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克里米亚刚果出血热病毒文献资料
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新疆地区克里米亚刚果出血热病毒M片段的遗传分析
目的 为进一步了解克里米亚刚果出血热病毒(CCHFV)M基因的特征,对新疆地区4株克里米亚刚果出血热病毒分离株亚东璃眼蜱的部分M片段核苷酸序列进行测定及分析.方法 从感染CCHF病毒的鼠脑中提取RNA,应用逆转录聚合酶链反应扩增,测定CCHF病毒的部分M片段核苷酸序列,与GenBank中的已登录的部分CCHF病毒M基因的同源序列进行比较分析和种系进化分析.结果 经测序得到了4株病毒的3962～4385 nt位点的424bp核苷酸序列(位点依据IbAr10200的M基因序列),该序列共编码139个氨基酸.前3株病毒序列有相当高的核苷酸同源性(99.5%～99.8%),将所得到的序列与已发表的中国、尼日利亚、巴基斯坦、乌兹别克斯坦、塔吉克斯坦和俄罗斯病毒株相比,中国株之间的核苷酸同源性为78.1%～99.8%,而非中国株则为42.9%～94.8%.但它们所编码的氨基酸序列变异不大,同源性非常高.系统发生树表明,所有的毒株被分为5个进化支(所比较的M基因长度为3962～4385 nt核苷酸),来自新疆南部和东部的YT05099、YL04041和YL05035共处于同一分支.结论 相比于新疆其他分离株,YT05099、YL04041和YL05035的部分M基因特征有极高的相似性.新疆株CCHF病毒M基因与中东和远东病毒株之间有较近的亲缘关系.
关键词： 克里米亚刚果出血热病毒 M片段 核苷酸序列 系统发生树
