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前-X序列文献资料
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乙型肝炎病毒基因组前-前-S和前-X区基因分布的研究
目的研究不同基因型乙型肝炎病毒(HBV)前-前-S和前-X区核苷酸和氨基酸序列分布. 方法应用DNAstar软件中的MegAlign程序分析GenBank登记的35株和3株由本室测定的不同基因型HBV全序列中前-前-S和前-X区基因分布情况,并用Blast软件对GenBank中598株HBV全基因组序列进行前-前-S和前-X区的核苷酸和氨基酸相似性分析. 结果除D基因型外,在各型HBV基因组中均存在前-前-S区核苷酸序列,但仅在C、F和H型HBV基因组中存在前-前-S区开放读码框架(ORF).但前-X区核苷酸序列及其ORF仅见于C基因型HBV.在GenBank登记的598株不同基因型HBV中,与推导的前-前-S区相似氨基酸序列有36株,而与推导的前-X区相似的氨基酸序列有47株. 结论前-前-S区序列存在于除D基因型以外的所有HBV基因型,而前-X区基因仅存在于C基因型HBV基因组中.
