首页 > 文献资料
-
基于血清蛋白组学的慢性肾衰预测模型探讨
目的 通过比较慢性肾衰(CRF)患者与正常人血清蛋白表达谱的差异,筛选血清蛋白标志物并建立诊断模型,探讨其在慢性肾衰血清学诊断中的意义.方法 收集62例CRF患者和28例正常人的血清,经表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)检验并筛选血清蛋白标志物.经生物信息学分析建立预测模型并进行验证.结果 在质荷比(m/z)1 500～30 000范围内,检测到51个有效蛋白峰,发现有19个峰有显著差异(P＜0.001),其中18个峰呈低表达,1个峰呈高表达;且CRF组和正常组的聚类性质明显不同;组内样本彼此靠近,组间样本彼此分开.构建的"慢性肾衰组-正常组"诊断决策树模型,预测正确率为87.8%,灵敏度为87.1%,特异度为89.3%.结论 该决策树模型能对慢性肾衰做出较为准确的预测判断,为慢性肾衰的临床早期发现提供一定的实验依据.
-
尿样在SELDI技术中的优化研究
目的:建立表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF/MS)技术检测尿液样本的方法.方法:采用SELDI技术及弱阳离子交换表面蛋白芯片(CM10)对糖尿病病例组和正常对照组的尿液样本进行分析,从尿液标本的采集、样品保存、上样浓度的控制、实验仪器的内外校准、实验结果重复性验证与分析等方面进行实验条件的优化.结果:反复冻融3次以上的样品经SELDI检测的出峰数量和峰强度情况较差；以1∶1或1∶2的浓度作倍比稀释后的样本经芯片检测得到的蛋白峰强度和蛋白数量优；对两组样本重复检测3次,蛋白丰度的平均变异系数(CV值)分别为0.121和0.095；两组样本共检测到202个蛋白峰,其中差异表达蛋白29个,在肝纤维化组中表达上调13个,表达下调16个.结论:初步建立了SELDI技术检测尿液样本的方法,提高了SELDI技术检测尿液样本的质量.
关键词： SELDI-TOF-MS CM10蛋白芯片 肝纤维化组织
