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利用噬菌体展示技术研究功能基因组和蛋白质-蛋白质相互作用——与酵母双杂交方法比较
近年来基因组测序工作已揭示了数以万计的新基因,但是这些基因序列的价值只有当这些数据被翻译成蛋白质功能的时候才能被了解.而蛋白质与蛋白质之间相互作用构成了细胞生化反应网络的一个主要组成部分,不仅可以从分子水平揭示蛋白质的功能,而且为我们更好地理解生命过程、疾病机制和新药开发等提供了一个很好的基础.
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重视心血管疾病中的内质网应激机制——从细胞应激的基本反应到临床防治的思考
基因组学和蛋白组学的发展极大地推动了生物医学的进步.近年来,以蛋白质为中心,上呈基因下联功能表型的研究为临床疾病的防治开拓了新的领域.内质网应激(endoplasmic reticulum stress,ERS)即是这样一个新概念.蛋白质功能取决于其正确折叠和修饰,这主要由内质网完成,内质网还调控脂质和胆固醇合成、钙稳态、细胞凋亡和自噬等细胞基本生命活动.内质网通过启动并整合细胞核、线粒体和高尔基体等亚细胞器反应,以决定应激细胞的转归:恢复自稳态和修复损伤,或损伤加重乃至死亡.
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蛋白质转导技术及其应用
蛋白质转导结构域(protein transduction domain, PTD)是指一类能将其他生物大分子导入多种哺乳动物细胞的小分子阳离子多肽,它可以用于研究细胞内某些蛋白质的功能,还可以与具有治疗作用的蛋白质、多肽等生物大分子偶联,在缺血、肿瘤等多种疾病的治疗中有潜在的应用价值.
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人膀胱癌相关蛋白基因及其编码蛋白质的结构及功能预测
目的:预测人宫颈癌候选抑癌基因--膀胱癌相关蛋白(BLCAP)基因及其编码蛋白质的结构及功能.方法:将克隆有全长BLCAP基因的pLXSN-BLCAP质粒测序后,采用生物信息学的方法对其在核酸及氨基酸水平上进行分析,并对其编码的蛋白质的功能做了初步预测.结果:发现了几条与BLCAP基因同源性较高的基因:Homo sapiens mRNA(DKFZp564M053),BC-10基因等,它们与BLCAP基因的序列相似性分别为:99%和87%,而且不同种属间BLCAP基因较为保守.BLCAP基因编码的87个氨基酸中亮氨酸(19.5%)、脯氨酸(9.19%)、丝氨酸(8.04%)、半胱氨酸(8.04%)含量较高,对其二级结构的分析发现BLCAP基因编码蛋白N端以螺旋结构为主,C端以折叠结构为主,亲水性较高,而中间区域则以无规则卷曲为主,疏水性较高.在其45aa~65aa处存在一个跨膜区,在59aa~66aa处可能存在一个裂解位点,在68位的Tyr,73位和78位的Ser存在着3个可能的磷酸化位点,且在78aa~81aa处发现一个典型的[ST]-X(2)-[DE]结构,即酪氨酸蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点.结论:初步预测BLCAP基因为一个调节细胞生长的看家基因,其编码的蛋白质为一个Ⅰ型跨膜蛋白,且其酪氨酸蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点可能与BLCAP蛋白功能活化有关.
关键词: 人膀胱癌相关蛋白基因 生物信息学 蛋白质结构 蛋白质功能 预测宫颈癌