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血清蛋白指纹图谱在食管癌中的应用
目的 采用蛋白质芯片技术分析食管癌患者血清蛋白质谱的差异,探讨其临床应用价值.方法 采用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术,使用弱阳离子交换(WCX-2)蛋白芯片分别检测食管癌患者放疗前后、接受调强放疗和普通放疗、转移和非转移患者的血清蛋白指纹图谱,采用蛋白质芯片阅读机读取数据,Ciphergen Protein Chip 3.0分析软件采集数据,读取峰信息,进行统计学分析.结果 在放疗前后食管癌患者血清中,发现质荷比为3884.213、1699.600、1371.126、8454.341、1141.881、1473.377、2086.908、2785.016的8个蛋白峰差异具有统计学意义；在接受不同放疗方式食管癌患者血清中,发现质荷比为3470.098、2011.529、3395.789、2639.055、1511.632、11488.520、9546.555、4783.831的8个蛋白峰差异具有统计学意义；在发生与未发生转移食管癌患者血清中,发现3470.098、3395.789两个蛋白峰差异具有统计学意义.结论 血清蛋白指纹图谱分析在食管癌的疗效和预后判断等方面显示出非常好的前景.
关键词： 食管肿瘤 表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术 -
电离飞行时间质谱技术在肺癌早期诊断中的应用现状及前景
肺癌是常见的肿瘤相关性死亡原因,预后较差,胸部X线及痰细胞筛查不能有效提高生存率.表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)具有分析速度快、高通量、样品用量少、敏感度高和特异性强等特点,能直接分析组分复杂的生物样品.该技术也成功地用于研究肺癌的肿瘤标志物,在肺癌的早期诊断、治疗和预测预后等方面获得了明显进展.
关键词： 表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术 肺癌 早期诊断 -
应用SELDI技术建立甲状腺癌辨证分型的血清蛋白质组学诊断模型
目的:探讨甲状腺癌不同证型间的血清蛋白表达质谱的差异并构建诊断模型.方法:应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术分别检测19例肝郁气滞型和21痰瘀互结型甲状腺癌的血清蛋白质指纹图谱,筛选出两组间特异性表达差异蛋白,并结合生物信息学方法建立诊断模型.结果:在2000～ 20000Da范围内共检测到86个蛋白质峰,其中22个蛋白质峰在两组之间表达有显著性差异(P＜0.01),17个蛋白质峰在肝都气滞组中高表达,5个蛋白质峰在痰瘀互结组中高表达,BPS判别分析选出M/Z为4099.85、9418.17的2个蛋白质峰构建两组间血清差异蛋白决策树分类诊断模型.结论:初步建立了甲状腺癌的中医辨证模式——血清蛋白质指纹图谱,也为中医证候实质的研究探讨新的方法和途径.
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SELDI-TOF-MS技术在贲门癌诊断中的初步研究
目的 寻找贲门癌肿瘤标记物并建立诊断模型.筛选提示发生淋巴转移的差异蛋白,为临床早期诊断贲门癌及判断预后提供新方法.方法 CM10蛋白芯片结合表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)检测101例贲门癌患者及118例正常对照者血清蛋白,Biomarker Wizard 软件和Biomarker Patterns System(BPS)分析得差异蛋白并建立贲门癌诊断分类树,双盲法验证其准确性.进一步分析对比有、无淋巴转移的贲门癌患者血清蛋白指纹图谱,得到差异蛋白.结果 对照分析贲门癌患者和正常对照组的血清蛋白指纹图谱得56个差异蛋白(P<0.05),经BPS软件筛选,以质荷比为5 480.49(P<10-8)的蛋白为主根结点建立贲门癌诊断模型,其灵敏度为95.05%,特异度为95.76%.得到可提示淋巴转移的差异蛋白3 820.87(P<0.05),其灵敏度为84.4%,特异度为82.1%.结论 SELDI-TOF-MS技术可建立有较高灵敏度和特异度的贲门癌诊断模型,筛选出能够提示发生淋巴转移的差异蛋白,有助于贲门癌的早期筛查、诊断和预后判断.
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SELDI技术筛选肺癌患者血清标志蛋白的临床价值
目的 探讨表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术筛选肺癌患者血清标志蛋白的临床价值.方法 用SELDI-TOF-MS技术、弱阳离子交换蛋白芯片,检测肺癌和肺良性病变患者的血清蛋白质质谱图;用Biomarker Pattern软件分析肺癌差异蛋白并初建其诊断模型,通过盲筛验证诊断模型.结果 发现有统计学差异的蛋白峰20个,其中肺癌患者血清高表达蛋白质波峰14个,低表达蛋白质波峰6个;用质荷比2 090.77、2 503.31 Da的差异蛋白峰建立分类树模型,其诊断肺癌的灵敏度88%,特异度95%;盲筛验证灵敏度90%,特异度100%,粗符合率93.33%,Youden指数0.9.结论 SELDI-TOF-MS技术筛选的肺癌血清差异性蛋白及分类树模型,诊断肺癌的灵敏度高、特异性好.
