轮状病毒分类与命名

轮状病毒(rotavirus,RV)是不含囊膜、有三层壳体、基因组为11个片段的双链RNA病毒,是人类、哺乳类和鸟类急性胃肠炎的重要病原体.RV结构复杂,成员众多,建立一个能区分不同病毒株及其基因型(血清型)的分类与命名系统,对深入研究RV生物学、免疫学性质及其分子遗传进化和亲缘关系,促进国际学术交流和有效预防与控制RV感染,具有重要的意义.

全球儿童轮状病毒疾病死亡率的估计

90例非轮状病毒腹泻患儿粪便中诺瓦克样病毒的检测

目的了解90份婴幼儿腹泻病人轮状病毒分子生物学方法检测阴性的粪便标本中诺瓦克样病毒感染状况.方法应用酶联免疫吸附实验方法(ELISA)进行诺瓦克样病毒抗原检测.结果90份粪便标本中诺瓦克样病毒Ⅰ型(G1和Ⅱ型(G2)阳性分别检出6例和19例,阳性率分别为6.67%和21.11%,两者差异有显著性.结论诺瓦克样病毒感染可能是武汉地区婴幼儿腹泻的重要病因之一,其中基因Ⅱ型为主要流行株.

一起新生儿病毒性腹泻病原学分析

目的 查明引起新生儿病毒性腹泻疫情的病原并对其进行分子生物学特征分析.方法 采用金标法检测轮状病毒抗原,采用乳胶凝集法检测腺病毒;通过聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)检测粪便样品中的轮状病毒核酸;利用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测肠道病毒和扩增轮状病毒VP7基因并测序;利用DNAstar和Blast软件对测序结果进行分析.结果 11份样品中,金标法检测到轮状病毒阳性样品9份,阳性率为81.82%;腺病毒和肠道病毒检测均为阴性;PAGE法检测到10份轮状病毒阳性样品,电泳带型为4-2-3-2的样品有8份,阳性率为72.73%,另2份阳性样品的电泳条带特殊;8份带型为4-2-3-2的阳性样品均能通过RT-PCR扩增出VP7基因,选择其中3份样品进行测序,测序结果经过比对发现这3个毒株的核苷酸的同源性为99.90%,氨基酸的同源性为100%,与G1型标准株Wa的核苷酸同源性分别为91.30%～91.50%,氨基酸同源性为94.80%;与泰国流行株Thai-2104亲缘关系近,与中国以前的流行株处于不同的进化分支上.结论 引起此次新生儿病毒性腹泻疫情的病原是A组轮状病毒,PAGE带型主要为4-2-3-2,其血清型为G1型.

一起由轮状病毒引起的成人腹泻暴发流行分析

轮状病毒(Rotaviruses,Rv)属于呼肠孤病毒科轮状病毒属,根据病毒基因结构和抗原性不同,Rv分为A-G七个组,引起人感染致病的主要属A组和B组.

降钙素原、白介素-6、C反应蛋白和白细胞在感染性腹泻鉴别诊断中的应用价值

目的 探讨降钙素原(procalcitonin,PCT)、白介素-6(interleukin-6,IL-6)、C反应蛋白(C reative protein,CRP)和白细胞(white blood cell,WBC)在儿童腹泻过程中的诊断价值.方法 收集85例腹泻患儿和35例健康体检儿童的标本,根据检测结果和病史分为轮状病毒组(48例)、细菌感染组(37例)和正常对照组(35例),在入院第4天再次对轮状病毒组进行粪便培养,根据结果分为无继发细菌感染组和继发细菌感染组.检测轮状病毒抗原、PCT、IL-6、CRP和WBC水平.结果 轮状病毒组的PCT、IL-6、CRP和WBC均低于细菌感染组,但高于正常对照组且差异均有统计学意义(P＜0.05);PCT、IL-6、CRP和WBC均具有较强的诊断效力,PCT和IL-6的阳性预测值、阴性预测值、特异性、敏感度略优于CRP和WBC;轮状病毒组的并发细菌感染患儿在入院第4天和第7天的PCT、IL-6、CRP和WBC也均显著高于无并发细菌感染患儿.结论 血清中PCT、IL-6、CRP和WBC检测在轮状病毒性儿童腹泻的鉴别诊断具有较高的效力,可以作为轮状病毒性腹泻患儿早期诊断、疗效评估和并发症预测指标.

