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FatB文献资料
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金银花类药用植物FatB基因克隆和生物信息学分析
从忍冬(Lonicera japonica Thunb.)转录组测序结果中分析获得1个FatB基因.分别以忍冬、红白忍冬(Lonicera japonica Thunb.var.chinensis (Wats.)Bak)、红腺忍冬(Lonicera hypoglauca Miq.)和水忍冬(Lonicera dasystyla Rehd.)新鲜花蕾为材料,利用RT-PCR技术克隆获得了LJFatB、LHFatB、LJCFatB、LDFatB 基因的全长cDNA,并进行生物信息学分析.结果表明LJFatB、LJCFatB、LHFatB和LDFatB与拟南芥AtFatB具有较近的亲缘关系.LJFatB、LJCFatB、LHFatB和LDFatB的核苷酸序列、蛋白特性及其二级结构有所差异,但其蛋白均具有保守的FatB底物结合位点和催化活性位点,且在花蕾中的转录水平没有显著差异.因此推测LJFatB、LJCFatB、LHFatB和LDFatB可能具有与AtFatB相同的生物学功能.