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基于SSR标记的雷公藤属植物遗传多样性和遗传结构评价
雷公藤属植物是中药免疫抑制剂的首选原料药材.近年来,由于生态环境破坏和人为过度采挖,雷公藤属植物野生资源急剧减少,濒临灭绝,因此亟需保护其野生资源和评价其遗传多样性.本文通过简单重复序列分子标记(simple sequence repeat,SSR)探讨了28个雷公藤属植物野生居群(9个省共计396个样本)的遗传多样性和遗传结构.结果表明,雷公藤属植物具有较高遗传多样性水平,多态百分比(PPL)为77.29％,Shannon's信息指数(Ⅰ)为0.6394,平均基因杂合度(Ⅱ)为0.359 9.雷公藤属植物居群间存在较高的遗传分化,平均基因流(Nm)为0.228 7.Nei's遗传距离构建群体聚类树和Structure聚类分析表明28个居群可分为6支系,昆明山海棠主要被分成四川、云南、贵州-重庆3支,东北雷公藤单独聚为1支,雷公藤被分成2支,其中过渡类型LQ和NY被单独聚为1支.本文为雷公藤属植物野生资源保护、遗传多样性研究和分子标记辅助育种等方面的研究提供理论依据.
关键词： 雷公藤属植物 简单重复序列分子标记 遗传多样性 居群遗传结构 资源保护 -
云南草果种质资源的遗传多样性及亲缘关系的SSR分析
目的 评价云南草果居群的遗传多样性及亲缘关系.方法 运用7对微卫星引物对24个草果居群进行分析;首先应用GenALEx计算遗传多样性参数,并进行PCoA和AMOVA分析;采用NTsys软件绘制居群聚类图;后利用Structure软件计算出佳的K值.结果 24个草果居群的Shannon多样性指数(H)的平均值为0.49,期望杂合度(He)的平均值为0.32;遗传分化系数(Fst)为0.090,基因流(Nm)为2.930.24个草果居群的遗传分化有81％存在于居群内,仅有19％存在于居群间;黄花草果23个居群的遗传一致度(I)为0.631 8～0.9824,遗传距离(D)的范围为0.017 7～0.459 2,而白花草果居群(MG5)与其他23个黄花草果居群一致度均较小,为0.369 7～0.609 0;而居群聚类分析,在遗传距离0.49处,明显地把白花草果与黄花草果分开;Structure聚类得出K=4时,209份黄花草果资源可被分为4个类群.结论 云南黄花草果居群的遗传多样性水平平均偏高;遗传变异主要存在于居群内,而非居群间.根据基因型,黄花草果和白花草果被明显地划分成2类,遗传距离很远;而黄花草果大致被分为4个类群.
关键词： 草果 简单重复序列分子标记 遗传多样性 亲缘关系 聚类分析