湖南省新晃县5岁以下儿童病毒性腹泻的病原监测

目的 了解和掌握湖南省新晃县≤5岁住院腹泻儿童流行特征和病毒性腹泻病原谱构成.方法 收集新晃县哨点医院2009-2011年≤5岁住院腹泻患儿的粪便标本,采用Dako公司酶免疫试剂盒检测轮状病毒,采用反转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)进行分型鉴定；采用PCR检测腺病毒；RT-PCR法检测星状病毒和杯状病毒.结果 2009-2011年新晃县哨点医院共登记住院患者数47 305例,其中≤5岁儿童住院数9714例,≤5岁以下腹泻儿童住院数1506例,占≤5岁住院儿童总数的15.50％；采样检测1063份标本,轮状病毒、腺病毒、杯状病毒和星状病毒的阳性率分别为18.38％、4.04％、8.84％和0.47％,4种病毒检测阳性率差异有统计学意义(x2=251.623,P=0.000)；A组轮状病毒P分型2009、2010年以P[4]为主,2011年以P[8]为主；G分型2009、2011年以G[3]为主,2010年以G[1]为；不同性别病例检测轮状病毒差异有统计学意义(x2=5.657,P=0.017);不同年龄病例标本检测结果除杯状病毒阳性率差异有统计学意义外,其余3种病毒的阳性率差异均无统计学意义；轮状病毒、腺病毒、杯状病毒不同月份的阳性检出率差异有统计学意义.结论 轮状病毒是新晃县≤5岁住院腹泻儿童病毒性腹泻的主要病原体,杯状病毒、腺病毒也占有一定的比例,星状病毒感染较少.

2015-2016年浙江省台州市感染性腹泻轮状病毒分子流行病学研究

目的 分析2015-2016年浙江省台州市腹泻病例轮状病毒感染的流行病学特征、病毒基因型别及变化特征,为感染性腹泻的预防与控制提供实验室支持.方法 收集2015-2016年台州市哨点医院感染性腹泻就诊患者信息及粪便标本,采用双重荧光方法检测A/B组轮状病毒,对A组轮状病毒阳性的标本进行G/P基因分型和测序,并对主要型别的VP7基因进行同源性和系统进化分析.结果 轮状病毒总检出率为5.10％(81/1 589),其中A组轮状病毒占98.77％(80/81),B组轮状病毒占1.23％(1/81).流行特征显示年龄、季节、职业等差异有统计学意义,性别和籍贯等差异无统计学意义.A组轮状病毒基因型别主要包括G9P[8](53.75％)、G2P [4] (25.00％)、G3P [8] (11.25％)、G1P[8](2.50％)、G4P[6](2.50％).VP7基因同源性和进化分析显示,G9P[8]型主要是G9-Ⅵ亚型,相同基因型轮状病毒同源性高.结论 轮状病毒是台州市感染性腹泻人群中的常见病原体;A组轮状病毒在本地区呈现多样性和稳定性.建议将G9型引入疫苗株,并对腹泻人群尤其是儿童进行持续性的病原学监测.

2013年北京地区5岁以下儿童病毒性腹泻病原学研究

目的 了解北京地区5岁以下儿童病毒性腹泻的流行病学特征,为病毒性腹泻的防治提供理论依据.方法 全年随机采集北京市2家三级甲等医院的5岁以下腹泻患儿粪便标本,利用酶联免疫吸附试验检测轮状病毒(HRV)、用聚合酶链反应(PCR)检测杯状病毒(HuCV)、肠道腺病毒(AdV)及星状病毒(AstV).结果 研究期间共收集病毒性腹泻患儿粪便标本243份,标本总阳性检出率52.7％(128/243),4种病毒阳性检出率分别为HRV(26.3％,64/243)、HuCV(16.9％,41/243)、AdV (4.9％,12/243)和AstV(4.5％,11/243),分别占总阳性检出的49.9％、32.1％、9.3％和8.5％(其中包括混合感染10例,占总阳性检出的7.8％).患者以≤2岁儿童为主,不同年龄组之间病毒总检出率差异有统计学意义(x2=13.397,P =0.009),不同病毒发病高峰期不同,男女罹患率差异无统计学意义(x2=0.220,P＞0.05).结论 HRV和HuCV是引起婴幼儿病毒性腹泻的主要病原体;4种病毒总检出率以12 ～ 18月龄组高;全年中以12月的病毒检出率高;存在一定比例的混合感染.

