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黑龙江省甲型H1N1流感病毒HA基因特性分析

舒畅;许军;王开利;杨明;华华;苏扬

摘要: 目的 测定流感病毒HA基因序列,从分子水平分析黑龙江省第1例甲型H1N1流感死亡病例病毒株以及2例2011年甲型H1N1流感病毒株HA基因的特点.方法 采用MDCK细胞和Real-time PCR方法对甲型H1N1流感病毒HA基因片段进行分离、鉴定,并进行核苷酸序列测定和分析.结果 将3例标本序列拼接后分别截取开放读码框内核苷酸同甲型H1N1代表株进行系统进化分析和同源性分析,结果显示新甲型H1N1流感病毒HA蛋白氨基酸与WHO推荐的疫苗株A/California/07/2009(H1N1)及中国的代表株A/Sichuan/ 1/2009 (H1N1)亲缘关系近,聚在一个分支上,同源性也较高,为98.6%~ 99.1%.结论 目前的新甲型H1N1流感病毒的HA蛋白变异还很小,但应密切关注该病毒的变异情况.

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