首页 > 文献资料
-
基于RNA-Seq技术的跨种属跨病因肝癌差异表达基因的筛选
目的:运用全转录组测序(RNA sequencing,RNA-Seq)技术和跨种属、跨病因筛选策略,定位出影响肝癌发生发展的关键因子.方法:运用RNA-Seq技术,对人肝癌、癌旁和正常肝组织,以及乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)和黄曲霉毒素B1(aflatoxins,AFB1)诱发的树鼩肝癌、癌旁和正常肝组织标本进行全转录组测序、基因表达水平分析和比较;分别筛选出人肝癌差异表达分子、HBV和AFB1致癌的树鼩肝癌差异表达因子,后定位出跨人和树鼩两个物种、跨HBV和AFB1两种致癌因素的肝癌共同差异表达分子.结果:各标本总RNA提取质量合格,RNA-Seq测序数据质量合格,测序数据与参考基因对比匹配率合格,样品间基因表达相关性合格.人肝癌差异表达基因有68个,其中上调基因14个,下调基因54个;HBV诱发的树鼩肝癌差异表达基因有314个,AFB1诱发的树鼩肝癌差异表达基因有20个,HBV和AFB1诱发的树鼩肝癌共同差异表达基因11个,均为下调基因.人肝癌和树鼩肝癌共同差异表达基因为2个,分别是载脂蛋白F(apolipoprotein F,APOF)和人胰岛素样生长因子酸不稳定亚基(insulin-like growth factor binding protein,acid labile subunit,IGFALS),其mRNA表达水平在肝癌中均下调.结论:运用RNA-Seq技术,跨种属、跨病因筛选肝癌关键基因的研究策略有可能推动肝癌关键基因的定位;APOF和IGFALS有可能是影响肝癌发生发展的重要分子.
-
特发性矮小患儿IGF-1R、IGFALS蛋白的表达
目的 检测特发性矮小患儿血清IGF-IR、IGFALS蛋白的水平,探讨其在特发性矮小(ISS)患儿生长发育中的作用.方法 收集就诊的特发性矮小儿童26例作为实验组(ISS组),抽取10例年龄、性别相匹配的正常身高儿童作为对照组.对他们进行全面的病史采集和体格检查,行生长激素激发试验,检测IGF-1和IGFBP3,并检测血清IGF-1R、IGFALS蛋白表达水平,比较两组中IGF-1R、IGFALS蛋白表达是否有差异,并分析IGF-1R、IGFALS蛋白表达与各项临床指标的相关性. 结果 ①ISS组血清IGF-1R表达水平明显低于对照组,差异具有统计学意义(P＜0.05),ISS组和正常对照组血清IGFALS蛋白水平差异无统计学意义(P≥0.05).②ISS组血清IGFALS蛋白及IGF-1R蛋白表达量均与身高差呈负相关(P＜0.05),IGF-1R蛋白表达与年龄呈正相关(P＜0.05),IGFALS蛋白表达与年龄无相关性(P≥0.05). 结论 ①IGF-1R和IGFALS蛋白表达水平越低可能使ISS患儿身高差更大,患儿越矮小.②IGF-1R缺乏可能是部分特发性矮小患儿的原因.
-
APOF和IGFALS基因在原发性肝癌组织中的表达及临床意义
目的 探讨载脂蛋白F(apolipoprotein F,APOF)和人胰岛素样生长因子酸不稳定亚基(the insulin-like grouth factor binding protein acid labile subunit,IGFALS)在原发性肝癌组织中的表达及临床意义.方法 选取2014年1月1日至2015年12月30日于广西医科大学附属肿瘤医院经手术切除及病理确诊为原发性肝癌88例,实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测88例肝癌组织及其相应癌旁组织和6例正常肝组织中POF基因和IG FA LS基因mRNA的相对表达量,并分析两者表达与肝癌患者临床病理特征的关系.结果 肝癌组织中APOF mRNA相对表达量低于癌旁组织和正常肝组织(0.156±0.019 vs 0.971±0.010,P＜0.001;0.156±0.019vs 81.140±0.092,P＜0.001);肝癌组织中IGFALS mRNA相对表达量亦低于癌旁组织及正常肝组织(0.111±0.016 vs 1.090±0.054,P＜0.001;0.111±0.016 vs 1.101±0.211,P＜0.001).APOF mRNA表达与门静脉侵犯相关(P=O.004);IGFALS mRNA表达与肿瘤分化程度、门静脉侵犯相关(P＜0.05).APOF mRNA表达水平与IGFALS mRNA表达水平呈正相关(r=0.332,P＜0.01).结论 APOF和IGFALS基因在肝癌组织中表达下调,二者表达呈正相关,且与门静脉侵犯有关,可能参与了肝癌的发生发展.
关键词： 肝肿瘤 载脂蛋白F 胰岛素样生长因子酸不稳定亚基 实时荧光定量PCR 基因表达