2010年广东省深圳市病毒性腹泻监测结果分析

目的 了解广东省深圳市病毒性腹泻的感染情况.方法 采用实时荧光定量-聚合酶链反应对2010年1 -12月深圳市925例疑似腹泻患者粪便标本同时进行轮状病毒、诺如病毒、星状病毒和肠道腺病毒核酸检测.结果 4种常见腹泻病毒的检出率分别为25.30％、20.11％、1.51％和2.27％.轮状病毒和诺如病毒全年各月均维持较高的检出率；轮状病毒感染有明显的季节特征,秋冬季为发病高峰；诺如病毒感染则无特殊的季节特征.0～2岁年龄组患者的感染率显著高于3岁以上年龄组患者.结论 2010年深圳市病毒性腹泻呈高发状态,其中轮状病毒和诺如病毒是主要的病原之一,星状病毒与肠道腺病毒的检出率较低.应加强对病毒性腹泻,尤其是婴幼儿病毒性腹泻的监测.

2008-2009年天津市5岁以上人群病毒性腹泻监测分析

目的 分析天津市2008 -2009年病毒性腹泻流行概况和病原学特征,探索其流行规律,旨在为制定控制病毒性腹泻疫情的策略提供参考依据.方法 收集5岁以上腹泻病例的粪便标本进行抗原检测及分型,流行病学调查资料进行描述性分析和单因素分析.结果 天津市2008-2009年5岁以上人群腹泻病例A组轮状病毒检出率为14.18％,以G3型为主；诺如病毒检出率为7.72％,以GⅡ为主.检出阳性病例发病时间集中在10月至翌年3月,干部职员、离退休人员及家务待业人员病毒检出率高于工人、农民、公共服务人群(x2=29.341,P＜0.001),以农村人口为主的远郊区(县)病毒抗原检出率低于市区人群(P =0.008,OR =0.420).白细胞≤10/HPF(400倍)的病例中使用抗生素的仅占6.6％.结论 天津市5岁以上人群病毒性腹泻以轮状病毒感染为主,积极研发成年人轮状病毒疫苗用于重点人群接种,提高医务人员对病毒性腹泻的诊断和鉴别诊断能力,合理使用抗生素,以减少不必要的经济负担.

2011-2013年深圳市福田区轮状病毒感染情况分析

目的 了解深圳市福田区轮状病毒的感染情况,为制定预防轮状病毒感染的策略提供依据.方法 采用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time PCR)对2011-2013年深圳市福田区1728例疑似病毒性腹泻患者粪便标本进行轮状病毒的核酸检测.结果 2011-2013年福田区轮状病毒的总体检出率为18.29％(316/1728),2011-2013年检出率起伏较大,分别为22.16％ (115/519)、13.13％ (73/556)和19.60％(128/653);男性检出率为18.53％(184/993),女性检出率为19.96％(132/735);轮状病毒在冬季的检出率高(34.79％,167/480),秋季次之(20.67％,87/421),春季、夏季的检出率较低.0～5岁年龄组患者的检出率(21.01％,232/1104)显著高于5岁以上年龄组患者的检出率(13.46％,84/624),差异有统计学意义,(x2=29.5786,P＜0.05).结论 轮状病毒是福田区病毒性腹泻的重要病原体之一,2011-2013年检出率呈较大起伏;冬季是轮状病毒感染的高发季节;0～5岁婴幼儿患者是轮状病毒感染的重点人群;应加强对轮状病毒腹泻的监测,尤其应加强对婴幼儿轮状病毒感染的预防控制.

