODIS 13个STR基因座共有等位基因数法与ITO法判别结果 差异无统计学意义. 结论 应用常染色体STR基因座的共有等位基因数判别全同胞关系简便、可信,易于掌握且不受STR基因座等位基因频率的影响.
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ITO法和判别函数法在同胞关系鉴定中的应用
目的 探讨ITO法和判剐函数法在全同胞、半同胞关系鉴定中的应用价值. 方法根据500对全同胞、50对半同胞及500对无关个体的15个STR基因座(PowerPlexTM 16体系)的分型结果,采用ITO法分别计算全同胞关系指数(PSI)、半同胞关系指数(HSI)及其比值(FSI:HSI).比较三组配对个体的等位基因匹配情况,计算分型结果全不同的基因座数(X0)、半相同的基因座数(x1)和完全相同的基因座数(χ2),利用SPSS 13.0分析软件建立全同胞、半同胞和无关个体的判别函数.结果 (1)以FSI≥19、FSI<1作为全同胞与无关个体的判别标准,交互准确率为96.4%;以HSI≥19、HSI<1作为半同胞与无关个体的判别标准,交互准确率为85.3%:以FSI:HSI≥1、FSI:HSI<1作为全同胞与半同胞的判别标准,交互准确率为87.5%.(2)分别建立了全同胞-半同胞-无关个体、全同胞-无关个体、半同胞-无关个体、全同胞-半同胞4组判别函数,判别函数交互准确率为84.4%～97.7%,其中同胞-无关个体判别准确率高.结论 ITO法与判别函数法在全同胞、半同胞鉴定中均具有较高的应用价值.
