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4-二磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤藓醇激酶(CMK)文献资料
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樟树4-二磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤藓醇激酶基因的克隆及表达分析
4-二磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤藓醇激酶(4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase,CMK)是植物萜类化合物生物合成途径甲基赤藓醇-4-磷酸途径(methylerythritol-4-phosphate pathway,DXP/MEP)上的第4个关键酶.该研究根据樟树转录组数据,利用RT-PCR(reverse transcription-PCR)方法从药用植物樟树Cinnamomum camphora中克隆得到4-二.磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤藓醇激酶基因,命名为CcCMK1(GeneBank登录号Ku376098),对其序列进行生物信息学分析,结果表明该基因开放阅读框(ORF)为1 212 bp,编码403个氨基酸,推测其相对分子质量为44.46 kDa,等电点(theoretical pI)为4.99.跨膜结构分析表明CMK蛋白不存在跨膜结构.信号肽分析表明其为非分泌蛋白,不存在信号肽.亚细胞定位表明其定位于叶绿体中.利用荧光实时PCR检测了龙脑樟、油樟、芳樟、脑樟和异樟5种化学型樟树中CcCMK1基因的表达量,结果表明CcCMK1基因在油樟中的表达量高,龙脑樟中表达量低,为樟树萜类化合物生物合成途径关键酶基因元件挖掘提供研究基础.
