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含当归中成药的DNA提取及其分子鉴定
目的:优化含当归中成药的DNA提取方法,并利用叶绿体trnL-F基因及当归特异分子标记对当归中成药进行鉴定.方法:采用传统十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法,十二烷基磺酸钠(SDS)法,磁珠法以及改良CTAB法对10种含有当归成分的中成药进行DNA提取,利用微量紫外分光光度法、琼脂糖凝胶电泳检测所得总DNA的完整性、纯度和浓度.对10份当归中成药的trnL-F序列进行扩增、测序,对序列进行比对分析并构建系统发育树.利用当归特异鉴别分子标记对10种当归中成药中的当归成分进行分子鉴别.结果:利用改良CTAB法获得了纯度较高,质量较好的DNA.10种中成药中当归的trnL-F序列与正品当归序列相似度为99.88%~100%,系统发育树显示10份中成药中的当归与正品当归聚为一类.利用当归特异性鉴别分子标记进行验证,10种中成药DNA样品均能得到明亮的扩增条带.结论:改良CTAB法可以有效提取当归中成药中的基因组DNA.利用trnL-F序列和当归特异性鉴别分子标记,成功对10份市售当归中成药进行了分子鉴别,为当归类中成药的分子鉴定奠定了基础.
关键词: 当归中成药 DNA提取方法 叶绿体trnL-F序列 特异性鉴别分子标记 分子鉴定 -
基于叶绿体trnL-F和rpoC1序列对当归及其混伪品的分子鉴定研究
目的 研究叶绿体trnL-F和rpoC1基因序列在当归及其混伪品间的分子鉴定作用,建立其分子鉴别方法.方法 对25份当归及其混伪品材料的trnL-F和rpoC1序列进行扩增、测序.对序列进行比对、分析,计算材料间的遗传距离并构建系统进化树.结果 trnL-F序列在长度变化范围,变异位点和信息位点个数及遗传距离变异幅度上均大于rpoC1序列.trnL-F序列数据显示,当归及其混伪品材料具有显著碱基差别,具有1个特异鉴别SNP位点和1个A碱基重复的特异鉴别区域.当归与混伪品间遗传距离在0.002 ~0.231之间.通过trnL-F序列重建的系统发育树能将当归与混伪品有效地区分开.rpoC1序列比对结果无法找出当归及其混伪品间的差异位点,同时其构建系统进化树也无法区别当归及其混伪品.结论 rpoC1序列对当归及其混伪品间的鉴别作用不佳,而trnL-F序列能成功鉴定当归及其混伪品,可作为当归及混伪品的分子鉴定方法.
关键词: 当归 叶绿体trnL-F序列 叶绿体rpoC1序列 分子鉴定