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蛋白指纹图谱技术临床应用前景看好
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新疆维吾尔族肾癌血清蛋白指纹图谱的建立
目的 筛选并建立新疆维吾尔族肾癌血清蛋白指纹图谱诊断模型. 方法 采用弱阳离子交换蛋白质芯片(CM10蛋白芯片)及表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术对45例维吾尔族肾癌患者和45例正常对照者血清指纹图谱进行检测,结果用ZUCI-蛋白芯片数据分析系统软件包进行分析,通过支持向量机运算建立区分肾癌蛋白指纹图谱诊断模型,留一法交叉验证作用评估模型,判别效果. 结果 两组血清中筛选出M/Z为4296、4305、5914、5935、6116、6887、8085、8142、8573共9个差异有统计学意义(P＜0.05)的标志蛋白,所建立的诊断模型诊断肾癌的灵敏性为100％ (45/45),特异性为91％ (41/45).进一步用50例未知血清标本盲法测试该模型,双盲验证后的灵敏性和特异性分别为93％ (28/30)和85％ (17/20). 结论 SELDI-TOF-MS结合支持向量机建立维吾尔族肾癌血清蛋白质指纹图谱模型具有较高的敏感性与特异性,值得进一步研究和应用.
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胶质瘤脑脊液蛋白指纹图质谱仪分析及其在临床诊断中的应用
目的建立区分胶质瘤和非肿瘤脑脊液的蛋白指纹图诊断模型,利用蛋白组学技术寻找新的肿瘤标志物.方法收集胶质瘤和轻中度脑外伤病人(共46份)的脑脊液,利用表面加强解析/电离吸收-时间飞行质谱(surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)检测蛋白芯片,得出蛋白指纹图,将46份标本随机分为训练组30例(12例胶质瘤,18例脑外伤)和盲法测试组16例(7例胶质瘤,9例脑外伤),运用Ciphergen公司提供的BiomarkerPatternsTMSoftware(一种决策树软件)分析收集的数据.结果(1)得到胶质瘤与非肿瘤的蛋白指纹图;(2)利用训练集得出基于决策树的脑脊液蛋白模型,测试集盲法检测,胶质瘤诊断的敏感性和特异性分别为100%(8/8)和88.9%(8/9).结论建立了胶质瘤的脑脊液蛋白指纹图谱,为以后的胶质瘤蛋白质组学研究奠定了一定基础;建立了区分胶质瘤与非肿瘤的脑脊液蛋白表达质谱诊断模型,盲法检验敏感性和特异性达到100%和88.9%,为胶质瘤的临床诊断提供了一条崭新的途径和方法.
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胆道闭锁血清蛋白质标记物的检测
目的 寻找特异性诊断胆道闭锁的血清蛋白标记物.方法 应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测28例血清标本(胆道闭锁7例,先天性胆总管囊肿7例,婴肝综合征3例,正常对照11例)的蛋白质质谱表达,结合生物信息学方法(SVM)分析数据.结果 筛选出m/z位于3403、2108、2111、2131、2823的5个蛋白质标记物区分肝胆疾病和正常对照小儿的血清蛋白指纹图谱模型,敏感性94.1%,特异性81.8%;筛选出m/z位于3403蛋白质标记物区分胆道闭锁和正常对照小儿的血清蛋白指纹图谱模型,敏感性100%,特异性100%;筛选出m/z位于3403、4796的2个蛋白质标记物区分胆道闭锁和其他肝胆疾病的血清蛋白指纹图谱模型,敏感性71.4%,特异性80.0%.结论 应用SELDI-TOF-MS结合SVM构建的胆道闭锁血清蛋白指纹图谱模型为胆道闭锁的早期诊断方法开拓了新方向,值得进一步研究.
