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一个遗传性出血性毛细血管扩张症家系的基因分析
目的 研究一个遗传性出血性毛细血管扩张症(HHT)家系的ENG、ACVRL1、SMAD4基因突变情况,探讨其分子发病机制.方法 对1例HHT患者进行临床诊断和家系调查.采集先证者及其长子外周血标本,应用芯片捕获高通量测序法进行ENG、ACVRL1、SMAD4基因分析,对检出的突变以Sanger测序法进行验证.结果 71名家系成员中有9名被临床诊断为HHT,均以反复鼻腔出血为主要表现.基因分析结果显示,先证者及其长子ENG基因9号外显子存在框移突变c.1502-1503insGG (p.Gly501GlyfsX 18),未检出ACVRL1、SMAD4基因突变.结论 ENG基因框移突变c.1502-1503insGG(p.Gly501GlyfsX18)是这个HHT家系致病的遗传学基础.
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结节性硬化症的两个TSC2基因新发框移突变
该研究采用高通量测序对两个结节性硬化症(TSC)家系先证者外周血DNA行TSC相关基因(TSC1、TSC2)及其拼接序列检测,确定基因突变位点,针对突变位点设计扩增引物,采用聚合酶链反应和Sanger测序法对先证者及其父母外周血DNA行一代测序验证.两家系先证者分别存在TSC2基因c.3981-3982insA(p.Asp 1327AspfsX87)、c.4013-4014 delCA(p.Ser 1338Cysfs)杂合突变.家系1先证者父母该位点均未见异常;家系2先证者母亲检出TSC2基因c.4013-4014 delCA杂合突变,先证者父亲、先证者外祖父母该位点未见异常.c.3981-3982 insA突变会导致氨基酸序列在第1413位提前终止编码,c.4013-4014 delCA突变导致氨基酸序列在第1412位提前终止编码,二者分别为家系l、家系2的致病突变,且均为新发框移突变,但与疾病的关系仍需要突变蛋白功能细胞模型和动物模型的进一步验证.
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一种人神经母细胞瘤辅酶Ⅱ-依赖性视黄醇脱氢酶cDNA的克隆及特征分析
背景与目的:检测神经母细胞瘤中新的辅酶Ⅱ-依赖性视黄醇脱氢/还原酶[NADP(H)-dependent retinol dehydrogenase/reductase,NRDR]选择性剪接亚型.材料与方法:我们用NRDR特异引物,从人神经母细胞瘤细胞系SK-N-SH和SK-SY-5Y cDNA中分别经PCR扩增出635 bp和429 bp DNA片段,测序证实635 bp片段是NRDR,而429 bp片段是选择性剪接新亚型.再用快速cDNA末端扩增(Rapid amplification of cDNA ends,RACE)方法得到429 bp片段cDNA全长序列.用绿色荧光蛋白与新亚型的融合蛋白做亚细胞定位.结果:得到新亚型全长并命名为human NRDR A2(humNRDRA2)(AY616182).已知NRDR有8个外显子,而新亚型humNRDRA2由选择性剪接造成了第4和第6外显子丢失,从第5外显子开始读码框架前移1 bp,导致随后的编码区框码漂移(frameshift),同时蛋白翻译终止信号提前出现,产生仅有188个氨基酸的蛋白,其中第137氨基酸以后的序列相对于NRDR完全发生改变,同时C-末端的过氧化物酶体定位信号-SRL丢失,却在160～176氨基酸处出现了一个细胞核定位信号.我们在ESTs库中未找到与其相同的剪接形式,提示它可能是神经母细胞瘤特有的一种NRDR剪接亚型.用GFP-NRDRA2融合蛋白做该蛋白的亚细胞定位,发现发绿色荧光的细胞均已悬浮,但悬浮状态不佳,而作为对照的NRDR另一亚型则能定位成功,提示NRDRA2蛋白可能具有一定的细胞毒性.结论:人神经母细胞瘤NRDRA2选择性剪接亚型羧基端框移突变并有核定位序列;该蛋白可能是一种细胞毒性蛋白.
关键词： NADP(H)-依赖的视黄醇脱氢酶 选择性剪接 框移突变
