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代谢流量分析文献资料
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基于强连通分量的13C MFA计算模型稳定性判断
基于碳同位素标记实验的代谢通量分析,是代谢工程中一种强大的定量分析工具.13C MFA在进行定量分析时,需要给定代谢网络及其对应的碳原子转移网络,同时为了保证计算的正确性和可靠性,要求所给定的碳原子转移网络中不能含有陷阱(trap).本文基于有向图中强连通分量的概念,给出了trap的一种形式化定义,并利用一种基于深度优先搜索的图论算法,实现了对trap的自动检测.实验结果表明,该算法能够得到正确可靠的结果.
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螺旋霉素生物合成代谢流量分析
通过对螺旋链霉菌的中间代谢产物及有机酸的分析,建立了螺旋霉素生物合成的动态流量分布图,并分析了螺旋霉素生物合成代谢网络的节点.分析认为,大环成环步骤和FO-1步骤在发酵中前期有一定的限速影响;同时由于FO-2、NSP-2有一定的积累,若能减少两者的形成,将对提高发酵效率有积极的意义.摇瓶实验验证了添加葡萄糖对螺旋霉素生物合成代谢网络有影响,发酵效价提高了26.8%.
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次级代谢产物的代谢工程
本文讨论了代谢工程的一些基本概念和基本原理,以及代谢工程原理在次级代谢产物的设计育种中的应用;并结合近年来在代谢工程领域所开展的一些次级代谢产物的育种工作,介绍了抗生素代谢途径分析和修饰的研究进展以及提高抗生素产量和改善菌种生产性能的新思路.
