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二酮酸类文献资料
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芳基β-二酮酸类HIV-1整合酶抑制剂研究进展
人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)是艾滋病(acquired immune deficiency syndrome,AIDS)的病原体,分为HIV-1和HIV-2型.
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二酮酸类HIV-1整合酶抑制剂的研究进展
HIV-1整合酶催化前病毒DNA整合进入宿主细胞基因组的过程是病毒复制必不可少的步骤,所以抑制HIV-1整合酶活性是治疗HIV-1感染的合理策略.目前已开发了大量HIV-1整合酶抑制剂,其中一些已进入临床研究阶段,从化学结构看,绝大多数已报道的HIV-1整合酶抑制剂属于二酮酸类或其生物电子等排体.该文对近3年来二酮酸类HIV-1整合酶抑制剂的研究进展做简要综述.
关键词： HIV-1整合酶抑制剂 二酮酸类 雷特格韦 艾滋病化学治疗 -
二酮酸化合物与HIV-1整合酶识别的分子模拟研究
目的 研究二酮酸类化合物(diketoacids,DKAs)与HIV-1整合酶(integrase,IN)的分子识别机制和二者复合物的构象变化,为预测同类化合物抑制活性提供理论支持.方法 使用AutoDock程序包将10个二酮酸类化合物与整合酶进行了分子对接,得到一系列对接复合物模型.选取其中两个抑制活性有明显差异的复合物进行了15ns的分子动力学模拟,并从能量和氢键的角度分析了二者与HIV-1整合酶识别的关键残基.结果 二者特异性识别主要依靠与DDE基序形成的氢键,结合在由I141～M154,W61～L63和V77构成的口袋中,与实验数据吻合.基于分子动力学模拟轨迹做了结合自由能分解,其中范德华能项与lgIC50有较高的线性相关,结果表明该方程可用于此类化合物的活性预测.结论 氢键是抑制剂维持活性及复合物稳定的重要作用力.结合自由能中的疏水作用与抑制活性有明确的相关性.对后续HIV-1整合酶抑制剂设计具有一定的指导意义.