2015年湖北省武汉市5岁以下儿童病毒性腹泻病原学研究

目的 调查2015年湖北省武汉市＜5岁儿童病毒性腹泻的流行病学特征.方法 收集2015年武汉市儿童医院＜5岁全部腹泻患儿粪便标本及相关临床信息,采用酶联免疫吸附试验检测A组轮状病毒(RV),PCR方法检测肠道腺病毒(AdV),反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)检测诺如病毒(NOV)、札如病毒(SaV)、B组和C组轮状病毒及星状病毒(AstV),利用巢式RT-PCR对轮状病毒进行G/P基因分型.分析病毒性腹泻病原分子流行特征.结果 2015年武汉市＜5岁全部腹泻患儿3 009例,病毒性腹泻病例流行季节以RV为明显,9-11月病例数占阳性病例数的50.3％;NoV的流行高峰在9-10月,占阳性比例的40.9％.AdV占2.0％、AstV占1.8％,SaV、B组和C组RV未检出.病毒性腹泻的发病年龄主要为＜2岁婴幼儿.RV毒株G型与P型血清型分型结果显示,G型与P型组合则主要以G3P [8]和GIP[8]为主,构成比分别为37.4％和17.9％.结论 武汉市儿童病毒性腹泻病例携带的病原体具有多样性,以RV为主,主要流行株为G3P [8].

2012年长春市儿童医院婴幼儿轮状病毒性腹泻监测分析

目的 了解长春市儿童医院5岁以下儿童轮状病毒性腹泻的流行病学特征及临床症状.方法 对轮状病毒感染的流行病学特征、实验室检测结果和临床症状进行分析.结果 共采集标本387份,其中轮状病毒(HRV)阳性225份,阳性率为58.14％,其中HRV合并其他致腹泻性病毒感染29份;HRV血清型G分型以G9型为主,P分型以P8型为主;13～18月龄之间检出率较高,男女性别比为1.59∶1,HRV检出高峰在10-12月.结论 HRV是引起长春市儿童医院婴幼儿病毒性腹泻的主要病原体,做好病毒性腹泻的监测工作有利于早期采取干预措施,制定防控措施和方法,降低5岁以下儿童病毒性腹泻的发生率.

2010年乌鲁木齐市住院儿童病毒性腹泻监测结果分析

目的 了解乌鲁木齐市住院儿童病毒性腹泻的流行现状.方法 2010年1-12月采集乌鲁木齐市379例腹泻住院患儿粪便标本,用酶联免疫吸附试验(ELISA)、反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)和聚合酶链反应(PCR)检测5种常见腹泻病毒.结果 229份(60.4％)粪便标本检出至少1种病毒.轮状病毒、诺如病毒、星状病毒、肠道腺病毒和札如病毒检出率分别为45.6％、14.2％、4.2％、3.2％和1.1％.混合感染共26例,以轮状病毒和诺如病毒组合占首位(50.0％,13/26).1-3月和10-12月是轮状病毒流行高峰期；诺如病毒流行主要发生在10月.轮状病毒感染平均年龄小于诺如病毒感染平均年龄(P =0.002),肠道腺病毒和札如病毒感染全部发生于＜2岁儿童.结论 轮状病毒仍是2010年乌鲁木齐市儿童病毒性腹泻的主要的病原体,其次是诺如病毒；混合感染占一定比例,在以后的流行病学及病原学研究中应该更加关注混合感染的出现.

2007-2009年广东省深圳市感染性腹泻流行特征分析

目的 了解深圳市2007-2009年感染性腹泻流行特征,为感染性腹泻的有效控制提供依据.方法 对深圳市2007-2009年疾病监测信息报告系统中上报的感染性腹泻病例进行描述性流行病学分析.结果 2007-2009年深圳市共报告感染性腹泻病例49 503例,年发病率为148.6/10万-233.0/10万,其中2008年发病率较高.5岁以下年龄组占全部发病数的84.6%,散居儿童占总病例数的83.9%;10-12月为发病高峰.报告发病率居前5位的区为宝安、盐田、龙岗、罗湖和福田,报告单位类别主要为综合性医院、妇幼保健院,合计高达87.7%;轮状病毒感染所致的其他感染性腹泻病例28 822例,占报告病例总数的58.2%.结论 深圳市2007-2009年感染性腹泻报告病例主要集中在0-5岁散居儿童,秋冬季是好发季节,轮状病毒感染为主要病因.

