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全基因组荟萃分析文献资料
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强直性脊柱炎家系全基因组扫描基因定位的荟萃分析
目的 综合分析强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)家系的全基因组扫描基因定位的结果,探讨进一步研究和确定AS的遗传易感位点的思路和方法.方法 采用基因组寻证荟萃分析(genome search meta analysis,GSMA)法,对符合该方法分析的4个AS家系的全基因组扫描结果包括参数连锁分析和非参数连锁分析的结果进行分析.根据连锁分析的大值被赋值并按降序排列,从而计算出总的等级分值(Rsumrnk).根据每个研究的受累个体数进行加权GSMA对结果进行修正.本研究共有479个家系,1151例AS患者.总的等级分析概率(Psumrnk)和有序的等级分析概率(Pord)＜0.05被认为可能含有易感区域;GSMA Psumrnk＜0.000417时,被认为在全基因组连锁中有显著意义.结果 GSMA显示10组结果的Psumrnk和Pord均小于0.05,表明这些组内可能含有AS的易感基因位点,这些组分别是6.2、16.3、6.1、3.3、6.3、16.4、10.5、17.1、2.5、2.9.GSMA生成的具有显著意义的全基因组连锁分析的证据位于6p22.3-p21.1(BIN6.2,Psumrnk＜0.000417),包含HLA位点.结论 本GSMA研究进一步证实了HLA位点是AS的主要易感区域,并初步提供非HLA区域包括16 q,3 p,10 q,2 p,17 p和2 q证据.
