首页 > 文献资料
-
川芎嗪酯类衍生物的3D-QSAR研究
目的 建立预测模型,进行合理的药物设计和修饰.方法 应用构象系统搜索程序确定23个2-取代酰氧甲基-3,5,6-三甲基吡嗪衍生物的可能活性构象,并以此活性构象为模板构建了这23个小分子化合物的三维结构,采用CoMFA及CoMSIA法对衍生物进行系统的三维定量构效关系分析.结果与结论 CoMFA模型交叉验证系数q2=0.694,回归系数R2=0.994,SEE=0.023,F=376.924.CoMSIA模型交叉验证系数q2=0.657,回归系数R2=0.987,SEE=0.034,F=166.815.两种方法得到的构效关系模型都具有较好的预测能力.通过分析分子场等值面图在空间的分布,可以观察到叠合分子周围分子场特征对化合物活性的影响,为该类化合物进一步结构优化提供了有价值的参考.
-
3-哌啶甲酸和四氢烟酸的4,4-二芳基-3-丁烯衍生物的三维定量构效关系(比较分子力场分析)研究
目的研究3-哌啶甲酸和四氢烟酸的4,4-二芳基-3-丁烯衍生物结构和对γ-氨基丁酸摄取抑制活性之间的关系.方法使用三维定量构效关系(3D-QSAR)--比较分子场分析(CoMFA)方法进行构效关系研究.结果交叉验证系数q2和非交叉验证系数r2分别为0.726和0.986,方差比F为117.562,标准估计误差(SEE)为0.062.结论这些数值表明所得的CoMFA模型有实际意义,并且对3-哌啶甲酸和四氢烟酸的4,4-二芳基-3-丁烯衍生物抑制活性具有较好的预测能力.
-
人类A3腺苷受体配基稠合1,2,4-三唑并[1,5-c]嘧啶衍生物的3D-QSAR研究
目的建立人类A3腺苷受体配基稠合1,2,4-三唑并[1,5-c]嘧啶衍生物的三维定量构效关系,为设计高活性的该类化合物提供依据.方法利用比较分子场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)建立39个该类化合物的三维定量构效关系模型.结果CoMFA和CoMSIA模型均有良好的预测能力,但CoMSIA模型包含的力场较全面,给出信息更丰富.结论CoMSIA模型可为该系列化合物的进一步结构改造提供指导.
-
EB病毒表位肽三维定量构效关系的建模与初步分析
目的 建立EBV抗原表位的三维定量构效关系模型,为表位的设计与改造提供理论基础.方法 从表位数据库中收集67条EBV表位抗原,采用比较分子场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)方法研究EBV抗原表位平衡解离常数(KD)和半数抑制浓度(IC50)的三维定量构效关系(3D-QSAR),并建立了相应的3D-QSAR模型.结果 使用CoMFA与CoMSIA方法针对KD和IC50所建立的3D-QSAR模型均有良好的预测能力,定量预测模型的复相关系数:KD (CoMFA:Q2=0.731,R2=0.996;CoMSIA:Q2=0.723,R2=0.979),IC50(CoMFA:Q2=0.463,R2=0.992;CoMSIA:Q2=0.485,R2=0.998).结论 3D-QSAR建模方法具有较强的稳定性和较好的预测能力,而且能够通过等值面图为EBV表位的设计提供可视化信息,为进一步的抗肿瘤多肽疫苗开发提供指导.
关键词: 抗原表位 比较分子场分析 比较分子相似性指数分析 三维定量构效关系