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蛋白质非标记定量技术文献资料
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非标记定量蛋白质谱分析颅内动脉瘤的特征性蛋白及其生物学功能
目的 从蛋白水平探索颅内动脉瘤(IA)的发展及破裂机制,寻找靶点蛋白.方法 选取3例2015年10月至2016年5月在复旦大学附属华山医院神经外科行动脉瘤夹闭患者的IA标本和3例同期接受经翼点入路手术患者的颞浅动脉(STA)标本.利用非标记定量蛋白质谱技术对6例标本行蛋白组学分析,采用生物信息学筛选差异表达蛋白基因本体(GO)分析对差异表达蛋白进行生物学过程、细胞成分及分子功能分析.行蛋白互作网络分析,应用全基因组及代谢途径数据库(KEGG)对差异表达蛋白行通路分析.结果 共筛选出106种IA标本与STA标本差异表达蛋白,其中差异有统计学意义的共有20种,IA组中下调表达蛋白6种,上调表达蛋白14种.GO分析显示,IA组中差异表达的蛋白主要为促进生物合成的相关蛋白,IA与STA标本中重要的细胞水平结构差异为膜结合细胞器.蛋白互作网络和KEGG通路分析显示,IA组表达上调显著的THBS4蛋白在细胞外基质受体相互作用中起重要作用,下调表达显著的PTGS1蛋白在血小板激活中起重要作用.结论 采用非标记定量蛋白质谱分析IA的特征性蛋白及其生物学功能显示,THBS蛋白可能在IA发生的过程中发挥重要作用,有望成为干预IA的新靶点.
关键词： 颅内动脉瘤 蛋白质非标记定量技术 蛋白质组学 计算生物学
