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柯萨奇病毒A4(CV-A4)文献资料
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2015年烟台地区手足口病监测中柯萨奇病毒A4基因特征分析
研究2015年山东省烟台地区手足口病的病原谱,以及柯萨奇病毒A组4型(Coxsackievirus A4,CV-A4)的分子流行病学.采用实时荧光逆转录聚合酶链反应方法,对2015年烟台地区采集于手足口病患者的696份样品进行总肠道病毒(EV)、柯萨奇病毒A16 (CV-A16)型和肠道病毒A71型(EV-A71)的核酸检测,并对非EV-A71非CV-A16的EV阳性标本,进行CV-A4的核酸检测.对CV A4阳性标本进行病毒分离,对病毒分离阳性的CV-A4标本进行全长VP1区扩增,并进行核苷酸序列测定和分析,然后进行核苷酸/氨基酸相似性分析和系统发育分析.从696份标本中检出肠道病毒阳性标本412份,其中101份为CV A16,76份为EV-A71,16份为CV-A4.9份CV-A4阳性标本成功病毒分离,并进行了全长VP1区核苷酸序列分析,结果表明,其核苷酸相似性为91.04％～100％,氨基酸相似性为95.24％～100％.系统进化分析显示9株CV-A4烟台株均属于G1基因群.与参考株CVA4-High Point-AY421762 genome相比,氨基酸序列的第20、34、102、111、143、184、185、200及304位氨基酸出现突变,本研究的9株分离株的这些位点也有不同,表明烟台地区的CV-A4有其独特的突变位点.CV-A4是引起2015年烟台地区手足口病发病的病原体之一,本次分离到的CV-A4均属于G1基因群进化分支.
关键词： 手足口病(HFMD) 柯萨奇病毒A4(CV-A4) 系统发育