中国26省(直辖市、自治区)2011-2014年5岁以下儿童腹泻病例轮状病毒流行特征分析

目的 了解我国5岁以下儿童腹泻患者中轮状病毒的流行特征.方法 在国内26省(直辖市、自治区)162家医院的门/急诊中开展腹泻监测,收集腹泻病例临床和流行病学资料,同时采集病例粪便标本,送92家网络实验室采用酶联免疫吸附试验(ELISA)、反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)和巢式PCR等方法检测轮状病毒,并分析2011-2014年不同时间、不同地区5岁以下儿童腹泻患者中轮状病毒检出率以及不同基因型的变异变迁情况.结果 在19 849例儿童腹泻病例中,22.9％的病例检出轮状病毒,其中,1～2岁和6月龄至1岁儿童检出率高,分别为29.0％和26.1％.轮状病毒在水样便中检出率高,为26.2％.轮状病毒在冬季检出率高,为39.4％,夏季检出率低,为9.9％.轮状病毒在我国南部和中部地区的检出率高,分别为28.0％和27.0％.A组轮状病毒为常见的血清型,占95.1％,其中G9P[8]、G1 P[8]和G3 P[8]为常见,分别占39.5％、16.8％和9.9％.2011年以来,G9P[8]逐渐取代G1P[8]和G3 P[8]成为目前我国主要的流行株.结论 轮状病毒是我国5岁以下儿童腹泻的常见病原体,并且呈现明显的时间和空间流行特征,G9 P[8]为主要流行株.

2008-2014年浙江省某医院腹泻患者轮状病毒感染情况分析

目的 了解浙江省杭州市余杭区某医院A群轮状病毒的感染情况,为该院轮状病毒性腹泻防控提供科学依据.方法 采用A群轮状病毒试剂盒(乳胶法)对2008-2014年余杭区某医院42 736例腹泻患者粪便标本进行轮状病毒抗原检测,并用统计学软件对检测结果进行分析.结果 2008-2014年余杭区某医院A群轮状病毒的总体阳性检出率为11.89％(5080/42 736),2009-2013年间轮状病毒阳性检出率呈逐年递增趋势,其中2011年与2012年间增幅大(5.01％).女性比男性更易感染A群轮状病毒(x2=10.45,P＜0.0i),两者阳性检出率分别为12.48％(2231/17 871)和11.46％(2849/24 865).A群轮状病毒检出高峰集中在每年10月至次年1月,占全部阳性检出例数的72.07％(3661/5080),各年检出高峰在11月和12月之间转换.各年龄组均检出轮状病毒,5岁以下儿童的轮状病毒阳性检出率(12.32％)是5岁及以上人群(3.58％)的近4倍,且1～2岁年龄组阳性检出率高(23.48％).门诊和住院腹泻患者中的A群轮状病毒阳性检出率分别为12.30％和9.93％,门诊高于住院患者(x2 =32.99,P＜0.01).结论 余杭区某医院A群轮状病毒感染率低于杭州市及浙江省内其他地区水平.5岁以下儿童是医院防治轮状病毒性腹泻的重点人群,同时应加强成人轮状病毒的监测.门诊腹泻患者是医院轮状病毒腹泻管理的重点对象,应着重加强该类人群的隔离治疗和健康宣教.

预防儿童轮状病毒性胃肠炎的轮状病毒疫苗

免疫实施咨询委员会(ACIP)首次陈述有关使用口服活的轮状病毒疫苗的建议已于1998年8月31日由食品和药物管理局(FDA)批准使用于婴幼儿中.本文评述了轮状病毒的流行病学,描述了允许的轮状病毒疫苗并作出了用于有关美国婴幼儿常规免疫接种的一些建议.这些建议是根据美国儿童轮状病毒性胃肠炎的疾病负担估计提出的,并陈述了有关疫苗临床试验的一些结果.

撤消轮状病毒疫苗的推荐

1999年7月,CDC推荐卫生保健人员和父母亲对婴儿至少在1999年11月以前推迟使用弥猴轮状病毒4价疫苗(RRV-TV)(RotashieldR,Wyeth实验室Inc Marietta,宾夕法尼亚).该行动是根据接到轮状病毒疫苗在15名婴儿中导致肠套叠的疫苗有害事件报告做出的.同时,制造商还与食品与药品管理局(FDA)商量自觉停止疫苗销售.