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国人Stargardt病患者ABCA4基因突变分析与表型特征
目的通过对眼底黄色斑点症患者ABCA4基因突变分析,分析国人Stargardt病(STGDI)患者中ABCA4基因突变特点及其表型特征.设计回顾性病例系列.研究对象北京同仁医院可疑Stargardt病患者119例,其中17例家族史明确,102例为散发.方法利用PCR扩增DNA直接测序方法检测患者ABCA4基因50个编码外显子及外显子与内含子交界区,并记录患者的表型特征.主要指标ABCA4基因测序结果、家族史、眼底像、相干光断层扫描(OCT)、眼底自发荧光(AF)、视网膜电图(ERG)、视力.结果119例STGDI患者中110例(92.4％)检测到2个及以上ABCA4基因致病突变,9例(7.6％)检测到1个致病突变.本研究共检出136种突变,其中新发现突变16种.基因突变中55.1％(75/136)为错义突变,15.4％(21/136)为缺失或插入,17.6％(24/136)为剪接位点突变,11.8％(16/136)为无义突变.常见突变为无义突变p.YS08X,其等位基因频率高为17次(7.1％).STGDI 患者平均发病年龄(12.85±9.01)岁,平均佳矫正视力(0.11±0.12).结论本研究结果拓展了ABCA4基因突变谱.中国人STGDI患者发病年龄早、视力损伤重,且ABCA4基因特点与其他种族明显不同.
关键词： Stargardt病 ABCA4基因 -
目标区域捕获测序检测到一视网膜色素变性家系ABCA4基因新突变
目的 研究我国一个常染色体隐性遗传的视网膜色素变性(RP)家系患者的临床表型及致病基因突变,并分析表型与基因型间的关系.方法 实验研究.收集了宁夏人民医院眼科诊治的一个RP家系的临床资料,共有7名家庭成员参与研究,其中包括2名患者和5名正常成员.完善家系内所有参与成员的眼科检查,包括佳矫正视力(BCVA)、视野、眼底照相、光学相干断层扫描(OCT)及全视野视网膜电流图(ERG)等.针对180个已知的遗传性视网膜疾病致病基因及9个高度可疑的候选基因设计目标区域捕获芯片,利用该捕获芯片对先证者(Ⅳ-4)进行目标区域内的高通量二代测序,借助优化的生物信息学分析对捕获的遗传变异进行筛查过滤,终通过家系内共分离验证确认致病突变,进一步分析该突变与患者表型间的关系.结果 临床检查结果表明该家系内的2名患者的临床表现均符合典型的RP改变,遗传学分析结果证实了ABCA4基因c.419G＞A突变是该家系的致病突变.该突变导致了ABCA4基因所编码的蛋白第140号氨基酸由精氨酸变为谷氨酰胺(p.Arg140Gln),保守性分析显示该突变位点在各物种中高度保守,PloyPhen-2软件预测结果表明该突变具有较高的致病性.结论 本研究借助基于高通量二代测序平台的目标区域捕获测序,首次发现了ABCA4基因新突变p.Arg140Gln是一个常染色体隐性遗传RP家系的致病突变,进一步扩充了ABCA4基因的遗传突变谱及表型谱.
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全外显子组测序检测到一视网膜色素变性家系ABCA4基因致病剪切新突变
目的 探讨一个中国视网膜色素变性(RP)家系的致病基因及其位点.方法 实验研究.对一个RP家系的成员进行病史采集、视力检查、眼底检查及多焦视网膜电图(mfERG)检查.绘制家系图,对家系成员采血,进行DNA提取、全外显子组测序、数据分析和Sanger测序验证,并在500例健康对照者中进行测序验证.结果 共纳入该家系成员5例,含2例患者.患者表现为青少年期发病,夜盲,进行性周边视力受损,逐渐累及中央区.眼底检查显示视网膜色素沉着.mfERG显示a波、b波振幅明显下降甚至记录不到.家系特点为2例患者为姐妹,另一位姐妹正常,父母均正常,符合常染色体隐性遗传模式特征.经外显子组测序、数据分析和Sanger测序验证后,发现ABCA4变异性剪切位点c.1761-2A＞G发生纯合突变.另外,在500例健康对照者中,Sanger测序没有发现该位点纯合突变.结论 本研究发现了一个新的视网膜色素致病基因突变位点c.1761-2A＞G,扩大了ABCA4致病基因位点谱,为临床的诊断和治疗提供了新靶点.
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3个Stargardt家系ABCA4基因致病突变位点的筛查及验证
目的:对河南省Stargardt病(STGD)家系进行ABCA4基因突变位点分析.方法:收集3个家系12名成员外周静脉血,分别对先证者样本提取基因组DNA,构建基因组文库,捕获、富集主要致病基因ABCA4的外显子及相邻内含子区域,行高通量测序,与数据库比对,定位出疑似变异,后与家系其他成员及专业数据库进行对比验证,以确定变异.结果:共检测到5个ABCA4个基因突变,均为复合杂合突变:c.2894A>G(p.N965S),为错义突变;c.101106del(p.3436del),为缺失突变;c.5899-2A>G,为剪切突变;c.1222C>T(p.R408X),为无义突变;c.1982T>G(p. L661R),为错义突变.所有突变都在其父母一方对应位点存在杂合变异.c. 5899-2A > G、c.1222C>T、c.1982T>G 和 c.101106del为检测到的ABCA4基因新发突变.结论:检测到4个ABCA4基因新发突变,扩增了STGD ABCA4基因突变谱.
关键词： ABCA4基因 突变 黄斑营养不良 Stargardt病