关键词： 表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术 肺肿瘤 标志蛋白 血清 -
血清蛋白质标记物在先天性巨结肠患儿中的应用
目的 通过检测先天性巨结肠(HD)患儿血清蛋白质筛选特异的蛋白质标记物,构建用于HD早期筛选及诊断的血清蛋白质指纹图谱模型.方法 应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测82例血清标本(HD组42例,其他类型肠梗阻组、健康对照组各20例)的蛋白质质谱,并结合生物信息学方法 (支持向量机)分析数据.结果 1.HD组与健康对照组比较:筛选出3个M/Z位于3 221.7、5 639.2、6 884.2的蛋白质标记物,构建HD早期筛选及诊断模型,3个标记物在HD组低表达,其在HD组和健康对照组的表达强度分别为378.29±273.34、295.65±159.38、444.13±254.06和1 428.18±1 192.61、1 039.60±785.64、1 115.72±680.48,2组比较均有显著性差异(Pa<0.01).经留一法交叉验证,区分HD和健康儿童的血清蛋白质指纹图谱模型的特异性和敏感性均为100%.2.其他类型肠梗阻组与健康对照组比较:在M/Z位于2 694.2、3 520.2位点上均无显著性差异(Pa>0.05).结论 SELDI-TOF-MS结合支持向量机建立HD血清蛋白质指纹图谱模型是早期筛选及诊断HD的一种特异性强、敏感性高的新方法 .
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单耐利福平结核分枝杆菌株早中期培养滤液蛋白质/多肽谱分析
目的 对比分析单耐利福平(RFP)结核分枝杆菌株与敏感结核分枝杆菌株早中期培养滤液蛋白质/多肽谱的差异,以寻找检测RFP耐药的检测标志物.方法 利用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术对结核分枝杆菌参考株(ATCC 27294)、10株单耐RFP结核分枝杆菌株的Middlebrook 7H9液体培养第7天和第14天培养滤液进行蛋白质/多肽谱分析.结果 与Middlebrook 7H9培养液蛋白质/多肽谱相比,结核分枝杆菌参考株、单耐RFP结核分枝杆菌株的第7、14天培养滤液中分别存在144、152、131和140种差异蛋白质/多肽;与结核分枝杆菌参考株的第7、14天培养滤液相比,单耐RFP结核分枝杆菌株的第7、14天培养滤液中分别存在39、72种差异蛋白质/多肽;与结核分枝杆菌参考株、单耐RFP结核分枝杆菌株的第7天培养滤液相比,其各自第14天培养滤液中分别存在82、64种差异蛋白质/多肽.结论 RFP耐药分枝杆菌株的早中期培养滤液中存在与敏感分枝杆菌早中期培养滤液中相异的蛋白质/多肽,有望从中筛选到RFP耐药的检测标志物.
关键词： 结核分枝杆菌 利福平 蛋白质组学 表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术 -
医院分离耐碳青霉烯类药物鲍曼不动杆菌亲缘性的研究
目的：通过分析鲍曼不动杆菌（Ab）碳青霉烯类药物耐药和敏感菌株蛋白指纹图谱，了解碳青霉烯类药物耐药菌株亲缘性远近的临床应用价值。方法收集临床分离对碳青霉烯类药物耐药（22株）和敏感的 Ab（18株），利用表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术（SELDI-TOF-MS）检测细菌蛋白质指纹图谱。采用 Biomarker Wizard 3．1软件分析碳青霉烯类药物耐药和敏感 Ab 相关差异蛋白，采用 SPSS 19．0对差异蛋白进行聚类分析，追溯其临床感染的亲缘性。结果碳青霉烯类药物耐药与敏感的 Ab 菌株间蛋白质谱的表达差异有统计学意义（P＜0．05）。聚类分析结果显示碳青霉烯类药物耐药 Ab 在院内的分布以A 型为主，B 型次之。结论聚类分析碳青霉烯类抗菌药物耐药的 Ab 蛋白质谱结果能够判断细菌亲缘关系远近，可为 Ab 感染和临床流行病学调查提供理论依据。
关键词： 鲍曼不动杆菌 表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术 聚类分析 蛋白组学 -
SELDI-TOF-MS血清蛋白指纹分析诊断食管癌的系统评价
目的 系统评价表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)检测血清蛋白组对食管癌的诊断效率.方法 通过计算机检索Pubmed、Higwire等数据库和手工检索相关期刊全面检索当前使用SELDI-TOF-MS诊断食管癌的文献,并使用QUADAS工具对纳入的文献进行质量评价,采用MetaDisc1.4软件进行Meta分析,综合评价灵敏度、特异度、似然比、诊断优势比和综合接受者工作特征(SROC)曲线下面积(AUC)、Q*指数等指标.结果 共检索到11个文献研究符合纳入标准,累积样本含量1 350例.Meta分析结果显示,综合灵敏度为90.00%、特异度84.11%、阳性似然比5.09、阴性似然比0.14、诊断优势比39.17.SROC曲线分析,AUC=0.916 0,Q*=0.848 8.结论 SELDI-TOF-MS检测血清蛋白组对诊断食管癌具有较高的临床应用价值.
关键词： 表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术 食管癌 蛋白组学 系统评价 -
表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术对肝细胞癌诊断价值的系统评价
目的 系统评价当前研究表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术(surface enhanced laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)诊断肝细胞癌文献的质量,了解SELDI-TOF-MS技术对诊断肝细胞癌的准确性.方法 采用计算机和手工全面检索收集当前研究SELDI-TOF-MS对肝细胞癌诊断的文献,并根据诊断性研究质量评价工具(quality assessment of diagnostic accuracy studies,QUADAS)质量评价标准评价符合纳入标准的文献的质量,根据可供分析的资料,进行Meta分析.结果 共检索到相关文献134篇,符合纳入标准的文献10篇,其中中文文献7篇、英文文献3篇.在合并分析中综合灵敏度、特异度和优势比(DOR)分别为87.00%,94.00%和196.42,SROC曲线下面积为0.98.结论 SELDI-TOF-MS技术对肝细胞癌具有较好的诊断价值.
关键词： 系统评价 表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术 Meta分析 肝细胞癌
