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麦冬不同种群遗传多样性的RSAP分析
利用RSAP标记技术对120份不同地理来源的麦冬种质资源进行多样性分析,结果表明:筛选出的16对引物组合共扩增出326条带,其中318条多态性条带,多态性比率为97.55％,多态性含量PIC在0.87 ～0.95,平均0.92,表明试供材料间在分子水平上具有丰富的遗传多样性.种群遗传多样性结果表明,20个种群多态性位点比例(PPL)为19.94％ ～85.58％,Nei's基因多样性指数(H)和Shannon信息指数(I)分别在0.082 6 ～0.210 7,0.120 6 ～0.328 1,其中浙麦冬遗传多样性高,矮小山麦冬遗传多样性低.种群遗传距离在0.024 6 ～0.286 8,浙江山麦冬和浙江阔叶山麦冬遗传距离小,福建短葶山麦冬和沿阶草遗传距离大.20个自然种群间基因分化系数(Gst)为0.430 7,种群间遗传变异占总遗传变异的43.07％,种群内变异为56.93％,基因流(Nm)为0.660 9.UPMGA聚类分析与主坐标分析结果基本一致,120份样本被分成四大类,聚类结果与形态分类基本一致,同时与地理来源也有很高的的一致性.
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不同来源丹参种质遗传多样性的SRAP标记分析
目的 解决丹参育种工作中的丹参种质资源的鉴别与分类.方法 利用SRAP分子标记技术对48个不同来源的丹参种质进行了遗传多态性的分析,并对其进行了类群的划分.结果 利用筛选到的15对SRAP引物组合从材料中检测到了120个等位位点.利用不加权成对群算术平均法(UPGMA)对丹参种质进行聚类分析可以将其分为两大类群,每一类群包含3个亚群.结论 不同丹参种群间遗传距离与空间距离之间的关系较为复杂,不同地区间丹参种质的遗传分化不均衡.随着丹参种质驯化程度的增加,种质问的遗传距离有所增加.
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基于CDDP标记铁皮石斛抗性种质筛选与多样性研究
目的 利用CDDP标记技术对43份铁皮石斛Dendrobium officinale野生和栽培种质进行初步抗性筛选和遗传多样性分析,为铁皮石斛产业以及优良品种筛选保护提供理论基础.方法 从21条CDDP引物中筛选出产物清晰、多态性好的引物对供试材料基因组DNA进行扩增.结果 16条引物共扩增出了151条带,其中多态性条带144条,多态性比率95.7％,表明供试材料具有丰富的遗传多样性.种群遗传多样性结果表明,3个种群多态性位点比例(PPL)为65.56％～82.12％,种群间基因分化系数(Gst)为0.110 2,基因流(Nm)为4.035 4,说明人为选择亦可能促进铁皮石斛的遗传多样性.结论 铁皮石斛人工栽培种具有丰富的遗传多样性,同时统计结果分析表明,43份材料中可以初步筛选出8份具有潜在优良抗性的植株.
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广西莪术EST-SSR标记开发及其在遗传多样性分析中的应用
目的:分析姜黄表达序列标签(EST)中简单重复序列(SSR)位点的分布特点,开发近缘种广西莪术EST-SSR引物,探讨EST-SSR用于进行广西莪术遗传多样性分析及分子育种的可行性.方法:下载NCBI中公布的姜黄EST 12 678条,利用SSR-FINDER搜索SSR位点,筛选符合条件的序列,采用Primer 5.0设计SSR引物,挑选30个表现型差异较大的广西莪术种质进行引物有效性及多态性检测,对50份广西莪术种质进行遗传多样性分析.结果:12 678条EST序列含有SSR位点1 243个,其中二核苷酸出现频率为50.36％,三核苷酸31.54％,四核苷酸10.30％,以AT/TA和CT/GA出现频率高.利用Primer 5.0设计引物共325对,聚合酶链式反应(PCR)检测表明,104对引物可以扩增出理想PCR产物,在至少30份不同种质广西莪术中检测到48对SSR引物具有多态性,占设计引物的38.09％.遗传多样性分析研究,聚类分析结果表明50份广西莪术种质在相关系数0.7处,聚类为2类,遗传相似性系数变化范围较窄.结论:姜黄EST资源中含有高频率的SSR位点,且EST-SSR标记开发效率较高.本研究开发了48对广西莪术EST-SSR标记,并筛选出富含SSR位点的候选序列,用聚类图验证了植物之间的亲缘关系,为广西莪术遗传多样性分析和分子育种研究提供参考.
